| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 620271 = | 68 (1.100) | 5 (0.090) | 5/252 | NT | 6.8% | coding (419/693 nt) | PP_0534 | transcriptional regulator PfeR |
| ? | NC_002947 | 620322 = | 72 (1.230) | coding (368/693 nt) | PP_0534 | transcriptional regulator PfeR | |||||
AGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGCACCACGGGTGAAGC > NC_002947/620124‑620418 | tgccggtcatgctgatgtcggcactaggggccgagcaggaccgcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcgat > 8:348235‑M1/149‑149 (MQ=255)aGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTc > 4:357167/1‑149 (MQ=255) ccggtcatgctgatgtcggcactaggggccgagcaggaccgcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcgaTc > 7:217239‑M1/147‑148 (MQ=255) cggtcatgctgatgtcggcactaggggccgagcaggaccgcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcgaTCGt > 2:127225‑M1/146‑149 (MQ=255) tgtcatgctgatgtcggcactaggggccgagcaggaccgcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcgaTCGTg > 7:308217‑M1/145‑149 (MQ=255) ggtcatgctgatgtcggcactaggggccgagcaggaccgcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcgaTCGTg > 2:226302‑M1/145‑149 (MQ=255) gggTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGGTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTg < 5:329028/148‑1 (MQ=255) tcatgctgatgtcggcactaggggccgagcaggaccgcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcgaTCGTg < 8:308217‑M1/5‑1 (MQ=255) gTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTc > 5:349929/1‑149 (MQ=255) taGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCa < 3:357167/148‑1 (MQ=255) aGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAg > 6:145808/1‑148 (MQ=255) gCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCa > 3:100494/1‑148 (MQ=255) cccTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATc < 4:100494/149‑1 (MQ=255) tgtgCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCAcc > 7:124660/1‑149 (MQ=255) ggtgCAGCACGGTATGGTCCCGGAAGGGCTGGCTCACCGCATCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCCAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAAAGGCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCAcc < 6:202207/148‑1 (MQ=255) ggcactaggggccgagcaggaccgcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgaccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcggTCGTGGTCCAGCATCACCTc < 6:105432‑M1/20‑1 (MQ=255) cagcaCGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTccc > 2:229388/1‑149 (MQ=255) cactaggggccgagcaggaccgcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcgaTCGt < 2:75077‑M1/4‑1 (MQ=255) cactaggggccgagcaggaccgcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcgaTCGt > 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tCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCg < 2:116829/149‑1 (MQ=255) tGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGc < 4:61266/149‑1 (MQ=255) tGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGc < 8:124660/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGt > 4:334086/1‑149 (MQ=255) gcatcagcggcttcacccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcgaTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCg < 5:284868‑M1/43‑1 (MQ=255) 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ttCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATg > 4:338143/1‑149 (MQ=255) ccgtggtgcagacgactacctgcccaagcccttcagcctggcggagctggacgcacgggtggatgccttgctgcgtcgcgtggcattcggTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGc > 5:105432‑M1/91‑149 (MQ=255) gtcgGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCCAATGCCa > 3:197935/1‑149 (MQ=255) tcgGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCAc < 4:93215/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACgca < 5:132296/149‑1 (MQ=255) 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cc‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTa < 8:266234/149‑1 (MQ=255) cc‑GTTGTGGATAACGGCCTGGCGGTCGTGGGCCAGCATCACCTCCCCCCCGGCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTa < 5:131377/149‑1 (MQ=255) tgGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAgtcgtc > 3:89141/1‑149 (MQ=255) aaCGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGcac > 1:335269/1‑149 (MQ=255) aaCGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGcac < 6:180825/149‑1 (MQ=255) aCGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGcac < 6:388148/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGCACCACgg < 4:197935/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGCACCACgg < 1:229388/148‑1 (MQ=255) ggCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGCACCACGGGt > 6:150709/1‑148 (MQ=255) gCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGCACCACGGGt < 4:89141/147‑1 (MQ=255) gCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGCACCACGGGTg > 6:235054/1‑148 (MQ=255) gTCGTGGTGCAGGATCGCCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGGGCCACGGTCGAATGCCCCGCGGCGCAGGAGGGCATCCGCCCGTGCGTCCAGGTCCGCCAGGGGGAGGGGGGTGGGGAGGTAGTGGGCTGCACCGCGGGGGAGGc > 8:73324/1‑149 (MQ=255) | AGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCAGCAGCGTGACCAGCAAGCGGAATTCGGAAGCGGTAAGGCCAGCGGCGTTGCC‑GTTGTGGATAACGTCCTGGCGGTCGTGGTCCAGCATCACCTCCCCCACGTCGGCACGCAGCGCCGTACCACGATCGAATGCCACGCGACGCAGCAAGGCATCCACCCGTGCGTCCAGCTCCGCCAGGCTGAAGGGCTTGGGCAGGTAGTCGTCTGCACCACGGGTGAAGC > NC_002947/620124‑620418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |