New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 1444115 | 71 (1.150) | 6 (0.100) | 6/250 | NT | 8.3% | coding (71/948 nt) | PP_1262 | LysR family transcriptional regulator |
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GAATCTGTTCGCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAG > NC_002947/1443969‑1444262 | gAATCTGTTCGCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGcgcc > 4:363976/1‑149 (MQ=255) tGTTCGCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCTCAATGCGGCGGGTGGTAAGGTTGAGCAGACTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACAGCCCTCGACACGTTCTCGGTGGTAGTATACAGTTGagcagcagc > 5:351569/1‑149 (MQ=37) gTTCGCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCg > 8:202144/1‑149 (MQ=255) 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aTCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCt > 7:316593/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCAGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCt > 5:98002/1‑149 (MQ=255) aGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGc < 2:72939/148‑1 (MQ=255) ggTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGtagcccaactcggcagcttcact > 7:306317‑M1/1‑126 (MQ=255) gTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACCCGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCCGCGGCAGTGAAGCTGcc > 8:302771/1‑147 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |