New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4774255 | 54 (0.900) | 6 (0.100) | 5/254 | NT | 11.0% | coding (5012/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | = 4774300 | 45 (0.780) | coding (4967/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
GGCCAGGTTGGCGAGGCGAACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCTTTCCACCGCCACGCCAACCAGCACTTCCGG > NC_002947/4774152‑4774448 | ggCCAGGTTGGCGAGGCGAACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCAAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGa > 6:191911/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTGGCGAGGCGAACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGAtg > 1:333263‑M2/1‑147 (MQ=255) cAGGTTGGCGAGGCGAACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACGGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGAtgc > 6:165935‑M2/1‑146 (MQ=255) gTTGGCGAGGCGAACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGc > 1:149967/1‑149 (MQ=255) gTTGGCGAGGCGAACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGc < 5:372817/149‑1 (MQ=255) ggcgaggcgaACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTg < 6:106737/148‑1 (MQ=255) gaggcgaACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCt < 8:200834/149‑1 (MQ=255) gaACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATc < 6:251855/149‑1 (MQ=255) gaACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATc < 6:100384/149‑1 (MQ=255) ccACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAg < 7:270374/149‑1 (MQ=255) tCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAg > 5:242417/1‑149 (MQ=255) gggCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCgg > 8:299379/1‑149 (MQ=255) gggCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCgg < 5:238426/149‑1 (MQ=255) gtCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCg > 3:101767/1‑149 (MQ=255) gCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCgg < 7:309396/146‑1 (MQ=255) gCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCgg > 8:309396/1‑146 (MQ=255) gCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGACCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCgg > 6:145976/1‑146 (MQ=255) gCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGACCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCgg < 5:145976/146‑1 (MQ=255) aGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATcc > 4:370052/1‑149 (MQ=255) ccGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCgg < 5:363363/149‑1 (MQ=255) cGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCggg < 4:101767/149‑1 (MQ=255) ccagccaCTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTcc < 6:183302/149‑1 (MQ=255) ccaCTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCg > 4:63741/1‑149 (MQ=255) aCTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGt < 2:258258/149‑1 (MQ=255) tGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATc > 8:151415/1‑96 (MQ=255) tGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATc < 7:151415/96‑1 (MQ=255) cacaGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCtt < 2:303387/149‑1 (MQ=255) cacaGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCtt < 6:242417/149‑1 (MQ=255) aGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAg > 3:40895/1‑149 (MQ=255) aGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAg > 3:227428/1‑149 (MQ=255) cgagcaccTGCCGGTGCCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCCGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGc > 3:258529/8‑149 (MQ=38) gTACCGCTGCCGGCATCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGc > 4:315712/1‑148 (MQ=255) aCCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTCTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCAt > 5:339155/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGGTGCCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATccg > 2:289399/2‑147 (MQ=255) tGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGc > 4:155033/1‑149 (MQ=255) ccggcaccggcaGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATTCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGc < 5:191911/147‑1 (MQ=255) cggcaccggcaGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGAtgccggcagcggtacgtatcctgtgcctggaccaggacgcgcagtggctggccggctatgccgacaccgcccctgaggtggacgttcgcctcgccaacc < 7:307823‑M2/149‑100 (MQ=255) ggcaccggcaGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTAt < 3:63741/149‑1 (MQ=255) gcaccggcaGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGAtgccggcagcggtacgtatcctgtgcctggaccaggacgcgcagtggctggccggctatgccgacaccgcccctgaggtggacgttcgcctcgccaacctg < 4:240508‑M2/149‑102 (MQ=255) gcaccggcaGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGAtgccggcagcggtacgtatcctgtgcctggaccaggacgcgcagtggctggccggctatgccgacaccgcccctgaggtggacgttcgcctcgccaacctg < 6:111779‑M2/149‑102 (MQ=255) caccggcaGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGAtgccggcagcggtacgtatcctgtgcctggaccaggacgcgcagtggctggccggctatgccgacaccgcccctgaggtggacgttcgcctcgccaacctgg < 7:302611‑M2/149‑103 (MQ=255) accggcaGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGAtgccggcagcggtacgtatcctgtgcctggaccaggacgcgcagtggctggccggctatgccgacaccgcccctgaggtggacgttcgcctcgccaacctggc > 5:111779‑M2/1‑46 (MQ=255) gcaGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGt > 6:210653/1‑149 (MQ=255) gaattcgcTCGGCCATTGCTTGATGGCTGAGAAGCAGTCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCTAGGCGGTCGCTCGTGTAATCGGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCTGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGt < 4:228829/144‑1 (MQ=37) cTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGc < 3:155033/149‑1 (MQ=255) tCGGCCACTGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGGCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCAt < 6:67535/125‑1 (MQ=255) tCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGct > 8:298951/1‑149 (MQ=255) gCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGcttct > 2:327700/1‑149 (MQ=255) cAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCttt > 8:66433/1‑149 (MQ=255) aaTGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAAGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCTTTc > 1:282776/1‑149 (MQ=255) tgcttgctGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGTGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCTTTCCa < 1:327700/149‑1 (MQ=255) ttgctGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGAAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCCCCAGTTCCCGGCTTCTTTCCCCcg > 4:313943/1‑149 (MQ=255) ctggctgAGCAGCAGGCCGAtgccggcagcggtacgtatcctgtgcctggaccaggacgcgcagtggctggccggctatgccgacaccgcccctgaggtggacgttcgcctcgccaacctggcctatgtgatctacacctccggttcca > 3:240508‑M2/1‑20 (MQ=255) gctgAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCTTTCCACcgccacgc > 5:25764/1‑149 (MQ=255) agcagGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCTTTCCACCGCCACGCCAACCAg > 8:151271/1‑149 (MQ=255) gcagGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCTTTCCACCGCCACGCCAACCAGc < 4:40895/149‑1 (MQ=255) cagGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCTTTCCACCGCCACGCCAACCAGCa > 7:1548/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCTTTCCACCGCCACGCCAACCAGCACTTCCgg < 4:227428/149‑1 (MQ=255) | GGCCAGGTTGGCGAGGCGAACGTCCACCTCAGGGGCGGTGTCGGCATAGCCGGCCAGCCACTGCGCGTCCTGGTCCAGGCACAGGATACGTACCGCTGCCGGCACCGGCAGGCGCTCGGCCAATGCTTGCTGGCTGAGCAGCAGGCCGATGCCGCTGTCCTCGATCATGTAGGCCAGGCGGTCGCTCGGGTAATCCGGGTCCAGCGGTACATAGGCGCCCCCGGCCTTGAGCACGGCCATCAGGCCTATCACCAGTTCCAGGCTTCTTTCCACCGCCACGCCAACCAGCACTTCCGG > NC_002947/4774152‑4774448 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |