New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5594092 = | 43 (0.710) | 7 (0.150) | 6/208 | NT | 18.2% | intergenic (‑39/+106) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
? | NC_002947 | 5594185 = | 29 (0.610) | intergenic (‑132/+13) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
GCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATC > NC_002947/5594039‑5594330 | gctggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCCGCCAAGCCCGT‑GCCATGAACCGCAGTGCTTGCTTAGCCGGCAAGCCCGCTCCCACAGCGTAAg > 8:69621/1‑149 (MQ=37) tGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACAACGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTAGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGtgctg > 3:349297/1‑149 (MQ=255) gagggcatggtcatgTCCGCAGGAGTGAGGTTAAGGGGCATACCCCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGG‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGtgctgc < 7:63241/144‑1 (MQ=25) ttggtcatgTCCGCTGGAGTTTTGTTAAGGGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCGGGT‑GCCTTGCACCGCAGTGCTTGCTTGGCGGCCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTa < 4:349297/148‑1 (MQ=25) tggtcatgTCCGCAGGAGTGATGATAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGCACACCGGCAAAACCGGT‑GCCAAGCACCCCAGTGCTTGCTTAGCGGGCAAGCCCCCACCCACAGGGGAAGGTGCTGCgggt > 3:357163/1‑144 (MQ=37) tcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCCTGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACt > 7:280827/1‑149 (MQ=255) atgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACAAAGGCAAAGCCCGT‑GCCATTCACCGCACTGCTTGCTTCGCGGGCAATCCCGCACCCACACGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACttt > 1:12899/1‑149 (MQ=37) tCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACCCCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCCCCGCCGTGCTTGCTTCGCGGGCCAGCCCGCTCCCCCAGGGGAAGGGGCTGCGGT‑TGTGACGTtgtg > 4:207286/1‑149 (MQ=25) gccGCAGGAGTCATGGTACGGGCCATCCACCACCCTGGGGGAGCGGGCTTCCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCCCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTtgt < 2:259365/147‑1 (MQ=25) ccGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGGGGGAGGGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGGACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTtgtg < 7:69621/148‑1 (MQ=255) cGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTAGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTgg > 4:262580/1‑148 (MQ=255) aGGAGTTAGGTTACGGGCCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAACGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGGGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACa < 5:6943/149‑1 (MQ=25) ttatAAGTGGCATACACCACCCTGGGGGAGCGGGCTGGCCCGCTAACACCGGCAAAGCGGGT‑GCAATGCACCGCTGTGCTTGCTTCGCGGGAAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAgctggct < 4:357163/145‑1 (MQ=255) tGTTAAGTGGCATACACCACCGTGGGGGAGCGGGCTGGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAgctggct < 7:135985/148‑1 (MQ=255) aaGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCt > 8:63298/1‑148 (MQ=255) gCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGGCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGGCCATGCACCACAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGGTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTcc > 1:288462/1‑147 (MQ=37) gCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACCCCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTgg > 5:68424/1‑149 (MQ=255) aTACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGGAAGCCCGCTCCCACAGGGGAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAg > 3:60283/1‑131 (MQ=255) ACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGc > 7:63298‑M1/1‑149 (MQ=255) tgtgggagcgggcttgcccgcgaagcaagccctgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttagcgggcaagcccgctaccacagggtAAGGTGCTGGGGG‑TTAGACGTTGTGGTTCAGCTGGCTTCCTTCCTGGCGGAACCGCTCgg > 8:82922‑M2/90‑149 (MQ=255) GGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTc > 1:129596‑M1/1‑147 (MQ=255) GGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTc < 2:129596‑M1/147‑1 (MQ=255) GCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCAc < 4:76556‑M1/147‑1 (MQ=255) GCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCAc > 3:76556‑M1/1‑147 (MQ=255) gcttgcccgcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACg > 6:278917‑M2/79‑148 (MQ=255) GCCCGTGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATg > 8:152385‑M1/1‑148 (MQ=255) gcccgcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGc > 2:283294‑M2/75‑149 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCt < 5:263204‑M1/149‑1 (MQ=255) ccgcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTa > 3:223179‑M2/73‑88 (MQ=255) ccgcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTa < 4:223179‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCt > 5:130502‑M2/73‑149 (MQ=255) CGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGc > 2:333924‑M1/1‑142 (MQ=255) CGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGc < 1:333924‑M1/142‑1 (MQ=255) GCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTg < 5:135369‑M1/149‑1 (MQ=255) gcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTg > 4:37113‑M2/71‑149 (MQ=255) ggcacCGGCTTTGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTc > 1:294629/3‑149 (MQ=255) cacCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGa > 3:215655/1‑149 (MQ=255) ccGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGAcc > 8:130658/1‑149 (MQ=255) tggCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCg > 2:236187/2‑149 (MQ=255) gCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGt > 6:228075/1‑148 (MQ=255) tGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTc > 6:334500/1‑148 (MQ=255) gCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGCCCGTCACATCCACGGCCTCGa > 7:140473/1‑149 (MQ=255) cGCAGTGCTGGCTTCGCGGCCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCtt < 1:374883/149‑1 (MQ=255) gCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTg < 3:262580/149‑1 (MQ=255) cAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCt > 1:195265/1‑140 (MQ=255) cAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCt < 2:195265/140‑1 (MQ=255) tgcttgctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTATTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTgg > 1:279166/1‑147 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCt < 4:185837/110‑1 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGAGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGACTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCATCGATCATGGCAgac > 8:326962/1‑147 (MQ=255) tgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCgct > 3:29661/1‑147 (MQ=255) gcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTAc > 3:196277/1‑149 (MQ=255) cgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCAc < 4:331478‑M2/97‑1 (MQ=255) cgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCAc > 2:118266‑M2/27‑149 (MQ=255) gcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCt > 3:155137‑M2/18‑149 (MQ=255) gcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCt < 5:278917‑M2/132‑1 (MQ=255) cccgctcccacatggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTg < 2:12899‑M2/133‑1 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTg > 6:175297‑M2/17‑149 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTg > 3:103560‑M2/17‑149 (MQ=255) ccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg < 7:130658‑M2/134‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg > 3:229482‑M2/16‑149 (MQ=255) gctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGt > 5:34501‑M2/14‑149 (MQ=255) gctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGt > 3:12405‑M2/14‑149 (MQ=255) ctcccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTg < 7:326962‑M2/137‑1 (MQ=255) ccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGa < 4:229482‑M2/138‑1 (MQ=255) ccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATc > 1:380521‑M2/10‑149 (MQ=255) ccacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATc < 4:196277‑M2/140‑1 (MQ=255) cacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCt > 8:128375‑M2/9‑149 (MQ=255) cacagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCt < 3:37113‑M2/141‑1 (MQ=255) acagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCtt > 7:141762‑M2/8‑149 (MQ=255) acagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCtt < 8:280827‑M2/142‑1 (MQ=255) cagggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCtt > 5:118103‑M2/7‑148 (MQ=255) agggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCa < 1:236187‑M2/144‑1 (MQ=255) ggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATc < 6:68424‑M2/146‑1 (MQ=255) ggtAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTCGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATc < 2:288462‑M2/146‑1 (MQ=255) | GCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGT‑GCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGT‑TTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATC > NC_002947/5594039‑5594330 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |