New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3015001 | 34 (0.560) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 8.5% | coding (1533/2610 nt) | bcsA | cellulose synthase and translocator subunit |
? | NC_002947 | = 3015025 | 33 (0.580) | coding (1557/2610 nt) | bcsA | cellulose synthase and translocator subunit |
ATCAGCCTACCTGAGCATTCCGCAGGCTGCGGGCCTGGCCACTGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCGGCATTGATGATTCTGCTGTACGTGCTGC > NC_002947/3014878‑3015170 | aTCAGCCTACCTGAGCATTCCGCAGGCTGCGGGCCTGGCCACTGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTc > 2:168736/1‑148 (MQ=255) tGAGCATTCCGCAGGCTGCGGGCCTGGCCACTGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGc > 3:41268/1‑149 (MQ=255) gCATTCCGCAGGCTGCGGGCCTGGCCACTGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTAc < 4:332798/149‑1 (MQ=255) cATTCCGCAGGCTGCGGGCCTGGCCACTGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACg > 7:247359/1‑149 (MQ=255) aTTCCGCAGGCTGCGGGCCTGGCCACTGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGc < 1:150033/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGCGGGCCTGGCCACTGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGCGGCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAAcg > 1:278500/1‑149 (MQ=255) cGGGCCTGGCCACTGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGAtgc < 1:168736/147‑1 (MQ=255) tGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTggccg > 8:49069/1‑149 (MQ=255) tGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTggccg > 1:313965/1‑149 (MQ=255) aaaGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTggccggc > 3:189329/1‑149 (MQ=255) tGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCcg > 7:120710/1‑149 (MQ=255) cgcACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTg < 4:41268/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGAGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGtt > 7:243501/1‑149 (MQ=255) ggCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCt > 1:376704/1‑149 (MQ=255) aGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACg > 7:42296/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTg < 2:335731/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTg < 8:247359/149‑1 (MQ=255) cTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTgg < 2:278500/149‑1 (MQ=255) ggCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGt > 5:101912/1‑149 (MQ=255) ggCCCGTGGGATGGTGCAGAGCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCg < 7:263176/148‑1 (MQ=255) ccGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTcc < 2:360444/149‑1 (MQ=255) ccGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTcc > 7:86887/1‑149 (MQ=255) ccGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTcc < 7:49069/149‑1 (MQ=255) aTCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTa > 5:384255/1‑149 (MQ=255) tCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTa < 4:189329/148‑1 (MQ=255) gCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACatcatc < 2:313965/149‑1 (MQ=255) gCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACatcatc < 3:238189/149‑1 (MQ=255) aCCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTa < 6:101912/149‑1 (MQ=255) aCAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCcagcgggttgtcggtgcggaagatctgcaccatcccacgggcccagcgaatgcgctggccgatgtgcgccgacaggctttcagtg < 5:268326‑M2/120‑86 (MQ=255) aCAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCcagcgggttgtcggtgcggaagatctgcaccatcccacgggcccagcgaatgcgctggccgatgtgcgccgacaggctttcagtg > 6:268326‑M2/1‑35 (MQ=255) cccGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCcagcgggttgtcggtgcggaagatctgcaccatcccacgggcccagcgaatgcgctggccgatgtgcgccgacaggctttcagtggccaggcccgcagcctgcggaatgctcaggtag < 8:160356‑M2/149‑119 (MQ=255) cccGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCgg > 1:373599/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCgg > 8:25858/1‑148 (MQ=255) ccGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCgg > 4:248495/1‑148 (MQ=255) ttCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCGGCATtgat > 3:173348/1‑149 (MQ=255) ttCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCGGCATtgat < 8:120710/149‑1 (MQ=255) ccTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCGGCATTGATGATTctgctg > 7:219837/1‑148 (MQ=255) ccTGTTCCAGCGGGTGTGCTACTCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGTCGGCGCCACTGGCGTTGCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCGGCATTGATGATTCTGCTGTACGtgc < 8:243501/149‑1 (MQ=255) tGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCGGCATTGATGATTCTGCTGTACGtgctg > 3:235744/1‑149 (MQ=255) tGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCGGCATTGATGATTCTGCTGTACGtgctg > 8:224275/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCGGCATTGATGATTCTGCTGTACGtgctgc < 3:248495/148‑1 (MQ=255) | ATCAGCCTACCTGAGCATTCCGCAGGCTGCGGGCCTGGCCACTGAAAGCCTGTCGGCGCACATCGGCCAGC‑GCATTCGCTGGGCCCGTGGGATGGTGCAGATCTTCCGCACCGACAACCCGCTGTTCGGGCGTGGCCTTAGCCTGTTCCAGCGGGTGTGCTACGCCAACGCGATGCTGCACTTTCTGGCCGGCCTGCCGCGGCTGGTGTTCCTGACGGCGCCACTGGCGTTCCTGTTGCTGCATGCCTACATCATCTACGCACCGGCATTGATGATTCTGCTGTACGTGCTGC > NC_002947/3014878‑3015170 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |