| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5594092 = | 43 (0.710) | 7 (0.150) | 6/208 | NT | 18.2% | intergenic (‑39/+106) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
| ? | NC_002947 | 5594185 = | 29 (0.610) | intergenic (‑132/+13) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase | |||||
CAGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGC > NC_002947/5593946‑5594240 | gatgaagatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgcgaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttAcc < 2:288462‑M1/3‑1 (MQ=255)gatgaagatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttAcc < 6:68424‑M1/3‑1 (MQ=255)cAGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACaccacc > 1:306298/1‑149 (MQ=255) tgaagatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCt < 1:236187‑M1/5‑1 (MQ=255) ggCCGATGCCGAGGGAAACCCACAGGGAAACCAGGGCGCGAGCACCCAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTCGCGGGGTGATGTCATGGTCTTGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCt < 4:57365/149‑1 (MQ=255) ccGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCtgt < 2:306298/149‑1 (MQ=255) ccGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCtgt < 6:24100/149‑1 (MQ=255) aagatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCtgt > 7:141762‑M1/143‑149 (MQ=255) aagatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCtgt < 8:280827‑M1/7‑1 (MQ=255) aagatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCtg > 5:118103‑M1/143‑148 (MQ=255) agatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCtgtg > 8:128375‑M1/142‑149 (MQ=255) agatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCtgtg < 3:37113‑M1/8‑1 (MQ=255) gatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTgg > 1:380521‑M1/141‑149 (MQ=255) gatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTgg < 4:196277‑M1/9‑1 (MQ=255) aTGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGGACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTggg < 3:232516/149‑1 (MQ=255) tcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTgg < 4:229482‑M1/9‑1 (MQ=255) cacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAg < 7:326962‑M1/12‑1 (MQ=255) acccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGc > 5:34501‑M1/137‑149 (MQ=255) acccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGc > 3:12405‑M1/137‑149 (MQ=255) gAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCgg < 2:356046/149‑1 (MQ=255) gAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCgg < 1:2741/149‑1 (MQ=255) ccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCgg > 3:229482‑M1/135‑149 (MQ=255) ccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCgg < 7:130658‑M1/15‑1 (MQ=255) caggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCggg > 6:175297‑M1/134‑149 (MQ=255) caggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCggg > 3:103560‑M1/134‑149 (MQ=255) caggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCATGTGGGAGCggg < 2:12899‑M1/16‑1 (MQ=255) aggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGc < 5:278917‑M1/17‑1 (MQ=255) aggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGc > 3:155137‑M1/133‑149 (MQ=255) aaaaCCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTg < 7:76815/149‑1 (MQ=255) aaaaCCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTg < 1:164160/149‑1 (MQ=255) cacaGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCcgc > 6:6943/1‑149 (MQ=255) gtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCcgcg > 2:118266‑M1/124‑149 (MQ=255) gTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGaa > 5:174827/1‑148 (MQ=255) 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aaaTGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCAc < 3:51310/149‑1 (MQ=255) ctgGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGtgc < 6:174827/147‑1 (MQ=255) ttgggATTGGATTGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGTAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTTGGAGCGGGCTTGCCCTCGAACAGCTGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTgcttgctta < 7:112023/147‑2 (MQ=38) ggggATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTcg > 7:305566/1‑149 (MQ=255) gggATTGGATGGGCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTcgc < 1:173135/149‑1 (MQ=255) caaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTcgc > 4:37113‑M1/80‑149 (MQ=255) gATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg > 4:113632/1‑149 (MQ=255) aggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg > 5:130502‑M1/78‑149 (MQ=255) gcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGc > 2:283294‑M1/76‑149 (MQ=255) aTGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGc < 2:317934/149‑1 (MQ=255) cgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGc > 6:278917‑M1/71‑148 (MQ=255) gggAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTc < 3:113632/149‑1 (MQ=255) gagagaACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGTGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTcc > 7:152385/1‑148 (MQ=255) ccgagcggttccgccaggaaggaagccagctgaaccacaacgtctaacccccagcaccttACCCTGTGGTAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGGGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcaca > 8:82922‑M1/61‑149 (MQ=255) aaCTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAgg > 2:247169/1‑149 (MQ=255) ctggctggGTGATGTCTTGGTCATGTCCGCTGGAGTTTTGTTATGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCGAGCCCGCTCCCACAGGGt < 8:305566/149‑1 (MQ=25) gctggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCCGCCAAGCCCGT‑GCCATGAACCGCAGTGCTTGCTTAGCCGGCAAGCCCGCTCCCACAGCGTAAg > 8:69621/1‑149 (MQ=37) tGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACAACGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTAGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGtgctg > 3:349297/1‑149 (MQ=255) gagggcatggtcatgTCCGCAGGAGTGAGGTTAAGGGGCATACCCCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGG‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGtgctgc < 7:63241/144‑1 (MQ=25) ttggtcatgTCCGCTGGAGTTTTGTTAAGGGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCGGGT‑GCCTTGCACCGCAGTGCTTGCTTGGCGGCCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTa < 4:349297/148‑1 (MQ=25) tggtcatgTCCGCAGGAGTGATGATAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGCACACCGGCAAAACCGGT‑GCCAAGCACCCCAGTGCTTGCTTAGCGGGCAAGCCCCCACCCACAGGGGAAGGTGCTGCgggt > 3:357163/1‑144 (MQ=37) tcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCCTGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACt > 7:280827/1‑149 (MQ=255) atgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACAAAGGCAAAGCCCGT‑GCCATTCACCGCACTGCTTGCTTCGCGGGCAATCCCGCACCCACACGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACttt > 1:12899/1‑149 (MQ=37) tCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACCCCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCCCCGCCGTGCTTGCTTCGCGGGCCAGCCCGCTCCCCCAGGGGAAGGGGCTGCGGTTGTGACGTtgtg > 4:207286/1‑149 (MQ=25) gccGCAGGAGTCATGGTACGGGCCATCCACCACCCTGGGGGAGCGGGCTTCCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCCCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTtgt < 2:259365/147‑1 (MQ=25) ccGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGGGGGAGGGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGGACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTtgtg < 7:69621/148‑1 (MQ=255) cGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTAGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTgg > 4:262580/1‑148 (MQ=255) aGGAGTTAGGTTACGGGCCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAACGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGGGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACa < 5:6943/149‑1 (MQ=25) ttatAAGTGGCATACACCACCCTGGGGGAGCGGGCTGGCCCGCTAACACCGGCAAAGCGGGT‑GCAATGCACCGCTGTGCTTGCTTCGCGGGAAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgctggct < 4:357163/145‑1 (MQ=255) tGTTAAGTGGCATACACCACCGTGGGGGAGCGGGCTGGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgctggct < 7:135985/148‑1 (MQ=255) taaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg > 3:223179‑M1/17‑88 (MQ=255) taaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg < 4:223179‑M1/72‑1 (MQ=255) aaGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCt > 8:63298/1‑148 (MQ=255) gCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGGCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGGCCATGCACCACAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGGTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTcc > 1:288462/1‑147 (MQ=37) gCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACCCCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTgg > 5:68424/1‑149 (MQ=255) aTACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGGAAGCCCGCTCCCACAGGGGAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAg > 3:60283/1‑131 (MQ=255) ACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGc > 7:63298‑M1/1‑149 (MQ=255) | CAGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGC > NC_002947/5593946‑5594240 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |