New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1586634 = | 61 (1.010) | 6 (0.100) | 5/254 | NT | 9.2% | coding (772/909 nt) | PP_1391 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 1586683 = | 60 (1.040) | coding (723/909 nt) | PP_1391 | LysR family transcriptional regulator |
AACGCTGCACCAGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGG > NC_002947/1586535‑1586828 | aaCGCTGCACCAGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTgg > 1:151906/1‑149 (MQ=255) aCGCTGCACCAGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGt < 3:82065/149‑1 (MQ=255) gtgcccgtatccggaaacatcagtgccaacgaggtgatgaccctgcaaagggctgcgctggctggcgcaggtatcaccatgctgccaacctacCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGtt > 6:65162‑M1/94‑149 (MQ=255) cACCAGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGtt < 5:89013/148‑1 (MQ=255) cACCAGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGtt < 7:287324/148‑1 (MQ=255) aGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGAGCGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTgg > 1:83898/1‑147 (MQ=255) aGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGt < 1:158156/143‑1 (MQ=255) aGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGt > 2:158156/1‑143 (MQ=255) aGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGgcag > 7:43915/1‑149 (MQ=255) aaTCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATg < 3:74955/149‑1 (MQ=255) cAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGa > 3:283265/1‑149 (MQ=255) aGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGa > 4:205205/1‑148 (MQ=255) cATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTCTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATAc < 3:26729/149‑1 (MQ=255) tgcGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTgcg > 3:71821/1‑149 (MQ=255) cgcAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTgcgc > 6:105089/1‑148 (MQ=255) ggTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCgccagc > 3:115267/1‑147 (MQ=255) tCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCcagccagc > 6:119754/1‑149 (MQ=255) cATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGccc < 8:43915/149‑1 (MQ=255) tgtTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGTTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCttt < 4:23016/148‑1 (MQ=255) tgtTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATTGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCttt < 1:298388/148‑1 (MQ=255) tgtTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCttt < 3:205205/148‑1 (MQ=255) gcgA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGtc < 2:83898/149‑1 (MQ=255) gcgA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGtc < 2:557/149‑1 (MQ=255) gA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGtca > 6:382604/1‑148 (MQ=255) cacCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCg < 5:105089/148‑1 (MQ=255) acCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGtt > 6:178781/1‑149 (MQ=255) acCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGtt > 7:277589/1‑149 (MQ=255) ccGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTg < 4:115267/149‑1 (MQ=255) tCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACt > 3:141465/1‑148 (MQ=255) aGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGAt > 6:121187/1‑149 (MQ=255) aGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGAt < 4:283265/149‑1 (MQ=255) agttcaCGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGtt > 5:288657/1‑134 (MQ=255) agttcaCGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGtt < 6:288657/134‑1 (MQ=255) agttcaCGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTcc < 3:306287/149‑1 (MQ=255) ttcaCGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCgg < 5:121187/149‑1 (MQ=255) aCGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATa > 2:28487/1‑149 (MQ=255) cggggTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCCCCCCGGAGTATGGCGTCTGCGCCCGGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGAGCCAGCCAGCGCAGCCCTGTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATAc > 5:262035/4‑149 (MQ=255) gcgGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCAc > 7:41239/1‑132 (MQ=255) gcgGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCAc < 8:41239/132‑1 (MQ=255) gcgGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACg > 2:66478/1‑149 (MQ=255) gcgGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACg < 4:141465/149‑1 (MQ=255) aacctaccaggccgcagacgccatacgccggggtgaactggtgcgtctgctgcctgGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCAc > 6:65162‑M2/57‑149 (MQ=255) gCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGc < 7:59335/149‑1 (MQ=255) ccTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCg > 3:206655/1‑149 (MQ=255) tCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCGGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCAGATACGGGCACGGCGAc > 6:1268/1‑149 (MQ=255) ggccgcagacgccatacgccggggtgaactggtgcgtctgctgcctgGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACctg > 3:6132‑M2/48‑149 (MQ=255) ggccgcagacgccatacgccggggtgaactggtgcgtctgctgcctgGTAGGTTGGCAGCATGGTGAAACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTcc < 7:88757‑M2/81‑1 (MQ=255) ggccgcagacgccatacgccggggtgaactggtgcgtctgctgcctgGTAGGTTGGCAGCATGGTGAAACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTcc > 8:88757‑M2/48‑128 (MQ=255) gccgcagacgccatacgccggggtgaactggtgcgtctgctgcctgGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACctgc > 6:219354‑M2/47‑149 (MQ=255) GCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACctgc < 1:134351‑M1/149‑1 (MQ=255) gcagACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGtt > 3:30937/1‑109 (MQ=255) gcagACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGtt < 4:30937/109‑1 (MQ=255) aCGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCgg > 3:167396/1‑149 (MQ=255) ccatacgccggggtgaactggtgcgtctgctgcctgGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTa < 4:6132‑M2/113‑1 (MQ=255) aCCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGAc > 1:225699/1‑134 (MQ=255) aCCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGAc < 2:225699/134‑1 (MQ=255) aCCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTAc < 1:28487/149‑1 (MQ=255) aCCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTAGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTAc > 4:135825/1‑149 (MQ=255) aGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACcgc < 6:342027/149‑1 (MQ=255) gTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACcgc > 5:145543/1‑148 (MQ=255) cccccTGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGGAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAAt < 4:20876/148‑1 (MQ=255) aCCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGaaa < 4:206655/148‑1 (MQ=255) aCCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAAt > 3:332438/1‑149 (MQ=255) cccTGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAAt < 5:30382/147‑1 (MQ=255) ccGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGcc < 5:119754/149‑1 (MQ=255) ggCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCcac < 4:71821/149‑1 (MQ=255) gCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCtgt < 4:167396/148‑1 (MQ=255) gCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCtgt < 2:235067/148‑1 (MQ=255) gTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCtgt < 7:105596/146‑1 (MQ=255) gTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCtgt > 8:105596/1‑146 (MQ=255) cGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCg < 5:178781/146‑1 (MQ=255) cGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGaa < 7:269354/148‑1 (MQ=255) cGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGaa < 2:134351/148‑1 (MQ=255) ggCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAg > 5:107505/1‑148 (MQ=255) gcctgGTAGGTTGCCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGGAGGGTCATCACGTCGATGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGCCCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCAAAAGCTGTGTCAGAAg > 5:299736‑M2/6‑147 (MQ=255) ctgGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAgg < 8:277589‑M2/146‑1 (MQ=255) | AACGCTGCACCAGGAAATCCAGCATGCTGCGCAAGGTCGCCGGCATGTGTTTGCGCGA‑CGTATACACCGCATTCAGGTTCAGTTCACGCGGTTTGGCCTCAGGCAGCAGACGCACCAGTTCACCCCGGCGTATGGCGTCTGCGGCCTGGTAGGTTGGCAGCATGGTGATACCTGCGCCAGCCAGCGCAGCCCTTTGCAGGGTCATCACCTCGTTGGCACTGATGTTTCCGGATACGGGCACGGCGACCTGCTGGCCGGCTACCGCGAAATGCCACAAGCTGTGTCCGAAGTAGG > NC_002947/1586535‑1586828 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |