New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 693480 = | 56 (0.930) | 5 (0.090) | 5/252 | NT | 8.2% | coding (562/918 nt) | PP_0595 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 693523 = | 58 (1.010) | coding (519/918 nt) | PP_0595 | LysR family transcriptional regulator |
GCGCCTGGATGTCGGCCGGCAGGCGGAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGC > NC_002947/693375‑693669 | cagatccgcatgatcgcccccagccaggtcgagcacggcgtgctcgacggcagcctgcacgttggcgtcgtaccacagaccagcccgttatcggggcttgagtatCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGa > 2:327894‑M1/106‑149 (MQ=255) agatccgcatgatcgcccccagccaggtcgagcacggcgtgctctacggcagcctgcactttggcgtcgtaccacagaccagcccgttatcgtggcttgagtatCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGAt > 4:216713‑M1/105‑149 (MQ=255) gcCTGGATGTCGGCCGGCAGGCGGAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGAt > 5:83009/1‑148 (MQ=255) gcCTGGATGTCGGCCGGCAGGCGGAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATa < 4:44066/149‑1 (MQ=255) gcCTGGATGTCGGCCGGCAGGCGGAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATa > 7:277911/1‑149 (MQ=255) cggcAGGCGGAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATa < 2:221066/149‑1 (MQ=255) ggcAGGCGGAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATaa > 5:2151/1‑149 (MQ=255) gCGGAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGc < 8:244062/149‑1 (MQ=255) ggAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTg > 1:248665/1‑149 (MQ=255) ggAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTg < 2:298116/149‑1 (MQ=255) ggTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGTCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCt < 5:218744/149‑1 (MQ=255) ggTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCt < 1:358987/149‑1 (MQ=255) gTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGt > 6:318941/1‑146 (MQ=255) gTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCtg < 6:162552/149‑1 (MQ=255) gTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCCTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGt < 5:318941/146‑1 (MQ=255) gggggTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCtgtg < 6:159017/149‑1 (MQ=255) ggggTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCtgtg < 7:101486/148‑1 (MQ=255) gATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTacga > 2:344407/1‑149 (MQ=255) gATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGCCTGTGGTacga > 5:163316/1‑149 (MQ=255) aTGGCTTCCTGGCTGTTGCGGCGCTCGTCGGCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTacga < 8:165171/148‑1 (MQ=255) aTGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTacgac < 8:277911/149‑1 (MQ=255) cTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGcc > 7:116480/1‑148 (MQ=255) ggCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCTGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGAGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATATCGGGCTGGTCTGTGGTACGAAGCCAACGTg > 5:295908/1‑148 (MQ=255) gCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCTATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑Ca < 1:62540/149‑1 (MQ=255) gTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGc > 8:21204/1‑149 (MQ=255) ttGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCt > 7:46592/1‑149 (MQ=255) aGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGc < 6:2151/148‑1 (MQ=255) gcTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTc > 2:10834/1‑148 (MQ=255) gcTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTc > 4:338617/1‑148 (MQ=255) gtcTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACCGTTGATACTCAAGCCCCGATAACCGGCAGGTCTGTGGTACGACCCCAACGTG‑CAGGCTGCCCTCGAACA‑CGc > 1:349572/1‑149 (MQ=255) tcTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGcc > 1:17834/1‑149 (MQ=255) tATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGt > 5:290442/1‑149 (MQ=255) tATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGt > 6:178382/1‑149 (MQ=255) tATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCAGTCGAGCA‑CGCCGt > 5:283292/1‑149 (MQ=255) tgctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTc > 2:47073/1‑149 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCTTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAACCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGGCGTGCTCGa < 6:365405/149‑1 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGACAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTc < 1:10834/148‑1 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGc < 8:46592/145‑1 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGa < 3:338617/149‑1 (MQ=255) gtcgGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACctgg < 6:83009/148‑1 (MQ=255) cGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGTTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTgggg < 6:283292/149‑1 (MQ=255) cGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCtgt > 8:144984/1‑92 (MQ=255) cGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTgggg < 2:17834/149‑1 (MQ=255) cGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTgggg < 1:344407/149‑1 (MQ=255) gTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGCCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CTCCGTGCTCGACCTGGCTggggg < 6:163316/149‑1 (MQ=255) aGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGGTGATACTCAAGCCCCGATAACCGGCTGGTCTGTGGCACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCAt < 1:261065/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGa < 2:248665/149‑1 (MQ=255) ggCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATc > 7:252055/1‑149 (MQ=255) attgagaCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGAt > 1:40399‑M1/8‑148 (MQ=255) atcaaccgttgtacagcgaacgctcgctgctgtactgcgcggttgATACTCAAGCCACGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAAAGTG‑CAGGCTGCCGTAGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCt > 4:216713‑M2/46‑149 (MQ=255) tcaaccgttgtacagcgaacgctcgctgctgtactgcgcggttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTg > 2:327894‑M2/45‑149 (MQ=255) ccAACCGCGCAGTACAGCGGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGCCGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGTGGCGCTCATGCGGATCtt > 6:262965/1‑148 (MQ=255) aaccgttgtacagcgaacgctcgctgctgtactgcgcggttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CCCCGTGCTCGCCCTGGCTGGGGGCGCTCATGCGGATCTGGa > 6:38933‑M2/43‑149 (MQ=255) AACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGGCGTGCTCGAc < 7:92113‑M1/120‑1 (MQ=255) AACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGGCGTGCTCGAc > 8:92113‑M1/1‑120 (MQ=255) ccgttgtacagcgaacgctcgctgctgtactgcgcggttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGACGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATg > 5:370763‑M2/41‑149 (MQ=255) CCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGa < 8:6758‑M1/147‑1 (MQ=255) CCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGa > 7:6758‑M1/1‑147 (MQ=255) ttgtacagcgaacgctcgctgctgtacaacggttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGca > 5:298942‑M2/36‑148 (MQ=255) ttgtacagcGAACGCTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGGCCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACAt > 5:320896/6‑148 (MQ=255) tACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCACCGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGCATCCAGATCCGcatga < 1:94404/149‑4 (MQ=255) cagcagCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAg > 7:214120/1‑149 (MQ=255) catcgagcgTTCGCTGTACAACTGTTGATACTCAAGCCCCGCTATCGGGCTGGGCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCGGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGc < 6:233055/146‑1 (MQ=255) cagcGCGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCACGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACCACGCCAACGGG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGGGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGc < 4:72304/149‑1 (MQ=255) agcgagcgTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTAGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGcc > 3:314431/1‑149 (MQ=255) cgatctgtCGCTGTACAACGGTTGATACTCACGCCCCGATAACGGGCTGGGCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGGCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGcccc < 6:364263/142‑1 (MQ=255) cgTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATc < 1:47073/149‑1 (MQ=255) gTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATAAGGGCCCCGATcc > 7:115208/1‑149 (MQ=255) gCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa < 8:116480/149‑1 (MQ=255) gCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa > 5:365810/1‑149 (MQ=255) tGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa < 8:214120/147‑1 (MQ=255) tGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGt > 6:187916/1‑149 (MQ=255) gTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCC‑CGCCGGGCTCGACCGGGCGGGGGGCGATCATGCGGATCTGGGTGGGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAggt > 4:367292/1‑147 (MQ=255) gttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa > 5:88649‑M2/5‑138 (MQ=255) gttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa < 6:88649‑M2/134‑1 (MQ=255) tgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGAGATTGCGGATATGGATGCGCCCATCAGGGCCCCCATCATTGAGTTCCGCCCGGGc > 7:271623‑M2/3‑149 (MQ=255) | GCGCCTGGATGTCGGCCGGCAGGCGGAAGGTGGGGGTGATGGCTTCCTGGCTGTTGAGGCGCTCGTCGTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGC > NC_002947/693375‑693669 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |