New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3098359 | 46 (0.760) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 6.4% | coding (723/798 nt) | PP_2707 | exodeoxyribonuclease III |
? | NC_002947 | = 3098385 | 44 (0.770) | coding (749/798 nt) | PP_2707 | exodeoxyribonuclease III |
TACGCCATCTGTACCCGGACGAGCGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCATTCA > NC_002947/3098211‑3098502 | tACTCCATCTGTACCCGGACGATCGTGTCTACACCTTGTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGG < 8:169610‑M1/149‑1 (MQ=255) tACGCCATCTGTACCCGGACGAGCGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGG < 3:266163‑M1/149‑1 (MQ=255) tACGCCATCTGCTCCCGGACGAGGGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTTTTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGCGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGG < 1:320977‑M1/149‑1 (MQ=255) ccATCTGTACCCGGACGAGCGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTgc < 1:3218/149‑1 (MQ=255) cATCTGTACCCGGACGAGCGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGtcgct > 8:310401‑M1/1‑144 (MQ=255) gTACCCGGACGAGCGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAAc > 6:243850/1‑148 (MQ=255) tACCCGGACGAGCGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAAc > 8:75249/1‑147 (MQ=255) ccGGACGAGCGTGTCTACACCTTCTGGGTACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCagg > 1:23368/1‑149 (MQ=255) ccGGACGAGCGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCaggc > 1:173648/1‑149 (MQ=255) cGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAg < 5:243850/149‑1 (MQ=255) gtgtCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGc < 3:283034/149‑1 (MQ=255) acCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGAccatgc < 7:279414‑M2/149‑7 (MQ=255) cTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGtcgctggccttggcctggttgcgcacccatgcat < 7:310401‑M1/149‑35 (MQ=255) g‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCCGGCCAAGGCCCGCGACCATGCGCCCGTCTg > 8:1674/1‑149 (MQ=255) cTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGa < 5:297577/149‑1 (MQ=255) tATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGAt > 7:100291/1‑149 (MQ=255) ttCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGa < 8:119532/148‑1 (MQ=255) tAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTgg > 6:16793/1‑149 (MQ=255) tAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTgg < 5:112254/149‑1 (MQ=255) tAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTCCGCACCCAGGCCAAGTCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTgg > 3:23764/1‑149 (MQ=255) aaCCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTggg > 2:248158/1‑149 (MQ=255) ccACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGt > 7:250556/1‑132 (MQ=255) ccACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGt < 8:250556/132‑1 (MQ=255) cACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTAc > 3:234783/1‑149 (MQ=255) aCTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGtcgctggccttggcctggttgcgcacccatgca > 1:45438‑M1/1‑93 (MQ=255) aCTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGtcgctggccttggcctggttgcgcacccatgca < 2:45438‑M1/125‑34 (MQ=255) accGCAAAGCCGGGTAGCGAATCGAT‑CACCTGTAGCTCAATCGCGAGCATGAGCCTTATCTGAAACGTGCGGCTGTCGATGCATGGGAGCGCAACCAGGCCAAGGCAAGCGCCCATCAGCACGTCTCGATCGAGCTGGGTACGcgtcgt > 2:310869/2‑149 (MQ=255) gCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCt > 2:24376/1‑149 (MQ=255) gCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCt < 7:75249/149‑1 (MQ=255) aaTGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCg < 2:23368/149‑1 (MQ=255) ttGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTc < 2:173648/149‑1 (MQ=255) gAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGca > 7:354926/1‑149 (MQ=255) t‑CACGTGTTGCTCTATCGCGAGCTTGGGCCTTATCTGAAAGGGGCGGGTGTGCATGCATGTGTGCGCAACGAGGCCTAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGcac < 1:310869/148‑1 (MQ=255) gCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAg < 8:100291/148‑1 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGTGAGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGACATCGACCATGAGCCCGTATGTATCGAGCTGGGTAAGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAgcgc > 1:237948/1‑149 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATa > 2:23968/1‑124 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAgcgc > 1:225316/1‑149 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTCAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAgcgc > 2:255916/1‑149 (MQ=255) tCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCggg > 6:327168/1‑149 (MQ=255) gAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCt > 3:224800/1‑147 (MQ=255) gAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGa < 2:225316/149‑1 (MQ=255) gCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAgg < 1:248158/149‑1 (MQ=255) ttGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAg > 1:174528/1‑146 (MQ=255) ttGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAg < 2:174528/146‑1 (MQ=255) gcgcCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGgcgc < 5:327168/148‑1 (MQ=255) gcCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTcc > 6:54195/1‑149 (MQ=255) gcCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTcc < 4:234783/149‑1 (MQ=255) aTCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACa < 8:279414/148‑1 (MQ=255) cgggTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCACCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCa < 1:255916/149‑1 (MQ=255) ggTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGa < 5:16793/149‑1 (MQ=255) gATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGGGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCAt > 2:12171/1‑149 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGAccatgcatcgacacccgcccgtttcagataaggcgcaagctcgcgattgagcaacaggtgatcgattcgcaacccggcattgcgggcccagtggttacgaaaatagtcccagaag < 7:310401‑M2/149‑116 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGgc < 1:376096/118‑1 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGgc > 2:376096/1‑118 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCAtt < 4:224800/149‑1 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCAtt > 7:66968/1‑149 (MQ=255) tGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGAccatgcatcgacacccgcccgtttcagataaggcgcaagctcgcgattgagcaacaggtggatcgattcgcaacccggcattgcgggcccagt > 1:45438‑M2/1‑33 (MQ=255) tGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGAccatgcatcgacacccgcccgtttcagataaggcgcaagctcgcgattgagcaacaggtgatcgattcgcaacccggcattgcgggcccagt < 2:45438‑M2/125‑93 (MQ=255) gCATGGtcgctggccttggcctggttgcgcacccatgcatcgacacccgcccgtttcagataaggcgcaagctcgcgattgagcaacaggtgatcgattcgcaacccggcattgcgggcccagtggttacgaaaatagtcccagaaggt < 7:279414‑M1/149‑144 (MQ=255) aTGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGc < 8:242971/128‑1 (MQ=255) aTGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGc > 7:242971/1‑128 (MQ=255) | TACGCCATCTGTACCCGGACGAGCGTGTCTACACCTTCTGGG‑ACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGAT‑CACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCTCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCATTCA > NC_002947/3098211‑3098502 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |