New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1387788 = | 66 (1.060) | 5 (0.080) | 5/254 | NT | 7.8% | intergenic (+14/+108) | PP_1208/PP_1209 | SlyX family protein/cold‑shock protein |
? | NC_002947 | 1387876 = | 55 (0.930) | intergenic (+102/+20) | PP_1208/PP_1209 | SlyX family protein/cold‑shock protein |
AATGACGTGGTGGTGGAGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGG > NC_002947/1387640‑1387935 | tgcactttcgggccatccgcggtgagggccaccgcattctggtcgaaggccagcgcgtggagttttcggtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacg < 1:234767‑M1/1‑1 (MQ=255) aTGACGTGGTGGTGGAGCAAGCGTGGGTGTTCGAGCTGCTGCAATTGCAGATGGCCTAGCTGATGAAGGGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGgctg < 5:393182/148‑1 (MQ=255) actttcgggccatccgcggtgagggccaccgcattctggtcgaaggccagcgcgtggagttttcggtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTa < 2:69839‑M1/4‑1 (MQ=255) ctttcgggccatccgcggtgcgggccaccgcattctggtcgaaggccagcgcgtggagttttcggtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTAt > 6:234878‑M1/145‑149 (MQ=255) aCGTGGTGGTGGAGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGATGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTAt > 4:136628/1‑149 (MQ=255) tttcgggccatccgcggtgagggccaccgcattctggtcgaaggccagcgcgtggagttttcggtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTAt < 5:239532‑M1/5‑1 (MQ=255) tttcgggccatccgcggtgagggccaccgcattctggtcgaaggccagcgcgtggagttttcggtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTATc < 2:70462‑M1/6‑1 (MQ=255) tggtggtggAGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGc < 1:214882/149‑1 (MQ=255) tcgggccatccgcggtgagggccaccgcattctggtcgaaggccagcgcgtggagttttcggtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTATc > 6:253584‑M1/142‑147 (MQ=255) gtggtggAGCAAGCTCGGGTGATCGAGCGGCTTCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCg < 3:76578/149‑1 (MQ=255) ggtggAGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCgg > 7:318432/1‑148 (MQ=255) gtggAGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGc > 3:102071/1‑148 (MQ=255) tggAGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCaa < 8:173378/149‑1 (MQ=255) gAGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAagc < 3:356584/149‑1 (MQ=255) gAGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAagc < 1:368839/149‑1 (MQ=255) aGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAagc > 5:285557/1‑148 (MQ=255) cAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAagccag > 2:28887/1‑149 (MQ=255) aaGCGCGGGTGATCGTGCGGCTGCATTTGCAGTTGGCCGAGCTTATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGACAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAagctggc < 3:55944/149‑5 (MQ=255) cgcgGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGcccc > 3:201555/1‑149 (MQ=255) ggccaccgcattctggtcgaaggccagcgcgtggagttttcggtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCca < 5:18309‑M1/25‑1 (MQ=255) gTGATGGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAg < 2:95789/149‑1 (MQ=255) gTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAg < 6:285557/149‑1 (MQ=255) gTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAg < 2:127359/149‑1 (MQ=255) gCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTatgatg > 7:95917/1‑149 (MQ=255) ggCTGCAATTGCAGATGGCCGATCTGTTCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGATGAGGCCCCGCCTCGTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGAtgct < 1:240767/149‑1 (MQ=255) ggCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGAtgct < 5:121556/149‑1 (MQ=255) gCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGAtgctg > 1:252488/1‑149 (MQ=255) cTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGAtgctgc > 5:141644/1‑149 (MQ=255) cAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCtt > 5:175866/1‑149 (MQ=255) cAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCACCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCGGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCtt < 1:264086/149‑1 (MQ=255) aaTTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCtt > 7:287993/1‑148 (MQ=255) cAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGt < 6:175866/148‑1 (MQ=255) cAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTg > 4:262256/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGTTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGTGGAAGTGGTCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGTCTTCTATCGCCTGCAATCCAGCCCCCAGAGTTATGATTCTGACTTCATGTgca < 2:66291/149‑1 (MQ=255) tGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTgcagc < 1:28887/149‑1 (MQ=255) tGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTgcagc < 2:252698/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACg > 2:27626/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACgg > 6:248676/1‑149 (MQ=255) gagttttcggtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGccc > 1:70462‑M1/90‑149 (MQ=255) aTCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAagccagcc > 7:322901/1‑106 (MQ=255) aTCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAagccagcc < 8:322901/106‑1 (MQ=255) aTCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCtt < 8:287993/147‑1 (MQ=255) aaGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCACCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTgg < 1:197215/148‑1 (MQ=255) gtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGgcg < 7:60750‑M1/69‑1 (MQ=255) gCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGgcg > 5:317091/1‑149 (MQ=255) tgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGgcgc > 8:60750‑M1/80‑149 (MQ=255) cGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGgcgc < 2:252488/149‑1 (MQ=255) aTGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTTAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTgg < 8:165820/148‑1 (MQ=255) gagaTGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGcc < 4:201555/149‑1 (MQ=255) tGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTg < 6:367269/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGa > 6:30525/1‑148 (MQ=255) gTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGa > 6:240404/1‑148 (MQ=255) gTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGa > 6:202096/1‑148 (MQ=255) ggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccgccgttgaccaacggctgaccggccgacGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAg > 6:18309‑M1/63‑149 (MQ=255) ggCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGc > 3:5798/1‑149 (MQ=255) gCCATTTTGGCAGCGAAGGGGTTGAGGCGCCGCCTCCTCTTTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCg < 2:268129/149‑1 (MQ=255) cAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTc > 1:354323/1‑149 (MQ=255) gTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCgg > 8:37368/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCg < 5:240404/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCgg > 7:125470/1‑149 (MQ=255) cAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGt > 1:75302/1‑148 (MQ=255) cGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGc < 5:202096/149‑1 (MQ=255) aaGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCg < 1:27626/149‑1 (MQ=255) aaGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCg < 3:262256/149‑1 (MQ=255) gggAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTg < 8:95917/149‑1 (MQ=255) gggAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTg > 5:6782/1‑149 (MQ=255) agagGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCAGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCGTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGGCGGCCGGTCAGCCGTTGGtgc > 8:364163/1‑147 (MQ=255) agGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAAc < 2:75302/149‑1 (MQ=255) agGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAAc < 4:102071/149‑1 (MQ=255) ggCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAAcg < 6:141644/149‑1 (MQ=255) ctcATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTAc < 4:5798/147‑1 (MQ=255) ctcATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTAc < 5:30525/147‑1 (MQ=255) ctcATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACt < 6:317091/148‑1 (MQ=255) ctcATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTg > 6:148634/1‑149 (MQ=255) tcATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTg > 1:389406/1‑148 (MQ=255) cATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGc > 6:237965/1‑148 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCAc > 7:332836/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGc < 8:318432/148‑1 (MQ=255) cAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCt > 6:44909/1‑149 (MQ=255) aGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTg < 2:354323/149‑1 (MQ=255) ggCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGc < 5:248676/149‑1 (MQ=255) tgctATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAgg > 6:87991/1‑149 (MQ=255) | AATGACGTGGTGGTGGAGCAAGCGCGGGTGATCGAGCGGCTGCAATTGCAGATGGCCGAGCTGATCAAGCGTCATGAAGAGATGGTTGGCCAGTATGGCAGCGAAGGGGAAGAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGG > NC_002947/1387640‑1387935 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |