| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5304887 | 91 (1.510) | 5 (0.090) | 4/250 | NT | 5.3% | coding (2365/3483 nt) | recC | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit |
| ? | NC_002947 | = 5304970 | 91 (1.600) | coding (2282/3483 nt) | recC | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATACAGTTGGTCACGTGC > NC_002947/5304743‑5305034 | tctGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCACTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTGGCCCGGtc > 7:191467/1‑147 (MQ=255) cgcgTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGTCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCgg < 1:222409/149‑1 (MQ=255) cgcgTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGCACGGCTGCAGCGGGTGCTCATGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCgg > 8:275271/1‑149 (MQ=255) tctgtctCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTg > 5:309065/1‑149 (MQ=255) tctcACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGc < 6:309065/147‑1 (MQ=255) tcACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCCCGGGCTGGCCctg > 1:50302/1‑149 (MQ=255) cACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCctgc > 6:373490/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCctgct > 5:222250/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCctgct < 2:145740/149‑1 (MQ=255) aCCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCctgc < 2:308177/148‑1 (MQ=255) aCCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCctgc < 2:269226/148‑1 (MQ=255) aCCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCctgc < 8:305658/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATCGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCtgctgc < 3:292005/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCtgctgc > 4:262414/1‑149 (MQ=255) ctgGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTgcgc < 4:11587/147‑1 (MQ=255) cagcaCCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGcc > 1:378758/1‑148 (MQ=255) caCCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAAt > 8:229785/1‑149 (MQ=255) ccTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGcctcggtgctgatcggccagttgcgcgatcacatcgc > 8:339565‑M1/1‑112 (MQ=255) ccTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGc > 5:25034/1‑149 (MQ=255) 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gCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAg > 2:197525/1‑138 (MQ=255) cATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGAtg < 2:47141/149‑1 (MQ=255) cATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGAtg < 1:347668/149‑1 (MQ=255) tGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGa < 5:218771/141‑1 (MQ=255) tGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGa > 6:218771/1‑141 (MQ=255) 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1:205782/149‑1 (MQ=255) gtgcgtgcAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTgg < 6:326847/92‑1 (MQ=255) gtgcgtgcAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTgg > 5:326847/1‑92 (MQ=255) cgtgcAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCt < 8:149655/148‑1 (MQ=255) tgcAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGAc < 7:214635/149‑1 (MQ=255) gcAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAAAGCCAGCCCGCAGCCATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGAc > 7:303223/1‑148 (MQ=255) cAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCCGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACa > 1:188547/1‑148 (MQ=255) cAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCCGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACa > 4:327007/1‑148 (MQ=255) cAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACa < 4:6631/148‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCATCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATa < 3:145294/149‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATc < 6:220348/90‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATc > 5:220348/1‑90 (MQ=255) aaCAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATa < 1:236602/149‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCTAGCACGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCAAAATGCCAGCCCGAAGCGATTTGATCTCGCAACTGGCAGATCAGCACCGATGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACAt < 8:191467/148‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATa > 4:273421/1‑148 (MQ=255) cAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATACa < 8:326028/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATACAGt < 3:355282/149‑1 (MQ=255) tCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCATCTGGCCGCTCAGCAACGAGGccgggcgagcaactgttgcacgcactgacccaggagcacccgctgcagccgtgcagcc < 7:339565‑M2/149‑59 (MQ=255) tCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATACAGTTGGt > 3:181769/1‑148 (MQ=255) tCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATACAGTTGGt > 2:194181/1‑148 (MQ=255) ccGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGccgggcgagcaactgttgcacgcactgacccaggagcacccgctgcagccgttccgccctcg < 6:7072‑M2/149‑63 (MQ=255) ccGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATACAGTTGGTCACGt < 1:257034/149‑1 (MQ=255) ggcctcggtgctgatcggccagttgcgcgatcacatcgctgcgggctggcatttggccgacgcgcagcagggccagcccgcgagaccgggcgagcaactgttgcacgcactgacccaggagcacccgctgcagccgttcagccctcggt < 3:190858‑M1/149‑148 (MQ=255) | TCTGCGCGTCTGTCTCACCCTGCTGGTGCAGCACCTGCCATTCATGGGCATAGCTGAACAGTGGGCTGCCCTTCTGGAAGTACCGAGGGCTGAACGGCTGCAGCGGGTGCTCCTGGGTCAGTGCGTGCAACAGTTGCTCGCCCGGTCTCGCGGGCTGGCCCTGCTGCGCGTCGGCCAAATGCCAGCCCGCAGCGATGTGATCGCGCAACTGGCCGATCAGCACCGAGGCCGGGCGTTCGCTATTGTCGCGGATACTGCGCCCGACCCAGCTGACATACAGTTGGTCACGTGC > NC_002947/5304743‑5305034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |