New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2457323 | 72 (1.200) | 5 (0.090) | 4/248 | NT | 6.6% | coding (394/999 nt) | PP_2150 | thiamine biosynthesis lipoprotein |
? | NC_002947 | = 2457369 | 73 (1.290) | coding (440/999 nt) | PP_2150 | thiamine biosynthesis lipoprotein |
AGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCGAGGCCACTGG > NC_002947/2457225‑2457516 | aGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgcac < 5:233897‑M2/149‑5 (MQ=255) aGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgca > 7:9613‑M2/1‑145 (MQ=255) gAGCAGAGCGATGGCGCTTTGGATCTCACCGTAGAGCGATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCTAACGACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCAGTTGCGCGTCaa < 2:42341/149‑1 (MQ=255) aGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCaaa < 2:347225/149‑1 (MQ=255) aGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCaaa < 8:18421/149‑1 (MQ=255) aGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCa > 3:120174/1‑147 (MQ=255) gagCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTc < 6:350616/149‑1 (MQ=255) cGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTCGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGa < 1:231743/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGcc > 4:352818/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGcc > 4:358547/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTCGATCTCACGGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCATCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCtg < 7:41367/149‑1 (MQ=255) ttCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGc > 7:257917/1‑147 (MQ=255) gATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAgg < 8:188516/148‑1 (MQ=255) aCCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgcacttgc < 6:16037‑M2/115‑9 (MQ=255) aCCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgcacttgc > 5:16037‑M2/1‑107 (MQ=255) aCCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgcac < 1:330907‑M2/111‑5 (MQ=255) aCCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgcac > 2:330907‑M2/1‑107 (MQ=255) aCCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGcccc > 5:114327/1‑149 (MQ=255) gCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGc > 8:73784/1‑149 (MQ=255) ccATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATg > 1:116368/1‑136 (MQ=255) ccATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATg < 2:116368/136‑1 (MQ=255) ttGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGa < 8:284481/149‑1 (MQ=255) tCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCtgtg > 3:289109/1‑121 (MQ=255) tCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCtgtg < 4:289109/121‑1 (MQ=255) tCGACTTGCGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACtt > 5:109665/1‑148 (MQ=255) ttGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAg > 8:285104/1‑149 (MQ=255) ttGTGGGGCTTCGGCCCTCAGCCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAAACACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCTTGT‑GGGTTACCAGCACATGCGCCTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCACGACTTCAACAg > 5:306224/1‑149 (MQ=255) ggggCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCAtc < 8:27745/149‑1 (MQ=255) gggCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGATCGACTTCAACAGCAtcg > 2:6731/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCAtcgt < 6:233897/149‑1 (MQ=255) ttCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGc > 8:162639/1‑149 (MQ=255) cGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGcc < 4:134829/148‑1 (MQ=255) cGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGcc < 6:153210/148‑1 (MQ=255) cGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGc < 3:358547/147‑1 (MQ=255) cGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGc < 3:352818/147‑1 (MQ=255) ggCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCGGATCCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTTCCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGTTGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCg < 6:306224/148‑1 (MQ=255) ccTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCa > 8:351578/1‑149 (MQ=255) tCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATg > 1:98019/1‑149 (MQ=255) aGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCACGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATg < 1:272626/147‑1 (MQ=255) aGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATg < 8:257917/147‑1 (MQ=255) gCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGt > 6:45456/1‑149 (MQ=255) gCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGt > 1:8335/1‑149 (MQ=255) ccGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACa < 4:143983/125‑1 (MQ=255) ccGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACa > 3:143983/1‑125 (MQ=255) gTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGAc > 3:312566/1‑149 (MQ=255) tCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACt > 5:76366/1‑149 (MQ=255) tCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACt < 7:351578/149‑1 (MQ=255) aCGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACtt < 7:73784/148‑1 (MQ=255) cGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgcacttgctcgtgacgggcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatggctctacggtgagatcgaaagcgccatcgctctgctcggc < 6:23893‑M2/148‑92 (MQ=255) gAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgcacttgctcgtgacgggcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatggctctacggtgagatcgaaagcgccatcgctctgctcggc < 6:295393‑M2/147‑92 (MQ=255) gAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgcacttgctcgtgacgggcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatggctctacggtgagatcgaaagcgccatcgctctgctcggc < 5:268244‑M2/147‑92 (MQ=255) gAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGAt > 4:105528/1‑149 (MQ=255) gAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGAt > 1:251616/1‑149 (MQ=255) gAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGAt > 8:92962/1‑149 (MQ=255) gAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCATGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGAt > 5:334177/1‑149 (MQ=255) gTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGGTCGCTgc > 3:363537/1‑149 (MQ=255) cccGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTgcgc < 7:285104/148‑1 (MQ=255) aaCCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTg < 1:6731/149‑1 (MQ=255) cacaGTCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCACCTGTGCAGCTAGACTTCAACAGCATCGTAGCAGGTCATGCTGTCGACTTGATCTCTGCGCGCCTGCAg > 1:294265/1‑149 (MQ=255) acaGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAgg > 8:321436/1‑149 (MQ=255) gCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAgcacttgctcgtgacgggcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatggctctacggtgagatcgaaagcgccatcgctctgctcggcaaggtgctgacccaggctgacca > 5:295393‑M2/1‑35 (MQ=255) gCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCAt < 2:98019/149‑1 (MQ=255) gCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCAt < 6:114327/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGTGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATgg > 8:175556/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCCGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATgg > 7:99920/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATgg < 2:283111/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATgg < 4:120174/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATgg < 6:138001/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATgg < 6:109665/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGgtgt > 6:367067/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGgt < 2:251616/147‑1 (MQ=255) gCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGgt < 1:216747/147‑1 (MQ=255) ccAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGgtgt > 4:122295/1‑147 (MQ=255) tGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGt < 6:232048/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGtt < 8:99920/148‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGtt < 7:92962/148‑1 (MQ=255) gcCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCg > 2:15644/1‑114 (MQ=255) gcCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCg < 1:15644/114‑1 (MQ=255) cAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGt > 1:377614/1‑149 (MQ=255) aGCGTGT‑GGGTTACCAgcacttgctcttgtcggtcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatgtctctacggtgagatcgaaagcgccatcgctctgctcggcaaggtgctgacccaggctgaccaacgcgagcatgtcatgcgg > 6:268244‑M2/1‑16 (MQ=255) gtgt‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGcc < 7:162639/149‑1 (MQ=255) gt‑gGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGcc > 7:203858/1‑147 (MQ=255) t‑gGGTTACCAGCACTAGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGATCGACATCAACAGCATCGTCGCCGGTCATCCTGTAGACTTGATCGCAGCGCGCATGCAGCCCATGGGTGACACCAGTTTTTTCTCCTAg > 4:55934/1‑149 (MQ=255) ggTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCGAGGc > 8:292828/1‑149 (MQ=255) cAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCGAGGCCACTgg > 8:97494/1‑149 (MQ=255) | AGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGT‑GGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTGCAGCTCGACTTCAACAGCATCGTCGCCGGTCATGCTGTCGACTTGATCGCTGCGCGCCTGCAGGCCATGGGTGTCAGCAGTTTTGTCGCCGAGGCCACTGG > NC_002947/2457225‑2457516 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |