| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1249666 = | 53 (0.850) | 6 (0.100) | 5/256 | NT | 9.8% | coding (563/624 nt) | bvgA | virulence factors transcription regulator BvgA |
| ? | NC_002947 | 1249703 = | 60 (1.010) | coding (600/624 nt) | bvgA | virulence factors transcription regulator BvgA | |||||
CGAGACGGATATGGTGAATCGCCTTTCTGCGCGAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATC > NC_002947/1249520‑1249812 | ggaagaacggcgcctgcaggagcagttggccgatttcgattacgacctgtagtgcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgatcagttcagaccttgccgttgcgccAg < 4:117135‑M1/2‑1 (MQ=255) gaagaacggcgcctgcagaagcagttggccgatttcgattacgacctgtagtgcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgatcagttcagaccttgccgttgcgccAGc < 1:244941‑M1/3‑1 (MQ=255) gaagaacggcgcctgcagaagcagttggccgatttcgattacgacctgtagagcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgatcagttcagactttgccgttgcgccAGc < 2:35585‑M1/3‑1 (MQ=255) gaCGGATATGGTGAATCGCCTTTCTGCGCGAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTgctcaagctc > 6:10994/1‑148 (MQ=255) gaacggcgcctgcagaagcagttggccgatttcgattacgacctgtagtgcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgatcagttcagaccttgccgttgcgccAGCTc < 7:160132‑M1/5‑1 (MQ=255) gcctgcagaagcagttggccgatttcgattacgacctgtagtgcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgatcagttcagaccttgccgttgcgccAGCTCAATG‑CACg < 1:58061‑M1/13‑1 (MQ=255) ggTGAATCGCCTTTCTGCGCGAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGt > 1:137078/1‑149 (MQ=255) tgcagaagcagttggccgatttcgattacgacctgtagtgcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgatcagttcagaccttgccgttgcgccAGCTCAATG‑CACGGt < 8:311683‑M1/15‑1 (MQ=255) cGCCTTTCTGCGCGAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGt > 5:254290/1‑149 (MQ=255) cgcgAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGAt < 7:140567/148‑1 (MQ=255) cgAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGAGCGa > 1:139830/1‑149 (MQ=255) tcgattacgacctgtagtgcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgatcagttcagaccttgccgttgcgccAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGc > 7:311683‑M1/113‑148 (MQ=255) gattacgacctgtagtgcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgatcagttcagaccttgccgttgcgccAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTgg > 8:238892‑M1/111‑149 (MQ=255) gattacgacctgtagtgcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgagcagttcagaccttgccgttgcgccAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTgg > 5:274451‑M1/111‑149 (MQ=255) aTGACGGTGCTGCAACAACTGGCTCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGgc < 5:259479/149‑1 (MQ=255) attacgacctgtagtgcgggtcccgtagtcatggaccgatagccctggcaaagcctcctggctggaggcttcaaggcttggcgatcagttcagaccttgccgttgcgccAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGgc > 2:58061‑M1/110‑149 (MQ=255) ctgcAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGc < 6:254290/148‑1 (MQ=255) caacaaGTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAg < 3:376243/148‑1 (MQ=255) caacaaCTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGGCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAg < 2:196508/148‑1 (MQ=255) cTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGaa < 2:298659/149‑1 (MQ=255) gcgAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGANCAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAAGTCTGAACTGa > 1:35585/1‑149 (MQ=255) aGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGc < 6:117952/149‑1 (MQ=255) gggCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGcc < 5:10994/149‑1 (MQ=255) gTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGc > 8:129466/1‑149 (MQ=255) aCAAGGAGATCGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGaa < 6:104598/149‑1 (MQ=255) aaGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTg > 3:211032/1‑94 (MQ=255) aaGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTg < 4:211032/94‑1 (MQ=255) aaGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGc > 8:273746/1‑149 (MQ=255) aGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGcc > 5:240131/1‑149 (MQ=255) ggAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCt > 2:115457/1‑149 (MQ=255) ggAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCt < 2:137078/149‑1 (MQ=255) gagaTTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTc > 5:244568/1‑149 (MQ=255) gaTTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTc > 8:68270/1‑147 (MQ=255) ttGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTccagc > 2:214607/1‑149 (MQ=255) ccGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTccagccag > 6:135040/1‑149 (MQ=255) gccAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTCGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCagga < 4:69477/147‑1 (MQ=255) cAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCaggagg < 2:139830/149‑1 (MQ=255) aGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGc > 6:82456/1‑149 (MQ=255) cATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCtt > 8:160132/1‑149 (MQ=255) cATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCtt < 1:115457/149‑1 (MQ=255) cATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCtt > 2:178251/1‑149 (MQ=255) tACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGc < 5:158936/148‑1 (MQ=255) tACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGc < 7:129466/148‑1 (MQ=255) ccTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAg > 2:244941/1‑149 (MQ=255) cAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGACACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGCCGAAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAggg > 1:295629/1‑149 (MQ=255) aGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAggg < 5:82456/147‑1 (MQ=255) aaGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGt < 7:273746/149‑1 (MQ=255) aCGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCa < 2:369628/149‑1 (MQ=255) aCGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCa > 1:348952/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGcc < 6:135633/113‑1 (MQ=255) cGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGcc > 5:135633/1‑113 (MQ=255) cGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCAt < 1:352427/149‑1 (MQ=255) tACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGAc > 3:174670/1‑149 (MQ=255) cAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGAc < 3:329679/147‑1 (MQ=255) aaGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCg > 3:147306/1‑149 (MQ=255) aaGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCg > 8:149856/1‑149 (MQ=255) aCGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTa > 6:258788/1‑149 (MQ=255) gctgctgctCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAg < 7:68270/149‑1 (MQ=255) ctgctgctCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAgg < 6:244568/149‑1 (MQ=255) tgctgctCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGt > 2:19473/1‑149 (MQ=255) ctgctCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAg < 7:340151/85‑1 (MQ=255) ctgctCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAg > 8:340151/1‑85 (MQ=255) ctgctCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTc < 1:178251/148‑1 (MQ=255) ctgctCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTc < 6:240131/148‑1 (MQ=255) ctcaagctcaaTG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCAAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCTCACAACAGGTctaa > 8:319594/1‑145 (MQ=255) caagctcaaTG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATc > 3:117135/1‑149 (MQ=255) aagctcaaTG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTa < 3:279116/122‑1 (MQ=255) aagctcaaTG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTa > 4:279116/1‑122 (MQ=255) aagctcaaTG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTaa < 2:295629/146‑1 (MQ=255) | CGAGACGGATATGGTGAATCGCCTTTCTGCGCGAGAAATGACGGTGCTGCAACAACTGGCGCGAGGGCGTTCGAACAAGGAGATTGCCGA‑CAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATG‑CACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATC > NC_002947/1249520‑1249812 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |