New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3075535 = | 58 (0.960) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 5.4% | coding (518/723 nt) | PP_2685 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3075568 = | 50 (0.860) | coding (485/723 nt) | PP_2685 | hypothetical protein |
GTAATGCGCTTGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTATCTGGCCGCCGACAAT > NC_002947/3075424‑3075716 | gTAATGCGCTTGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATc > 2:268431/1‑149 (MQ=255) tGCGCTTGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAgg < 4:341631/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGt > 5:60095/1‑149 (MQ=255) caacgtgtatgcacaaggcaatttcttccaggccacaccggacaccccgtttctgcagctgggtgaaagcaagtacggcaggccaatactcgaccgcaacctggattaCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAg > 7:215218‑M1/109‑149 (MQ=255) cgcTTGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCACGGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGt < 1:268431/149‑1 (MQ=255) gcTTGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAGGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTg < 5:321363/149‑1 (MQ=255) gcTTGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTg > 3:83315/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGc > 6:209876/1‑149 (MQ=255) ttGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGAAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCg > 3:232806/1‑149 (MQ=255) cATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCATGGCCAACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGt > 1:88772/1‑149 (MQ=255) acaaggcaatttcttccaggccacaccggacaccccgtttctgcagctgggtgaaagcaagtacggcaggccaatactcgaccgcaacctggattaCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAAt < 4:287142‑M1/37‑1 (MQ=255) acaaggcaatttcttccaggccacaccggacaccccgtttctgcagctgggtgaaagcaagtacggcaggccaatactcgaccgcaacctggattaCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAAt > 3:287142‑M1/97‑133 (MQ=255) gCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCATGGCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTAtt > 1:83833/1‑149 (MQ=255) cTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTgg < 4:183329/149‑1 (MQ=255) ttATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTAc < 6:204152/147‑1 (MQ=255) ttATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACt < 3:151945/148‑1 (MQ=255) tATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACtt < 4:232806/148‑1 (MQ=255) aTTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTg < 6:96480/148‑1 (MQ=255) ttGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCt < 1:105688/149‑1 (MQ=255) cGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCttt < 5:209876/148‑1 (MQ=255) cGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCttt < 6:138196/148‑1 (MQ=255) aGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTg > 7:31347/1‑149 (MQ=255) cccACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCgg > 5:330120/1‑149 (MQ=255) ccACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGgt > 1:29336/1‑149 (MQ=255) cACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCTGgtg > 6:166108/1‑149 (MQ=255) aCCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGgtgt < 4:157689/149‑1 (MQ=255) cGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTgg > 3:335151/1‑149 (MQ=255) aCAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGcc > 8:196835/1‑149 (MQ=255) ggTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTgg < 6:56363/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTgg > 4:3695/1‑147 (MQ=255) tgcGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGgaa < 8:83976/145‑1 (MQ=255) tgcGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGgaa > 7:83976/1‑145 (MQ=255) tggATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAAtt < 3:177112/148‑1 (MQ=255) gATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGc < 6:60095/149‑1 (MQ=255) ggAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGAGAAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGGGGTCGAGTATTGGCCTGGCGTACTTGCTTTCAAACAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGATATTGCCTtgg > 4:223147/1‑147 (MQ=255) gTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCAt < 2:88772/149‑1 (MQ=255) gaacgaaATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATaca > 6:203445/1‑149 (MQ=255) gaacgaaATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATaca > 6:287353/1‑149 (MQ=255) aacgaaATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGc > 4:292008/1‑136 (MQ=255) aacgaaATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGc < 3:292008/136‑1 (MQ=255) acgaaATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTtgt > 5:294828/1‑140 (MQ=255) acgaaATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTtgt < 6:294828/140‑1 (MQ=255) gaaATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGtt > 5:258445/1‑149 (MQ=255) gaaATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGtt > 5:340594/1‑149 (MQ=255) gaaATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGtt < 2:83833/149‑1 (MQ=255) ctggattaccgcacgccgcttgatgaagcgctgcgctgcggTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTg > 7:215218‑M2/42‑149 (MQ=255) attaccgcacgccgcttgatgaagcgctgcgctgcggTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTtgt < 4:287142‑M2/96‑1 (MQ=255) attaccgcacgccgcttgatgaagcgctgcgctgcggTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTtgt > 3:287142‑M2/38‑133 (MQ=255) tcatcaAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGc > 5:114746/1‑149 (MQ=255) catcaAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCgg < 6:258445/147‑1 (MQ=255) atcaAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCTGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCt < 5:166108/148‑1 (MQ=255) atcaAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTa > 2:276725/1‑149 (MQ=255) atcaAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGAGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTa > 3:102973/1‑149 (MQ=255) caAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTATc > 1:37247/1‑149 (MQ=255) aaGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTATCt < 2:306235/149‑1 (MQ=255) aaGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTATCt < 2:37247/149‑1 (MQ=255) gcggcgTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTATCTgg > 1:225082/1‑149 (MQ=255) tgcggTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTATCTGgccgcc > 6:158504‑M2/6‑148 (MQ=255) tAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTATCTGGCCGCCGACaat < 2:225082/149‑1 (MQ=255) | GTAATGCGCTTGCGCGTCATGCTTTCCAGGCTGTTATTGCGGTACACCAGCAAGTCCAGCGGCAT‑GCCCACCGACAGGTTGCTGCGGATGGTGGAGTCGAACGAAATCA‑GGCCGCAGCGCAGCGCTTCATCAAGCGGCGTGCGGTAATCCAGGTTGCGGTCGAGTATTGGCCTGCCGTACTTGCTTTCACCCAGCTGCAGAAACGGGGTGTCCGGTGTGGCCTGGAAGAAATTGCCTTGTGCATACACGTTGTAGATGGCCATGGGGCCGCCGGCTATCTGGCCGCCGACAAT > NC_002947/3075424‑3075716 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |