New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3098359 | 46 (0.760) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 6.4% | coding (723/798 nt) | PP_2707 | exodeoxyribonuclease III |
? | NC_002947 | = 3098385 | 44 (0.770) | coding (749/798 nt) | PP_2707 | exodeoxyribonuclease III |
ACCTTCTGGGACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCATTCAGATTCGGCCCCGATAATTCCCTCCGT > NC_002947/3098243‑3098528 | acCTTCTGGGACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGAccatgc < 7:279414‑M2/149‑7 (MQ=255) gACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCCGGCCAAGGCCCGCGACCATGCGCCCGTCTg > 8:1674/1‑149 (MQ=255) cTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGa < 5:297577/149‑1 (MQ=255) tATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGAt > 7:100291/1‑149 (MQ=255) ttCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGa < 8:119532/148‑1 (MQ=255) tAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTgg > 6:16793/1‑149 (MQ=255) tAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTgg < 5:112254/149‑1 (MQ=255) tAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTCCGCACCCAGGCCAAGTCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTgg > 3:23764/1‑149 (MQ=255) aaCCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTggg > 2:248158/1‑149 (MQ=255) ccACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGt < 8:250556/132‑1 (MQ=255) ccACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGt > 7:250556/1‑132 (MQ=255) cACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTAc > 3:234783/1‑149 (MQ=255) accGCAAAGCCGGGTAGCGAATCGATCACCTGTAGCTCAATCGCGAGCATGAGCCTTATCTGAAACGTGCGGCTGTCGATGCATGGGAGCGCAACCAGGCCAAGGCAAGCGCCCATCAGCACGTCTCGATCGAGCTGGGTACGcgtcgt > 2:310869/2‑149 (MQ=255) gCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑t < 7:75249/149‑1 (MQ=255) gCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑t > 2:24376/1‑149 (MQ=255) aaTGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCg < 2:23368/149‑1 (MQ=255) ttGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTc < 2:173648/149‑1 (MQ=255) gATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGca > 7:354926/1‑149 (MQ=255) tCACGTGTTGCTCTATCGCGAGCTTGGGCCTTATCTGAAAGGGGCGGGTGTGCATGCATGTGTGCGCAACGAGGCCTAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGcac < 1:310869/148‑1 (MQ=255) gCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAg < 8:100291/148‑1 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGTGAGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGACATCGACCATGAGCCCGTATGTATCGAGCTGGGTAAGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAgcgc > 1:237948/1‑149 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATa > 2:23968/1‑124 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAgcgc > 1:225316/1‑149 (MQ=255) tCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTCAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAgcgc > 2:255916/1‑149 (MQ=255) tCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCggg > 6:327168/1‑149 (MQ=255) gAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCt > 3:224800/1‑147 (MQ=255) gAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGa < 2:225316/149‑1 (MQ=255) gCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAgg < 1:248158/149‑1 (MQ=255) ttGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAg > 1:174528/1‑146 (MQ=255) ttGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAg < 2:174528/146‑1 (MQ=255) gcgcCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGgcgc < 5:327168/148‑1 (MQ=255) gcCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTcc < 4:234783/149‑1 (MQ=255) gcCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTcc > 6:54195/1‑149 (MQ=255) aTCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACa < 8:279414/148‑1 (MQ=255) cgggTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCACCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCa < 1:255916/149‑1 (MQ=255) ggTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGa < 5:16793/149‑1 (MQ=255) gATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGGGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCAt > 2:12171/1‑149 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGAccatgcatcgacacccgcccgtttcagataaggcgcaagctcgcgattgagcaacaggtgatcgattcgcaacccggcattgcgggcccagtggttacgaaaatagtcccagaag < 7:310401‑M2/149‑116 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGgc > 2:376096/1‑118 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGgc < 1:376096/118‑1 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCAtt < 4:224800/149‑1 (MQ=255) aTGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCAtt > 7:66968/1‑149 (MQ=255) tGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGAccatgcatcgacacccgcccgtttcagataaggcgcaagctcgcgattgagcaacaggtggatcgattcgcaacccggcattgcgggcccagt > 1:45438‑M2/1‑33 (MQ=255) tGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGAccatgcatcgacacccgcccgtttcagataaggcgcaagctcgcgattgagcaacaggtgatcgattcgcaacccggcattgcgggcccagt < 2:45438‑M2/125‑93 (MQ=255) aTGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGc > 7:242971/1‑128 (MQ=255) aTGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGc < 8:242971/128‑1 (MQ=255) caaggccaGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACAt > 4:292354/1‑75 (MQ=255) caaggccaGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACAt < 3:292354/75‑1 (MQ=255) aGCGAccatgcatcgacacccgcccgtttcagataaggcgcaagctcgcgattgagcaacaggtgatcgattcgcaacccggcattgcgggcccagtggttacgaaaatagtcccagaaggtgtagacacgctcgtccgggtacagatg > 8:310401‑M2/1‑5 (MQ=255) aGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGCATCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCATTCAGATTCGGCCCCGATAATTCCCTCCGt > 1:267680/1‑149 (MQ=255) | ACCTTCTGGGACTATTTTCGTAACCACTGGGCCCGCAATGCCGGGTTGCGAATCGATCACCTGTTGCTCAATCGCGAGCTTGCGCCTTATCTGAAACGGGCGGGTGTCGATGCATGGGTGCGCAACCAGGCCAAGGCCAGCGACCATGCGCCCGTCTGGATCGAGCTGGGTACGCGTCGTGC‑TCGGTCATAGTCAGTTCAGCACATGAACGAGCGCCGGGCTGAGGCGCTCCGACAGTAGCCGACTTCAGATTGCATTCAGATTCGGCCCCGATAATTCCCTCCGT > NC_002947/3098243‑3098528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |