New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2248228 | 66 (1.100) | 4 (0.070) | 3/254 | NT | 5.8% | coding (1371/3297 nt) | PP_1983 | PAS/PAC/GAF sensor‑containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase |
? | NC_002947 | = 2248275 | 66 (1.140) | coding (1324/3297 nt) | PP_1983 | PAS/PAC/GAF sensor‑containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase |
TACCACGGCGACGTTACTCAAGGCCTGTTCGCGGATCACCTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCGGTGATGTCGA > NC_002947/2248132‑2248415 | tACCACGGCGACGTTACTCAAGGCCTGTTCGCGGATCACCTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAAcgccg < 7:115585‑M2/149‑6 (MQ=255) gACGTTACTCAAGGCCTGTTCGCGGATCACCTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGAtct < 5:253025/149‑1 (MQ=255) gTTACTCAAGGCCTGTTCGCGGATCACCTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGa < 2:129473/149‑1 (MQ=255) cTCAAGGCCTGTTCGCGGATCACCTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGaa < 2:270047/149‑1 (MQ=255) tCAAGGCCTGTTCGCGGATCACCTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAAc > 8:354626/1‑149 (MQ=255) aGGCCTGTTCGCGGATCACCTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTgg < 1:187700/149‑1 (MQ=255) tCACCTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCgt < 5:164916/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGACCGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGt‑gtg > 8:271120/1‑149 (MQ=255) tGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGAc > 5:207541/1‑149 (MQ=255) gCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACg > 7:351193/1‑149 (MQ=255) gATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACg > 6:289883/1‑145 (MQ=255) aTACGGTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACg > 7:341418/1‑144 (MQ=255) gTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGAtcggg > 8:60494/1‑149 (MQ=255) gTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGAtcggg > 5:52109/1‑149 (MQ=255) tttCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTg > 3:250832/1‑117 (MQ=255) tttCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTg < 4:250832/117‑1 (MQ=255) tttCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGAtcgggt > 4:36608/1‑149 (MQ=255) gcTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTg > 8:118627/1‑149 (MQ=255) ggcaagACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGAcc < 4:131338/144‑1 (MQ=255) gACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGAtcgggtcgg < 4:313414/140‑1 (MQ=255) gACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGAtcgggtcgg > 3:313414/1‑140 (MQ=255) gACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑A‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCt > 1:282878/1‑149 (MQ=255) cGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTg > 4:62963/1‑148 (MQ=255) aCTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAAc < 6:52109/149‑1 (MQ=255) aCTAGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGaa > 3:369072/1‑148 (MQ=255) tCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACT‑GCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAgg > 6:139618/1‑149 (MQ=255) cccACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTg < 4:369072/149‑1 (MQ=255) cccACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGGCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTg < 3:358622/149‑1 (MQ=255) acaGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGc > 4:118201/1‑148 (MQ=255) ggCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAAc < 7:60494/149‑1 (MQ=255) gCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCTGG‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAAc > 1:237338/1‑149 (MQ=255) gCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑GTCGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAAc > 1:242591/1‑149 (MQ=255) gATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTtct > 5:151665/1‑149 (MQ=255) aTTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTtctc < 6:151665/149‑1 (MQ=255) tCCTCGGCGCTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCtt < 6:367796/148‑1 (MQ=255) ccTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTcc > 1:4753/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTc < 8:351193/148‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTg < 3:139913/123‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTg > 4:139913/1‑123 (MQ=255) cTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTCGCAAACTTCTCTTcc > 6:206998/1‑148 (MQ=255) tCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAAcgccgaggaaatcggcctgtgggccgagtccgtcgagcgcgcgaaacgtatcgagcaggtgatccgcgaacaggccttgagtaacgtcgccgtgg < 4:357284‑M2/148‑96 (MQ=255) tCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAAcgccgaggaaatcggcctgtgggccgagtccgtagaacgcgcgaaacgtatcgagcaggtgatccgcgaacaggcctttagtaacgtcgccgtgg < 2:162176‑M2/148‑96 (MQ=255) tCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTcc > 1:163771/1‑147 (MQ=255) ggcggTACGCCCAAGCACCT‑G‑CTCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCTGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAg < 8:115585/148‑1 (MQ=255) ggcggTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGa < 2:66812/147‑1 (MQ=255) tACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAAcgccgaggaaatcggcctgtgggccgagtccgtcgagcgcgcgaaacgtatcgagcaggtgatccgcgaacaggccttgagtaacgtcgccgtggtactcaac < 2:228221‑M2/149‑104 (MQ=255) ccAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCg > 4:327992/1‑149 (MQ=255) cAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGa > 5:221172/1‑136 (MQ=255) cAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGa < 6:221172/136‑1 (MQ=255) atccgccT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCgtt < 1:22101/144‑1 (MQ=255) atccgccT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCgtt < 1:16018/144‑1 (MQ=255) aGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAAcgccgaggaaatcggcctgtgggccgagtccgtcgagcgcgcgaaacgtatcgagcaggtgatccgcgaacaggccttgagtaacgtcgccgtggtactcaaccaccgcaa > 1:228221‑M2/1‑38 (MQ=255) gCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCgttgt > 4:67785/1‑149 (MQ=255) aCCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTc < 3:36608/149‑1 (MQ=255) aCCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTc < 4:372333/149‑1 (MQ=255) cgcTGCTCCAGCCCTAGGTCTGGGTGAACGCCGTATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTcc < 8:341418/149‑1 (MQ=255) ctgctCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCAc > 8:223889/1‑149 (MQ=255) ctCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCAcc < 7:354626/147‑1 (MQ=255) ctCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCt < 2:4753/148‑1 (MQ=255) tCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGa > 2:143054/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGa > 4:195077/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGa > 5:141621/1‑149 (MQ=255) cAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATc < 2:282878/149‑1 (MQ=255) aGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTg > 6:56766/1‑98 (MQ=255) aGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTg < 5:56766/98‑1 (MQ=255) aGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCg < 3:62963/149‑1 (MQ=255) aGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCg > 6:104785/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCGGt < 2:163771/149‑1 (MQ=255) tCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCGGTGATGTCg < 3:195077/149‑1 (MQ=255) tGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCGGTGATGTc > 3:76296/1‑146 (MQ=255) ggTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCGGTGATGTCGa < 6:141621/146‑1 (MQ=255) gTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGTGGTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCGGTGATGt > 1:268726/1‑143 (MQ=255) gTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCGGTGATGt < 2:268726/142‑1 (MQ=255) | TACCACGGCGACGTTACTCAAGGCCTGTTCGCGGATCACCTGCTCGATACGTTTCGCGCGCTCGACGGACTCGGCCCACAGGCCGATTTCCTCGGCGGTACGCCCAAGCACCT‑G‑CGCGCTGCTCCAGCCGAAGGTCTGGGTGAACGCCGGATTGATCTCGATGAACTGGCCAGTGTCCTGGCGT‑GTGACGCAGATCGGGTCGGGGCTGACCTGGAACAGGCTGGCAAACTTCTCTTCCGAGGCGCTCAGGCGTTGTTCGCGCTCCACCTGATCGGTGATGTCGA > NC_002947/2248132‑2248415 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |