New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 5658546 | 75 (1.250) | 5 (0.090) | 5/252 | NT | 6.2% | coding (601/993 nt) | sahR | methionine metabolism transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 5658574 | 79 (1.370) | coding (629/993 nt) | sahR | methionine metabolism transcriptional regulator |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CCTGCTGGCGCTGCTCGACAAACTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGC > NC_002947/5658401‑5658690 | ccTGCTGGCGCTGCTCGACAAACTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTg > 2:80145/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCGCTGCTCGACAAACTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCcctt > 1:230080‑M1/1‑145 (MQ=255) ctgGCGCTGCTCGACAAACTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTgcgcg > 5:91083/1‑149 (MQ=255) gACAAACTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGc < 1:80145/147‑1 (MQ=255) gACAAACTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCAACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGc < 1:32021/147‑1 (MQ=255) aCAAACTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAg > 2:168365/1‑149 (MQ=255) aaaCTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAgcg > 8:274960/1‑149 (MQ=255) aCTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAgcgc > 2:302827/1‑148 (MQ=255) tGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGcgcg > 5:65563/1‑147 (MQ=255) tGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGcgcg > 5:362660/1‑147 (MQ=255) cATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGaa < 1:17127/147‑1 (MQ=255) cATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAgg > 6:4603/1‑149 (MQ=255) cGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCccttcgcgctggcacacctggcgcgcaagctc < 6:350659‑M1/148‑33 (MQ=255) cGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGgctc > 8:124204‑M2/1‑144 (MQ=255) cGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGgctc > 4:337175‑M2/1‑144 (MQ=255) gACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCccttcgcgctggcacacctggcgcgcaagctcga < 3:319237‑M1/149‑35 (MQ=255) aCCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCccttcgcgctggcacacctggcgcgcaagctcgag > 1:275850‑M1/1‑114 (MQ=255) aCCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCccttcgcgctggcacacctggcgcgcaagctcgag < 2:230080‑M1/149‑36 (MQ=255) 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cAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAAcc > 5:207478/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTg > 2:380409/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCa < 6:290434/149‑1 (MQ=255) gAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGc > 7:19616/1‑149 (MQ=255) gTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCTGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCATGGACAACAGCCCTACCATGCTCTAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CATCGCGAAGGGCTCGACTACGTGAACCTGCAGTTGGCCGa < 7:234944/149‑1 (MQ=255) tCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGAt < 1:168365/149‑1 (MQ=255) ggCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGc < 6:91083/149‑1 (MQ=255) ccccGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCAc > 5:24974/1‑149 (MQ=255) acGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCAGGGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACt > 1:273944/2‑149 (MQ=255) gACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTg > 7:222867/1‑148 (MQ=255) aCGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCACA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCACGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGc > 4:211851/1‑148 (MQ=255) cGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCaa < 4:144163/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTGCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCaa < 5:36816/149‑1 (MQ=255) ggCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTACAACGGa < 8:166664/149‑1 (MQ=255) ttCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGAtgt > 1:6372/1‑149 (MQ=255) 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cccTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGc < 8:39983/142‑1 (MQ=255) cccTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGagattg > 7:39983/1‑144 (MQ=255) cccTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCgg > 6:144404/1‑149 (MQ=255) cTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGcc > 8:174395/1‑149 (MQ=255) tACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGccc > 3:51698/1‑149 (MQ=255) ccATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGTCCTATGCACTGGGTGCAACTGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTg < 7:240523/149‑1 (MQ=255) cATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTgg < 2:160833/149‑1 (MQ=255) cATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGGGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGCGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTgg < 3:211851/149‑1 (MQ=255) aTGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGgctcgagcatggtagggctgttgtccagggcggtgacctgggcgaagcgccgggccaggtcgggcaggaagccaccgtcgccggggccgacttccagcgcgctggcggccg < 2:275850‑M2/149‑112 (MQ=255) tGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGcc < 7:95570/149‑1 (MQ=255) cTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGgctcgagcatggtagggctgttgtccagggcggtgacctgggcgaagcgccgggccaggtcgggcaggaagccaccgtcgccggggccgacttccagcgcgctggcggccgggt < 2:230080‑M2/149‑115 (MQ=255) cTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGgctcgagcatggtagggctgttgtccagggcggtgacctgggcgaagcgccgggccaggtcgggcaggaagccaccgtcgccggggccgacttccagcgcgctggcggccgggt > 1:275850‑M2/1‑35 (MQ=255) cTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGCCt < 3:325185/148‑1 (MQ=255) tCGAGCccttcgcgctggcacacctggcgcgcaagctcgagcatggtagggctgttgtccagggcggtgacctgggcgaagcgccgggccaggtcgggcaggaagccaccgtcgccggggccgacttccagcgcgctggcggccgggt < 3:144163‑M1/148‑143 (MQ=255) tCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGgctcgagcatggtagggctgttgtccagggcggtgacctgggcgaagcgccgggccaggtcgggcaggaagccaccgtcgccggggccgacttccagcgcgctggcggccgggtc < 3:319237‑M2/149‑116 (MQ=255) tCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTg > 1:153579/1‑149 (MQ=255) cGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTgc > 7:281546/1‑149 (MQ=255) cGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTgc < 6:362660/149‑1 (MQ=255) gAGCccttcgcgctggcacacctggcgcgcaagctcgagcatggtagggctgttgtccagggcggtgacctgggcgaagcgccgggccaggtcgggcaggaagccaccgtcgccggggccgacttccagcgcgctggcggccgggtcg > 8:124204‑M1/1‑4 (MQ=255) gAGCccttcgcgctggcacacctggcgcgcaagctcgagcatggtagggctgttgtccagggcggtgacctgggcgaagcgccgggccaggtcgggcaggaagccaccgtcgccggggccgacttccagcgcgctggcggccgggtcg > 4:337175‑M1/1‑4 (MQ=255) gAGCccttcgcgctggcacacctggcgcgcaagctcgagcatggtagggctgtt > 7:184652‑M1/1‑4 (MQ=255) gAGCccttcgcgctggcacacctggcgcgcaagctcgagcatggtagggctgtt < 8:184652‑M1/54‑51 (MQ=255) gAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGgctcgagcatggtagggctgttgtccagggcggtgacctgggcgaagcgccgggccaggtcgggcaggaagccaccgtcgccggggccgacttccagcgcgctggcggccgggtcg < 6:350659‑M2/148‑117 (MQ=255) gAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTgc < 1:380409/148‑1 (MQ=255) gAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTgc < 6:91167/148‑1 (MQ=255) gAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTg < 6:207478/147‑1 (MQ=255) | CCTGCTGGCGCTGCTCGACAAACTGCATTTCGACCCGGCCGCCAGCGCGCTGGAAGTCGGCCCCGGCGACGGTGGCTTCCTGCCCGACCTGGCCCGGCGCTTCGCCCA‑GGTCACCGCCCTGGACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGC‑CAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCAT‑TTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGC > NC_002947/5658401‑5658690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |