New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4990473 | 54 (0.900) | 5 (0.090) | 5/250 | NT | 8.4% | coding (659/1242 nt) | PP_4399 | glutamine synthetase |
? | NC_002947 | = 4990503 | 58 (1.020) | coding (629/1242 nt) | PP_4399 | glutamine synthetase |
CATGCACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGGTGT > NC_002947/4990355‑4990650 | cATGCACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTgg < 3:159681/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCGGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatg < 4:254918‑M2/149‑6 (MQ=255) aCGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGGTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGCACTGCCGGGCGTCCGCGCACGAGGCTTGGcactg < 8:322737‑M2/149‑6 (MQ=255) cTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGa > 8:265723/1‑149 (MQ=255) cTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGa > 3:13661/1‑149 (MQ=255) tGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGAc > 6:122843/1‑149 (MQ=255) gCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGAcc > 4:183606/1‑149 (MQ=255) gccgATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGt > 4:320003/1‑147 (MQ=255) cgATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGc < 8:261595/149‑1 (MQ=255) aTGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgc > 1:255409‑M2/1‑127 (MQ=255) aTGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgc < 2:255409‑M2/133‑7 (MQ=255) aaTGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGc < 5:15321/149‑1 (MQ=255) tggtggAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCtt < 6:45946/149‑1 (MQ=255) gtggAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGa < 1:124080/149‑1 (MQ=255) gtggAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGa < 7:343327/149‑1 (MQ=255) tggAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAg > 1:137452/1‑149 (MQ=255) tCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCtt < 5:122843/148‑1 (MQ=255) ggCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGa < 3:320003/148‑1 (MQ=255) gCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCtt < 4:51209/148‑1 (MQ=255) gTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACa > 8:197538/1‑149 (MQ=255) tCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAg > 7:23286/1‑149 (MQ=255) aCTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCt < 2:168219/140‑1 (MQ=255) aCTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCt > 1:168219/1‑140 (MQ=255) aCTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAgg < 4:13661/148‑1 (MQ=255) aCTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCAGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGa < 7:197538/149‑1 (MQ=255) aaTCCGGTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGGGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGGCAGCCCGTGCTTGCGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAg < 7:322737/147‑1 (MQ=255) aaTACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAg < 6:201313/147‑1 (MQ=255) aaTACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGt > 7:194839/1‑149 (MQ=255) aTACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTc < 8:23286/149‑1 (MQ=255) cGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTgg < 7:243634/149‑1 (MQ=255) cGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTg < 2:137452/148‑1 (MQ=255) gTTACGGCCGCTGCCGGTCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGt > 2:219904/1‑149 (MQ=255) gTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGt > 3:271099/1‑149 (MQ=255) ttACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTc > 1:362825/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGc > 8:110963/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGc < 3:316674/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCTTACGCGCAAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTAGGca > 2:345300/1‑147 (MQ=255) ccGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAcagca < 4:63440/148‑1 (MQ=255) gCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCgg > 2:61211/1‑149 (MQ=255) ccTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCggg > 8:235703/1‑149 (MQ=255) cTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGTCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGt > 4:152074/1‑149 (MQ=255) gACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGc > 3:191207/1‑149 (MQ=255) cAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGt > 3:144623/1‑149 (MQ=255) gCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGGCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTgca < 7:265723/149‑1 (MQ=255) gTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaaggcctgccgacagaaaccttccaccatttcatcggcgggt < 4:357962‑M2/149‑106 (MQ=255) gTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGt > 7:287609/1‑149 (MQ=255) gTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGt > 2:22776/1‑149 (MQ=255) aaTGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaaggcctgccgacagaaaccttccaccatttcatcggcgggttg < 5:198973‑M2/148‑108 (MQ=255) aaTGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTg < 3:183606/148‑1 (MQ=255) aaTGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGa > 3:119605/1‑149 (MQ=255) tgCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaaggcctgccgacagaaaccttccaccatttcatcggcgggttgcaggc < 7:65098‑M2/149‑113 (MQ=255) aTGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGaa > 5:341679/1‑149 (MQ=255) aTGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGaa < 2:362825/149‑1 (MQ=255) aaCTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTgg < 4:119605/149‑1 (MQ=255) aaCTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTgg < 4:191207/149‑1 (MQ=255) aCTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGGAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGc < 6:341679/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCGTACGCGGCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTGAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGAtctc < 8:241452/138‑1 (MQ=255) gCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCAATGCAGACCACGGTCAGCCAGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGATCAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGAtctc > 7:241452/1‑138 (MQ=255) ccGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaaggcctgccgacagaaaccttccaccatttcatcggcgggttgcaggcgtgcatggccga > 3:357962‑M2/1‑25 (MQ=255) ggCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACAcc < 4:271099/149‑1 (MQ=255) cGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaaggcctgccgacagaaaccttccaccatttcatcggcgggttgcaggcgtgcatggccgacttca > 8:65098‑M2/1‑20 (MQ=255) gTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCAt > 1:365543/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCg > 2:2411/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCg > 3:205413/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCg > 5:261880/1‑149 (MQ=255) cgcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGt < 1:22776/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGt < 3:254918/149‑1 (MQ=255) gcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGGCACCCATTTCGTg > 8:258650/1‑149 (MQ=255) gcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTg > 1:170857/1‑149 (MQ=255) aGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTTCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAATGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCATGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCAt < 1:345300/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAg < 7:110963/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAg > 1:25156/1‑149 (MQ=255) ttGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGgt < 4:144623/149‑1 (MQ=255) ggCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGgt < 6:261880/147‑1 (MQ=255) gCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGgtgt > 6:58941/1‑148 (MQ=255) gCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGgtgt > 1:187307/1‑148 (MQ=255) | CATGCACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGGCCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCGCCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGGTGT > NC_002947/4990355‑4990650 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |