New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 478261 = | 33 (0.530) | 4 (0.080) | 4/206 | NT | 15.2% | intergenic (+9/+101) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
? | NC_002947 | 478356 = | 19 (0.400) | intergenic (+104/+6) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
GGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCG > NC_002947/478213‑478503 | gcccTTTGAGTGCCGCGGGTGGCAGTTCCCGCCCGCTGGACCCTGTACCGGCCCCTTCGCGGGAAACCCCCCCCCTACCCCGGGCGGAGCCCAACCCCTGAGGTGGGCCCCCTGCCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGt < 2:264336/147‑1 (MQ=19) cgcgGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTgg < 5:145042/149‑1 (MQ=255) gggTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGCCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGGGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTaa < 5:115685/149‑1 (MQ=255) gACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAgcgc > 6:182417/1‑149 (MQ=255) cccGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCttt > 3:48579/1‑148 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGGCGTTGACCTTTGAg < 5:68579‑M1/146‑1 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGAAAACCCGCTCCTCCGCCGGGCTCACCCCACCCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAg > 6:68579‑M1/1‑146 (MQ=255) CGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGGGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTc > 7:300442‑M1/1‑146 (MQ=255) GGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAg < 8:210241‑M1/149‑1 (MQ=255) AAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGcc < 4:93253‑M1/149‑1 (MQ=255) acccgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCt > 7:82605‑M2/78‑148 (MQ=255) ACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCt < 1:287620‑M1/148‑1 (MQ=255) ccgctcctacagggggcacacatcaggaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgATAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGa > 1:203706‑M2/77‑149 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGGCTGCGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc > 2:310518‑M1/1‑149 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCctgcc < 1:367478‑M1/149‑3 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc < 3:295215‑M1/149‑1 (MQ=255) cgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAcc > 2:5719‑M2/75‑149 (MQ=255) CGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAcc < 3:15113‑M1/149‑1 (MQ=255) gctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCg > 1:41752‑M2/74‑149 (MQ=255) CCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTc > 4:15113‑M1/1‑149 (MQ=255) CTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGGGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGt > 3:339110‑M1/1‑147 (MQ=255) TACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAg < 4:89557‑M1/149‑1 (MQ=255) CGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAg > 3:89557‑M1/1‑147 (MQ=255) gCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGc > 7:29323/1‑147 (MQ=255) gCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGc > 7:23620/1‑147 (MQ=255) gCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGc < 8:23620/147‑1 (MQ=255) gCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGc < 8:29323/147‑1 (MQ=255) tGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTg > 3:84451/1‑148 (MQ=255) ggAGCCCATCCTCTTTTGTGTCCCCCCTGTCGGCGCGGGTTAACCGGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGc < 7:139446/148‑1 (MQ=255) aGCCCAACCTCTGTTGGGTGCCCCCTGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCAc < 4:48579/149‑1 (MQ=255) ccAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCaa < 3:93253/149‑1 (MQ=255) tctGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCtt > 1:284604/1‑149 (MQ=255) tGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACGTCTAACAGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTAACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCATCCACCAACGGCTTc > 3:53213/1‑148 (MQ=39) aTGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTcaca < 2:287620/149‑1 (MQ=255) tgtgCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATc > 5:372174/1‑148 (MQ=255) gtgCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCa > 3:146623/1‑149 (MQ=255) cccccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCg > 5:372491/1‑149 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTc > 7:288213/1‑149 (MQ=255) ctattcgcgggtaaacgcgcgaagaggcctGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTcgc < 7:332939‑M2/118‑1 (MQ=255) ttcgcgggtaaacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGctcct > 8:332939‑M2/28‑143 (MQ=255) gagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGcgccgc < 5:182417‑M2/123‑1 (MQ=255) agcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGcgccgcc > 7:114814‑M2/26‑149 (MQ=255) agcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGcgccgc < 4:84451‑M2/123‑1 (MQ=255) tttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCgctgct > 2:265189‑M2/20‑149 (MQ=255) acccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCtgctgc < 2:284604‑M2/132‑1 (MQ=255) cccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTgcgc < 2:41752‑M2/134‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGcc > 3:265540‑M2/15‑149 (MQ=255) cgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCt > 2:386077‑M2/14‑149 (MQ=255) gcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTc > 8:321033‑M2/13‑149 (MQ=255) agaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAg < 6:372174‑M2/141‑1 (MQ=255) agaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAg < 8:114814‑M2/141‑1 (MQ=255) gccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTaa > 7:239540‑M2/5‑149 (MQ=255) cgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATc > 4:252938‑M2/3‑149 (MQ=255) cgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATc > 7:322982‑M2/3‑149 (MQ=255) cgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCGGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCACCGGCTTCCCATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATc > 7:317675‑M2/3‑149 (MQ=255) gGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCg < 6:325099‑M2/148‑1 (MQ=255) | GGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAATCG > NC_002947/478213‑478503 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |