New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3857595 | 66 (1.100) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 5.5% | coding (173/231 nt) noncoding (53/224 nt) |
PP_3407 PP_mr41 |
hypothetical protein Cobalamin regulatory region |
? | NC_002947 | = 3857629 | 73 (1.260) | coding (207/231 nt) noncoding (87/224 nt) |
PP_3407 PP_mr41 |
hypothetical protein Cobalamin regulatory region |
CCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTCCTCGCAAGCCCGGA > NC_002947/3857449‑3857743 | cctgcTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGt < 5:237343/148‑1 (MQ=255) ctgctgGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGc < 2:135973/149‑1 (MQ=255) ctgctgGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGc > 2:339544/1‑149 (MQ=255) ctgctgGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGc < 5:208003/149‑1 (MQ=255) agaagaCTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAgg > 7:41692/1‑149 (MQ=255) gaagaCTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGc < 2:227324/149‑1 (MQ=255) agaCTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGcc < 3:17375/148‑1 (MQ=255) ttCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGcattgtccggccctgct > 5:366908‑M1/1‑131 (MQ=255) gCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAgg < 4:71044/149‑1 (MQ=255) gCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAgg > 7:270434/1‑149 (MQ=255) gCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAgg > 3:339266/1‑149 (MQ=255) gAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCg > 4:88655/1‑149 (MQ=255) aGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCgg < 5:65875/149‑1 (MQ=255) gCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTGCTGAAGGGcctgg < 5:138637/149‑4 (MQ=255) ccTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGAc < 7:242825/149‑1 (MQ=255) gTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCAGGACAAt > 4:295892/1‑149 (MQ=255) gTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACTGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGc > 8:55713‑M2/1‑147 (MQ=255) gTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGcc < 3:292233‑M2/149‑3 (MQ=255) tACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGccg < 7:71433‑M2/149‑4 (MQ=255) ttCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGcattgtccggccctgctgaagggcctgggacgcaccggtttccc < 6:366908‑M1/147‑45 (MQ=255) gACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCg > 5:151625/1‑149 (MQ=255) aCAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTCCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGc < 2:9494/149‑1 (MQ=255) gCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAAc < 3:228529/149‑1 (MQ=255) cTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGcattgtccggccctgctgaagggcctgggacgcaccggtttcccgt < 6:151232‑M1/140‑47 (MQ=255) cTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGcattgtccggccctgctgaagggcctgggacgcaccggtttcccgt > 5:151232‑M1/1‑94 (MQ=255) cTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACgg < 8:43793/149‑1 (MQ=255) tCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACgg > 3:282615/1‑148 (MQ=255) aCGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCACGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGc > 6:374207/1‑149 (MQ=255) 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aCGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTa < 4:292233/149‑1 (MQ=255) cAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCAc > 8:99789/1‑149 (MQ=255) aaGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACt > 4:280461/1‑149 (MQ=255) gcccgcccCATGATCTCCTTTTGCCTCGCGTTCAGGTGCCGCTCTGTGGGTGTATCGGGAAAGCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACtgt < 5:44987/149‑1 (MQ=255) ccccATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTc < 6:105440/149‑1 (MQ=255) 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tctcCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGCACg > 7:192535/1‑149 (MQ=255) ccTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGc < 8:34188/148‑1 (MQ=255) cTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCa < 7:99789/148‑1 (MQ=255) ccTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAg > 4:259690/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAg < 8:71433/149‑1 (MQ=255) cTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAgg < 8:41692/149‑1 (MQ=255) cTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAgg < 3:295892/149‑1 (MQ=255) cTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAgg > 8:212730/1‑149 (MQ=255) tCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAGACGGGAAACCGCTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGt > 6:148137/1‑149 (MQ=255) tCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGt > 6:338154/1‑149 (MQ=255) gcgTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGt < 8:270434/147‑1 (MQ=255) gcgTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGa < 5:374207/149‑1 (MQ=255) gcgTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGa > 5:102365/1‑149 (MQ=255) gTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTc > 2:319633/1‑148 (MQ=255) tGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCa < 2:114346/149‑1 (MQ=255) ccccTCAGGGGGTGAAACGGGAATCCGGTGCGTCCGAGGCCGTTCAGCTGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCTACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGAcgc < 8:28153/141‑1 (MQ=255) ccccTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGAcgc > 7:28153/1‑141 (MQ=255) cccTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGccccc < 4:311865/75‑1 (MQ=255) cccTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGccccc > 3:311865/1‑75 (MQ=255) ccTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAg < 4:174943/146‑1 (MQ=255) ccTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAg > 3:174943/1‑146 (MQ=255) cTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGc > 5:34870/1‑149 (MQ=255) cTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGc > 4:288894/1‑149 (MQ=255) tCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGcc > 6:61956/1‑149 (MQ=255) ggTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGctc > 1:7242/1‑149 (MQ=255) aaaCGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTcc < 4:282615/149‑1 (MQ=255) aaaCGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTcc > 3:251624/1‑149 (MQ=255) aaCGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTcc < 4:158480/148‑1 (MQ=255) ctcggAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTCCTc < 1:136568/146‑1 (MQ=255) aCGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGccggtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgaggcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcgag < 6:151232‑M2/140‑95 (MQ=255) aCGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGccggtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgaggcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcgag > 5:151232‑M2/1‑46 (MQ=255) aCGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTCCTc < 3:288894/149‑1 (MQ=255) cGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTCCTCg > 8:54342/1‑149 (MQ=255) cGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCGCGTCCACg > 8:56570/1‑149 (MQ=255) gggAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGccggtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgaggcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcgaggctgtcgaa < 6:366908‑M2/147‑104 (MQ=255) gAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTCCTCGc > 4:142165/1‑147 (MQ=255) aaCCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTCCTCGCAAGc < 1:339544/149‑1 (MQ=255) cGGcattgtccggccctgctgaagggcctgggacgcaccggtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgaggcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcgaggctgtcgaacagcaggta < 7:71433‑M1/149‑147 (MQ=255) ggcattgtccggccctgctgaagggcctgggacgcaccggtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgaggcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcgaggctgtcgaacagcaggtac < 3:292233‑M1/149‑148 (MQ=255) gcattgtccggccctgctgaagggcctgggacgcaccagtttcccgtttcaccccctgaggggcacctgaacgcgaggcataaggagagcatggggcgggcttggcgtcaatgtcatacagcgtgcgaggctgtcgaacagcaggtac > 8:55713‑M1/1‑1 (MQ=255) gTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTCCTCGCAAGCCCGga < 7:284773/149‑1 (MQ=255) | CCTGCTGGAAGAAGACTTCAGGCCTGAGCCTGTCGTACCTGCTGTTCGACAGCCTCGCACGCTGTATGACATTGACGCCAAGCCCGCCCCATGCTCTCCTTATGCCTCGCGTTCAGGTGCCCCTCAGGGGGTGAAACGGGAAACCGGTGCGTCCCAGGCCCTTCAGCAGGGCCGGACAATGCCGGTGCTGCCCCCGCAACGGTAAGCGAGTGAAGCGTCTGTACCACTGTGCCTCGTAGTACGGCATGGGAAGGTGACGCGTTCCAGGAGCCCAGCTCTTCCTCGCAAGCCCGGA > NC_002947/3857449‑3857743 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |