| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 478261 = | 33 (0.530) | 4 (0.080) | 4/206 | NT | 15.2% | intergenic (+9/+101) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
| ? | NC_002947 | 478356 = | 19 (0.400) | intergenic (+104/+6) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase | |||||
GCTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTT > NC_002947/478114‑478391 | cgattacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacc < 6:325099‑M1/1‑1 (MQ=255) gattacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCg > 4:252938‑M1/148‑149 (MQ=255) gattacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCg > 7:322982‑M1/148‑149 (MQ=255) gattacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgggaagccggtggtgcaagccgggctgaccggtccggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCg > 7:317675‑M1/148‑149 (MQ=255) cTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCgg > 5:308349/1‑149 (MQ=255) ttacctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGc > 7:239540‑M1/146‑149 (MQ=255) ctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCctct < 6:372174‑M1/8‑1 (MQ=255) ctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCctct < 8:114814‑M1/8‑1 (MQ=255) gaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTcgc > 8:321033‑M1/138‑149 (MQ=255) aggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTcgcg > 2:386077‑M1/137‑149 (MQ=255) ggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCgg > 3:265540‑M1/136‑149 (MQ=255) gcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCggg < 2:41752‑M1/15‑1 (MQ=255) gcCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGAGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGt > 7:279298/1‑148 (MQ=255) gcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGt < 2:284604‑M1/16‑1 (MQ=255) cGACCTGGTGCATCCGGGTGTTGGCAAGTGCATTGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 5:86137/149‑1 (MQ=255) cGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 7:81125/1‑149 (MQ=255) agcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTaaa > 2:265189‑M1/131‑149 (MQ=255) gACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc > 3:171217/1‑149 (MQ=255) ggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt > 7:114814‑M1/125‑149 (MQ=255) gcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 4:84451‑M1/25‑1 (MQ=255) gcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 5:182417‑M1/26‑1 (MQ=255) gTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCTGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCTGGTAATCCCGCTc < 6:6394/148‑1 (MQ=255) tGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 4:171217/149‑1 (MQ=255) gcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacAGGCCTCTTCGCGCGTTtacccgcgaatag < 7:332939‑M1/30‑7 (MQ=255) aggagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTTTACccgcgaa > 8:332939‑M1/119‑142 (MQ=255) ccGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacgac > 6:145042/1‑149 (MQ=255) ggTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACggg < 8:81125/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTcgc < 1:345505/119‑1 (MQ=255) ggCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAg < 3:106137/148‑1 (MQ=255) tgtgGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGcc > 3:296915/1‑149 (MQ=255) tgGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGAGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGcccc < 8:279298/149‑1 (MQ=255) gCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAg > 8:119842/1‑125 (MQ=255) aGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGGCGGGGCCCCCCCGC‑TGAAGTGTGCCCCCGGTAg > 6:142482/1‑147 (MQ=38) cgcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGc < 7:103758/149‑1 (MQ=255) cggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGc > 1:41752‑M1/77‑149 (MQ=255) ggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCg > 2:5719‑M1/76‑149 (MQ=255) tcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctatCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg > 1:203706‑M1/74‑149 (MQ=255) aggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGt > 7:82605‑M1/72‑148 (MQ=255) gatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCGTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTa > 1:310518/1‑149 (MQ=255) atcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGGTTAcc > 3:65845/1‑149 (MQ=255) tcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCGGTAGGAGCGGGTTTAccc > 4:339110/1‑149 (MQ=255) aGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTCTCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTCTGCCCCCTGTAGGACCGGGTTTACCcg < 5:142482/148‑1 (MQ=255) aGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 4:296915/149‑1 (MQ=255) ggTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGTGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCA‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGATGAGCCCAACCTC‑GGATGTGTGCCCCCGGTATGAGCGGGTTTACCcgc > 5:191251/1‑148 (MQ=39) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGGGTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCGGTAGGCGCGGGGTTTCCCGCGa > 5:325099/1‑149 (MQ=39) aCTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCGTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGGGTCCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag < 5:206280/149‑1 (MQ=255) cTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGCCGCCCGCTTGAGCG‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGTTGTGTCCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 6:308349/149‑1 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg > 6:143471/1‑131 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 5:143471/131‑1 (MQ=255) ccccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACggg > 2:144077/1‑90 (MQ=255) ccccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACggg < 1:144077/90‑1 (MQ=255) gcccTTTGAGTGCCGCGGGTGGCAGTTCCCGCCCGCTGGACCC‑TGTACCGGCCCCTTCGCGGGAAACCCCCCCCCTACCCCGGGCGGAGCCCAACCCC‑TGAGGTGGGCCCCCTGCCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGt < 2:264336/147‑1 (MQ=19) cgcgGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTgg < 5:145042/149‑1 (MQ=255) gggTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGCCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGGGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTaa < 5:115685/149‑1 (MQ=255) gACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAgcgc > 6:182417/1‑149 (MQ=255) cccGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCttt > 3:48579/1‑148 (MQ=255) | GCTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCC‑TGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTC‑TGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTT > NC_002947/478114‑478391 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |