New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5115116 = | 55 (0.910) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 6.6% | coding (670/861 nt) | PP_4500 | TrpH family protein |
? | NC_002947 | 5115188 = | 60 (1.040) | coding (598/861 nt) | PP_4500 | TrpH family protein |
CAGCGCTTGCCAGCAGGCCGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTCACCACGGTC > NC_002947/5115041‑5115332 | cgctcgacgaaaccgttgccacgctgaggcagtccaatgcctgggtgagcctggcgcatcccatgcactacgaccTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAgg > 2:90790‑M1/76‑149 (MQ=255) cTTGCCAGCAGGCCGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTa < 2:147234/149‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGGCCGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAg < 8:215305/142‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGGCCGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAg > 7:215305/1‑142 (MQ=255) gCCAGCAGGCCGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTg > 3:97784/1‑149 (MQ=255) cagcagGCCGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCa > 1:200405/1‑149 (MQ=255) gcagGCCGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATg < 2:30916/149‑1 (MQ=255) ggCCGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGa < 3:152581/149‑1 (MQ=255) ccGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGAGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGACCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGGCAGTTCTTAGTGCATGGGaag > 2:294058/1‑147 (MQ=255) cGAACTGACGTGAAAGGATTGACATTGTGACCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGATTGCTGCGGGTCAGGTAGTATTGCATGGTATg‑c < 6:383526/149‑1 (MQ=255) cGAACTCACGGTCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATg‑c < 7:205627/149‑1 (MQ=255) cGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTACTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATg‑c < 4:90524/149‑1 (MQ=255) aCGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAgg < 4:37425/148‑1 (MQ=255) gggCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATg‑cgc > 2:96210/1‑142 (MQ=255) gggCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATg‑cgc < 1:96210/142‑1 (MQ=255) aGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCa < 7:107471/149‑1 (MQ=255) tGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCa < 2:10247/149‑1 (MQ=255) tGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCACCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGGCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCa < 2:280932/149‑1 (MQ=255) gACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCAtt < 7:155932/149‑1 (MQ=255) gACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCAtt > 2:4090/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACt > 6:368576/1‑149 (MQ=255) gTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGt < 1:317518/109‑1 (MQ=255) gTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGt > 2:317518/1‑109 (MQ=255) cACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCt > 3:76569/1‑147 (MQ=255) cACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCa < 5:368576/149‑1 (MQ=255) cTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGc < 6:335410/149‑1 (MQ=255) cTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGc < 7:208471/149‑1 (MQ=255) cTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTgg < 6:94927/149‑1 (MQ=255) tCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCACGTTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTg > 1:196538/1‑133 (MQ=255) tCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTg < 2:196538/132‑1 (MQ=255) agcagGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCaa > 3:84178/1‑149 (MQ=255) atcCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATGCCGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTtcg < 1:278675/148‑1 (MQ=255) atcCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTtcgtc > 7:101523/1‑149 (MQ=255) tcCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTtcgtc > 2:340193/1‑148 (MQ=255) ccGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGa < 4:84178/148‑1 (MQ=255) ccGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGa < 8:101523/148‑1 (MQ=255) cctgacccgcagcaagcgcaggcggctgattgccgactatattcaggcaggagggcaggcgcttgaagtggtcaGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCg > 2:90790‑M2/75‑149 (MQ=255) GACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTc > 3:20309‑M1/1‑148 (MQ=255) ACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCgg < 2:317833‑M1/149‑1 (MQ=255) cccgcagcaagcgcaggcggctgattcccgactatattcaggcaggagggcaggcgcttcaagtgctcaGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCCCCCAGGCAATGGACTGCCTCAGCGAGGCAACGGTTTCGACGACCGACGGc > 3:306657‑M2/70‑149 (MQ=255) CAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGc < 2:20904‑M1/148‑1 (MQ=255) CAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGc < 8:234580‑M1/148‑1 (MQ=255) CAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCGGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGAGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGc < 5:374596‑M1/148‑1 (MQ=255) ttCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGt > 1:126051/1‑149 (MQ=255) cAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGt‑gc > 1:52995/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGAGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGt‑gctg < 1:323573/149‑1 (MQ=255) gcCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCtt > 4:307480/1‑149 (MQ=255) tGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTACGATTGCTGCGGATCAGGTCGTAATGCATGGGATG‑CGCCAGGATCACCCAGGCATTGGACTGAAACAGCGTGGAAACCGTTTCTACAAACCTCGGCAAGT‑GCTGAttaa > 8:236246/1‑146 (MQ=255) gCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGTCAGT‑GCTGCTTGACg > 6:366137/1‑149 (MQ=255) ctcctGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCg > 1:166843/1‑149 (MQ=255) tcctGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGc > 1:354756/1‑149 (MQ=255) tcctGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGc > 6:33968/1‑149 (MQ=255) ctgcctgATTTTAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGTCTGCGTCAGCATGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGc < 1:294058/147‑1 (MQ=255) gcctgAATTTAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCa < 7:234580/148‑1 (MQ=255) cctgAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGc < 2:200405/149‑1 (MQ=255) ctgAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGAc > 8:11579/1‑138 (MQ=255) ctgAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGAc < 7:11579/138‑1 (MQ=255) ccgactatattcaggcaggagggcaggcgcttgaagtggtcaGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCtt < 1:90790‑M2/106‑1 (MQ=255) tataGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCg < 4:76569/149‑1 (MQ=255) actatattgaggcaggagggcaggcgcttgaagtggtcaGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCGAGGCTCACGCTGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCg < 4:306657‑M2/110‑1 (MQ=255) taGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGTCGCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCg < 1:4090/148‑1 (MQ=255) aGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTgg < 2:340739/93‑1 (MQ=255) aGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTgg > 3:275501/1‑93 (MQ=255) aGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTgg < 4:275501/93‑1 (MQ=255) aGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTgg > 1:340739/1‑93 (MQ=255) gTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGgcgc < 4:97784/149‑1 (MQ=255) ggCAATCCGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCa < 2:288259/149‑1 (MQ=255) ggCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGcc > 5:287292/1‑147 (MQ=255) cAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGc < 2:166843/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCAc > 6:209837/1‑149 (MQ=255) cgcTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGc > 5:369428/1‑149 (MQ=255) gctgcGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTc < 1:20904/147‑1 (MQ=255) tgcGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTcacca > 4:65689/1‑149 (MQ=255) tgcGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTcacca > 4:60697/1‑149 (MQ=255) tgcGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTcacca > 5:66686/1‑149 (MQ=255) cGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTCACCACg < 2:354756/149‑1 (MQ=255) gtcaGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTCACCACGGTc < 6:66686‑M2/145‑1 (MQ=255) gtcaGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTCACCACGGTc < 6:287292‑M2/145‑1 (MQ=255) tcaGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCTGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGc < 1:267415‑M2/104‑1 (MQ=255) tcaGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGc > 2:267415‑M2/4‑107 (MQ=255) | CAGCGCTTGCCAGCAGGCCGAACTCACGGGCAAGGATGGACATGGTGCCCACTTGCTCAGCAGGCATCATCCCGTTGACCAC‑TTCAAGCGCCTGCCCTCCTGCCTGAATATAGTCGGCAATCAGCCGCCTGCGCTTGCTGCGGGTCAGGTCGTAGTGCATGGGATG‑CGCCAGGCTCACCCAGGCATTGGACTGCCTCAGCGTGGCAACGGTTTCGTCGAGCGTCGGCCAGT‑GCTGCTTGACGTCGCCCAGCTTGCCGGCGCCCAGCCACTTGCGAAACGCTTCACCACGGTC > NC_002947/5115041‑5115332 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |