New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 670392 | 48 (0.800) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 6.0% | coding (1834/2355 nt) | pbpC | peptidoglycan glycosyltransferase |
? | NC_002947 | = 670445 | 49 (0.850) | coding (1887/2355 nt) | pbpC | peptidoglycan glycosyltransferase |
TCCCGGTAGCGCCGGTACCTGCGAATATCGGCGTTGCAGCGATCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCTTGGC > NC_002947/670300‑670578 | tCCCGGTAGCGCCGGTACCTGCGAATATCGGCGTTGCAGCGATCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAgcc < 2:347813‑M2/149‑4 (MQ=255) tCCCGGTAGCGCCGGTACCTGCGAATATCGGCGTTGCAGCGATCTGTAGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAgcc < 6:252726‑M2/149‑4 (MQ=255) cGGTACCTGCGAATATCGGCGTTGCAGCGATCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTg < 4:307909/149‑1 (MQ=255) ggTACCTGCGAATATCGGCGTTGCAGCGATCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTgg < 6:194265/149‑1 (MQ=255) cGAATATCGGCGTTGCAGCGATCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTgg < 4:19802/147‑1 (MQ=255) aaTATCGGCGTTGCAGCGATCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTAGGCCTGGGttt > 1:374841/1‑149 (MQ=255) tatCGGCGTTGCAGCGATCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTgc > 5:137114/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGCAGCGATCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGa < 1:325414/149‑1 (MQ=255) aTCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTgg > 2:187583/1‑127 (MQ=255) aTCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTgg < 1:187583/127‑1 (MQ=255) ccGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCg > 4:273884/1‑149 (MQ=255) cGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTAGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCgg < 2:374841/149‑1 (MQ=255) aGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCgg < 4:326402/149‑1 (MQ=255) ccGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTg < 5:210246/144‑1 (MQ=255) ccGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGt < 1:249840/149‑1 (MQ=255) ccGATGAGAAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTg > 6:210246/1‑144 (MQ=255) caagcaGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATgg > 6:3459/1‑147 (MQ=255) aagcaGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAg > 1:8217/1‑149 (MQ=255) cacCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGc > 2:16521/1‑124 (MQ=255) cacCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGc < 1:16521/124‑1 (MQ=255) acCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCggg > 3:334737/1‑149 (MQ=255) acCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCggg > 2:376035/1‑149 (MQ=255) acCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCggg > 3:17889/1‑149 (MQ=255) cAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAATCGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGgc < 1:257015/149‑1 (MQ=255) cAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGgcg > 3:216745/1‑149 (MQ=255) cAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGgcg > 2:287669/1‑149 (MQ=255) aCTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAgccgacagttggtgtcctgcttgctcatcggctgacccagcggccaacagatcgctgcaacgccgatattcgcaggtaccggcgcta < 5:290194‑M2/149‑88 (MQ=255) tCGGCGTCATCGCTTTGCATGGACCCTTGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCaa < 8:315608/147‑1 (MQ=255) tCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAgccgacagttggtgtcctgcttgctcatcggctgacccagcggccaacagatcgctgcaacgccgatattcgcaggtaccggcgctaccgg < 5:369921‑M2/149‑92 (MQ=255) gCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGgcgc < 3:359913/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGCTTTGCATGGAGCCTCGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGCTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGt < 6:59976/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGt > 7:46894/1‑148 (MQ=255) aTGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCtgt < 1:376035/149‑1 (MQ=255) tGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCtgtg < 3:111287/149‑1 (MQ=255) ccTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCgg > 1:146215/1‑149 (MQ=255) gACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAgccgacagttggtgtcctgcttgctcatcggctgacccagcggccaacagatcgctgcaacgccgatattcgcaggtaccggcgctaccgggacgctgatgccgcgttggctgtcgc > 6:369921‑M2/1‑30 (MQ=255) accacGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTg > 1:286665/1‑147 (MQ=255) accacGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTg > 1:281790/1‑147 (MQ=255) accacGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTg > 4:128747/1‑147 (MQ=255) accacGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTg > 2:362955/1‑147 (MQ=255) ccacGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAg > 1:102065/1‑149 (MQ=255) cacGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGc > 8:67866/1‑149 (MQ=255) cacGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGc < 4:17889/149‑1 (MQ=255) cacGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGAGCCTGGGTTTCCCCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGc > 8:229649/1‑149 (MQ=255) cgccgcCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCt > 8:74224/1‑149 (MQ=255) gccgccAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCtt < 6:137114/149‑1 (MQ=255) gccgccAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCtt < 4:334737/149‑1 (MQ=255) gccgccAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCtt < 8:46894/149‑1 (MQ=255) gccgccAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCtt > 1:124746/1‑149 (MQ=255) ccgccAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCTTg > 6:378667/1‑149 (MQ=255) cgccAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCTTgg < 5:3459/149‑1 (MQ=255) gccAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCTTGGc > 2:271794/1‑149 (MQ=255) gccAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCTTGGc > 2:108712/1‑149 (MQ=255) gccAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCTTGGc > 1:256700/1‑149 (MQ=255) | TCCCGGTAGCGCCGGTACCTGCGAATATCGGCGTTGCAGCGATCTGTTGGCCGCTGGGTCAGCCGATGAGCAAGCAGGACACCAACTGTCGGCGTCAGCGCTTTGCATGGACCCTGGACGGCACCACGCCGCCAACCTTGCAGGCAGCCGACCAGCCGCTGGGCCTGGGTTTGCGCGAACAAGTATGGGTCAA‑CGAGCGGGGCTTGCGGGTCGATGGCAGCTGCCCGGGCGCCAAGGCGCGTGACATCGCCCTGTGGCCGGCGCCGCTGGAGCCTTGGC > NC_002947/670300‑670578 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |