New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4128664 = | 65 (1.080) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 6.5% | coding (564/879 nt) | PP_3632 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4128697 = | 53 (0.920) | coding (531/879 nt) | PP_3632 | LysR family transcriptional regulator |
GTACCCGGCGCCGACCAGGCTCTTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGC > NC_002947/4128517‑4128811 | gTACCCGGCGCCGACCAGGCTCTTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCgcca > 6:19956/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCCGACCAGGCTCTTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCgccagc > 6:153975/1‑147 (MQ=255) cGACCAGGCTCTTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCTCTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCggg < 6:308172/149‑1 (MQ=255) cGACCAGGCTCTTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCggg < 5:261867/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCTTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTg < 5:212315/149‑1 (MQ=255) cAGGCTCTTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGa > 7:224630/1‑149 (MQ=255) ggCTCTTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATc < 2:373761/149‑1 (MQ=255) ctctTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCt < 7:134139/149‑1 (MQ=255) tctTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCTGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTg > 8:129835/1‑149 (MQ=255) ttGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCTGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTg < 7:129835/147‑1 (MQ=255) aTCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCAGGATCACCCCGGcct < 4:210626/148‑2 (MQ=255) gCATCGTTGTAGTTCAGCTCGTTCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGGCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGCATCAACGCCCGTTGCGCGAGCCAGGCCAGGATCACCCCGGcctggct < 7:100967/149‑6 (MQ=255) gCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTg < 6:188769/148‑1 (MQ=255) cATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCt > 8:79315/1‑139 (MQ=255) cATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCt < 7:79315/139‑1 (MQ=255) cATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGc > 8:193443/1‑149 (MQ=255) aTCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGACGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGACCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCt > 6:102022/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTcggccg > 5:197714/1‑149 (MQ=255) cTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCa > 7:76040/1‑138 (MQ=255) cTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCa < 8:76040/138‑1 (MQ=255) cGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGcaca > 6:16324/1‑149 (MQ=255) tCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATAc < 4:127993/149‑1 (MQ=255) cgcgGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGc < 2:59076/149‑1 (MQ=255) gcgGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGcc < 4:49880/149‑1 (MQ=255) gcgGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGc > 2:323860/1‑148 (MQ=255) cgGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCa < 7:257939/149‑1 (MQ=255) gccttgtggccttgccacaggtggtcggcaaagggctgacggtcaccccctggcggcgcgacccgatcctggcgtatgtgccggccgactggCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCt < 5:376767‑M1/32‑1 (MQ=255) gccttgtggccttgccacaggtggtcggcaaagggctgacggtcaccccctggcggcgcgacccgatcctggcgtatgtgccggccgactggCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCt > 6:376767‑M1/93‑124 (MQ=255) gggTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCGGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGcac < 6:298751/134‑1 (MQ=255) gggTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCGGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGcac > 5:298751/1‑134 (MQ=255) gggTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCgg > 8:21356/1‑149 (MQ=255) ggTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCggg < 5:19956/149‑1 (MQ=255) cAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTcgc < 8:224630/149‑1 (MQ=255) aaCCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTcgcg > 5:337584/1‑149 (MQ=255) ccccGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGcgcc < 1:48253/149‑1 (MQ=255) ccccGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGcgcc < 2:186928/149‑1 (MQ=255) cccGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGcgccg > 7:213248/1‑149 (MQ=255) ccgccgCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGcgccgc > 6:220837/1‑149 (MQ=255) ggcaaagggctgacggtcaccccctggcggcgcgacccgatcctggcgtatgtgccggccgactggCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGt > 1:318166‑M1/67‑104 (MQ=255) ggcaaagggctgacggtcaccccctggcggcgcgacccgatcctggcgtatgtgccggccgactggCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGt < 2:318166‑M1/38‑1 (MQ=255) aCCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTg > 3:10732/1‑97 (MQ=255) aCCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTg < 4:10732/97‑1 (MQ=255) aCCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGAcc > 7:189019/1‑149 (MQ=255) cACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATc < 4:98418/123‑1 (MQ=255) cACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATc > 3:98418/1‑123 (MQ=255) cACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTcgc > 4:252549/1‑130 (MQ=255) cACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTcgc < 3:252549/130‑1 (MQ=255) cTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCg > 1:227278/1‑122 (MQ=255) cTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCg < 2:227278/122‑1 (MQ=255) gCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCTGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCGAGGGGGTGACCGTCAGcc > 8:238462/1‑149 (MQ=255) gCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGcc > 8:177562/1‑149 (MQ=255) gCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGcc > 7:344464/1‑149 (MQ=255) gCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGc < 1:189875/148‑1 (MQ=255) ccGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGa > 7:350432/1‑149 (MQ=255) aGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCtg < 7:193443/149‑1 (MQ=255) gCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCtgt < 5:153975/149‑1 (MQ=255) cTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCcac < 7:21356/149‑1 (MQ=255) tCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCCTTGCcacatg < 5:102022/149‑3 (MQ=255) gTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCg < 3:187375/124‑1 (MQ=255) gTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCg > 4:187375/1‑124 (MQ=255) gTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGc > 4:320858/1‑149 (MQ=255) ttGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGcc < 8:350432/149‑1 (MQ=255) aaTCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGt > 6:309665/1‑99 (MQ=255) aaTCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGt < 5:309665/99‑1 (MQ=255) aTCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATc > 4:157571/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCa < 5:220837/148‑1 (MQ=255) aaCGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAg < 6:90524/149‑1 (MQ=255) aCGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAgt < 3:107034/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGc < 3:320858/149‑1 (MQ=255) cGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGcc > 3:144957/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCt > 2:231832/1‑149 (MQ=255) ccagccagGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGc < 6:197714/149‑1 (MQ=255) | GTACCCGGCGCCGACCAGGCTCTTGATCGCATCGTTGTAGTTCAGCTCGATCCGCGGTTCGGGGTACAACCCCGCCGCTGCAAACCACTCGCCGGTAACCCGCGACAGCTGGGTGGTGCTGTCGTTGAGAATCAACGCCCGTTGCGCCAGCCAGGCCGGGGTGATCCTGGCCGGTGGCTGCCAGTCGGCCGGCACATACGCCAGGATCGGGTCGCGCCGCCAGGGGGTGACCGTCAGCCCTTTGCCGACCACCTGTGGCAAGGCCACAAGGCCGATATCCAGTGTGCCCTCACGC > NC_002947/4128517‑4128811 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |