New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3933865 | 68 (1.130) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.9% | coding (1548/1911 nt) | PP_3467 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 3933896 | 61 (1.040) | coding (1517/1911 nt) | PP_3467 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
GCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTG > NC_002947/3933728‑3934011 | gCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGgtcgtc < 8:30250/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGgtcgtc < 1:75812/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGtcgtcg > 5:270094/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGtcgtcg > 8:209497/1‑149 (MQ=255) cgcgGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGtt < 2:223500/149‑1 (MQ=255) cgGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCTACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCa < 2:369909/149‑1 (MQ=255) ggTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCAc < 5:350994/149‑1 (MQ=255) ggTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCAc < 3:265070/149‑1 (MQ=255) tGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACg > 2:309261/1‑148 (MQ=255) ccaccaTTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGgt < 2:337990/129‑1 (MQ=255) ccaccaTTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGgt > 1:337990/1‑129 (MQ=255) caccaTTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCg > 6:276367/1‑149 (MQ=255) ccaTTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCgg > 5:185661/1‑148 (MQ=255) ccaTTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGc < 7:209497/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAggcg < 4:158810‑M2/148‑5 (MQ=255) aGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAg < 8:130408/149‑1 (MQ=255) aCGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGac < 3:85075/148‑1 (MQ=255) ggATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCtgccggccctgcgtgaacgcgacgacctggcggcgatcat > 3:227869‑M1/1‑104 (MQ=255) ggATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCtgccggccctgcgtgaacgcgacgacctggcggcgatcat < 4:227869‑M1/144‑41 (MQ=255) ggATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGacaca > 1:238276/1‑149 (MQ=255) ggATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGacaca < 3:158810/149‑1 (MQ=255) tGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCg > 3:246386/1‑149 (MQ=255) gttgctCGAAGGCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCgg > 1:345580/6‑149 (MQ=255) gCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCgg < 4:242383/149‑1 (MQ=255) cAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCgg > 1:791/1‑147 (MQ=255) cGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACTCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGaa > 4:268210/1‑148 (MQ=255) cGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAAc < 3:296904/149‑1 (MQ=255) aaGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAg > 1:169918/1‑149 (MQ=255) gCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCATGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGt < 8:16751/149‑1 (MQ=255) ttCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCtgccggccctgcgtgaacgcgacgacctggcggcgatcatcca > 5:236864‑M1/1‑79 (MQ=255) ttCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCtgccggccctgcgtgaacgcgacgacctggcggcgatcatcca < 6:236864‑M1/122‑44 (MQ=255) ttCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGc > 2:264272/1‑105 (MQ=255) ttCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGc < 1:264272/105‑1 (MQ=255) cGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTTTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTc < 8:271220/148‑1 (MQ=255) gAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCAc < 6:270094/149‑1 (MQ=255) gCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACg > 5:222589/1‑148 (MQ=255) aaCGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGaa < 7:307019/149‑1 (MQ=255) gcgGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGtg < 5:12862/149‑1 (MQ=255) ccacacAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGGGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAAGAGGTCTTCACGGAAGtg < 5:83300/144‑1 (MQ=255) gTCAGCGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGTCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGtgctg < 2:116820/149‑1 (MQ=255) gTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGtgctg < 6:222589/149‑1 (MQ=255) cAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAg > 2:232469/1‑87 (MQ=255) cAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAg < 1:232469/87‑1 (MQ=255) aaCGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTc < 3:268210/149‑1 (MQ=255) gCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTg < 5:276367/149‑1 (MQ=255) ccGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGtt < 6:34591/109‑1 (MQ=255) ccGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGtt > 5:34591/1‑109 (MQ=255) cGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGACGTGCTGCTCCTGCa > 4:79670/1‑149 (MQ=255) aGGGTTACGCCACGCGCATCGGCTTTGTCCAGCAGGCCCTGGACGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAg < 1:301753/89‑1 (MQ=255) aGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGACGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAg > 2:301753/1‑89 (MQ=255) gggTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGgcgc < 6:52049/149‑1 (MQ=255) gTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCt < 2:791/148‑1 (MQ=255) tACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCtt > 4:127540/1‑147 (MQ=255) cGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAg < 6:87565/148‑1 (MQ=255) cGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAg < 3:211807/148‑1 (MQ=255) gCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGt < 4:174523/58‑1 (MQ=255) gCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGt > 3:174523/1‑58 (MQ=255) aCGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTcgc < 4:287926/149‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGgcgc < 1:309261/149‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGgcg > 7:242762/1‑148 (MQ=255) cttCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAg < 5:90652/147‑1 (MQ=255) tCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGgcg > 6:146425/1‑144 (MQ=255) tCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAgct > 4:316911/1‑147 (MQ=255) tCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGa < 2:238276/148‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGaca < 8:109702/66‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGCCCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAg > 6:90652/1‑146 (MQ=255) cagcagGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCa < 3:127540/149‑1 (MQ=255) cagGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAgcg > 3:258646/1‑149 (MQ=255) ccTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACg > 4:369944/1‑149 (MQ=255) tGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAggcgatcatccagggcctgctggacaaggccgatgcgcgtggcgtaaccctcgacccggcgttgaccgcgttgctcgaa < 6:236864‑M2/122‑80 (MQ=255) tGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAggcgatcatccagggcctgctggacaaggccgatgcgcgtggcgtaaccctcgacccggcgttgaccgcgttgctcgaa > 5:236864‑M2/1‑43 (MQ=255) atgatCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAggcgatcatccagggcctgctggacaaggccgatgcgcgtggcgtaaccctcgacccggcgttgaccgcgttgctcgaaggcttcgactggcccggcaacatcc > 3:227869‑M2/1‑40 (MQ=255) atgatCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAggcgatcatccagggcctgctggacaaggccgatgcgcgtggcgtaaccctcgacccggcgttgaccgcgttgctcgaaggcttcgactggcccggcaacatcc < 4:227869‑M2/144‑105 (MQ=255) tgatCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATc < 6:214579/134‑1 (MQ=255) tgatCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATc > 5:214579/1‑134 (MQ=255) tgatCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATg > 1:9637/1‑149 (MQ=255) atCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTc < 4:246386/149‑1 (MQ=255) cgccgcCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGa < 2:167987/107‑1 (MQ=255) cgccgcCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGCCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGa > 1:167987/1‑107 (MQ=255) cGCCtgccggccctgcgtgaacgcgacgacctggcggcgatcatccagggcctgctggacaaggccgatgcgcgtggcgtaaccctcgacccggcgttgaccgcgttgctcgaaggcttcgactggcccggcaacatccgtcagctgg < 4:158810‑M1/148‑145 (MQ=255) gccgccAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTg > 3:331116/1‑149 (MQ=255) | GCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTG > NC_002947/3933728‑3934011 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |