New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1444115 | 71 (1.150) | 6 (0.100) | 6/250 | NT | 8.3% | coding (71/948 nt) | PP_1262 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1444148 | 66 (1.130) | coding (38/948 nt) | PP_1262 | LysR family transcriptional regulator |
CCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCTGTTTTGGTAACAAAGATT > NC_002947/1444001‑1444293 | ccGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTAc < 5:87459‑M2/149‑2 (MQ=255) ccGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTAc > 1:350926‑M2/1‑148 (MQ=255) gCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTAcgc < 5:254640‑M2/148‑4 (MQ=255) tCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGa > 7:90513/1‑147 (MQ=255) aGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAg < 2:30161/148‑1 (MQ=255) cAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACg > 5:155433/1‑148 (MQ=255) aaTGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCa > 3:301786/1‑149 (MQ=255) cggcggGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGt < 5:51013/148‑1 (MQ=255) gggTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGc < 6:87459/149‑1 (MQ=255) tgtggtACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGTGCTTCCAGTTTTGAGACAGCCCTCGAAACGTTCGCGGTGGTCTTATCCAGTTGCGCAGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACTCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCa < 6:351569/148‑1 (MQ=255) tggtACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAgg < 8:90513/149‑1 (MQ=255) tggtACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCCCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAgg < 8:86806/149‑1 (MQ=255) gTTTAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGTCTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTcc < 1:74620/149‑1 (MQ=255) ttGAGCAGCCTTGTGTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCAt > 7:328807/1‑149 (MQ=255) atgatccTTGGTTGCAGTTGGGGATTCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATgg < 4:81624/143‑1 (MQ=255) agcagcCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATgg < 3:363976/148‑1 (MQ=255) gcagcCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGt > 5:204349/1‑149 (MQ=255) cagcCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGt > 6:45152/1‑148 (MQ=255) ttGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGtt > 6:46683/1‑124 (MQ=255) ttGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGtt < 5:46683/124‑1 (MQ=255) ttGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCActct > 8:144457/1‑149 (MQ=255) gCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAgg > 7:194621/1‑148 (MQ=255) cAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTa < 8:328807/149‑1 (MQ=255) aGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAgg > 8:74988/1‑146 (MQ=255) aTGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTagag > 5:388298/1‑149 (MQ=255) aTGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGAACGCATGTTTTGCAGTGTGTCCATGGTTCACTCTCGAGGTagag < 6:98002/149‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGa > 3:260176/1‑148 (MQ=255) cTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACa > 7:272258/1‑148 (MQ=255) ttCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCAGGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACaa > 7:346955/1‑148 (MQ=255) ggTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATtgt < 7:202144/149‑1 (MQ=255) gTTGGAGACCGCCCGCGACACTTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TTGTCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATtgtg < 8:316593/149‑1 (MQ=255) gTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTaga < 7:229/136‑1 (MQ=255) gTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTaga > 8:229/1‑136 (MQ=255) ggAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTc < 3:235645/148‑1 (MQ=255) ggAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTc < 4:260176/148‑1 (MQ=255) agaCCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACg < 6:204349/149‑1 (MQ=255) gaCCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACg > 6:224271/1‑148 (MQ=255) aCCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTTACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGaa < 4:301786/149‑1 (MQ=255) aCCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGaa < 5:45152/149‑1 (MQ=255) aCCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGaa < 7:144457/149‑1 (MQ=255) cgcgACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACt > 2:167949/1‑149 (MQ=255) gcgACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACtt < 5:56495/149‑1 (MQ=255) acGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAgg < 2:12431/90‑1 (MQ=255) acGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAgg > 1:12431/1‑90 (MQ=255) acGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGaaa < 6:254640/149‑1 (MQ=255) acGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGaa > 1:267768/1‑148 (MQ=255) cGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGaaaa < 8:272258/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAgaga > 2:304818/1‑148 (MQ=255) gtCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGtt < 8:194621/149‑1 (MQ=255) cGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGc > 7:317415/1‑149 (MQ=255) gTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGc < 5:305306/148‑1 (MQ=255) tATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggacgcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgtaccacccgccgcattgcgct < 7:293105‑M2/148‑104 (MQ=255) tATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCt > 5:43059/1‑149 (MQ=255) aTCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACtt > 3:47829/1‑127 (MQ=255) aTCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACtt < 4:47829/127‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTATTGCAGGGTGTCCATGGCTCACTCTCGAGCTAGAGGACAAAATTCTGTCACGAAGTAACATGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTc > 8:122368/1‑149 (MQ=255) ccAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgtaccacccgccgcattgcgctgacc < 5:85918‑M2/149‑108 (MQ=255) ccAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTc < 7:74988/148‑1 (MQ=255) ccAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACGTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTc > 5:290096/1‑148 (MQ=255) cAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgtaccacccgccgcattgcgctgacc < 8:306317‑M2/148‑108 (MQ=255) cAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGa < 1:304818/149‑1 (MQ=255) aGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgtaccacccgccgcattgcgctgaccg < 8:64593‑M2/148‑109 (MQ=255) aGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGAc > 1:333476/1‑149 (MQ=255) aGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGAc > 8:225558/1‑149 (MQ=255) ccgcAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGc < 6:43059/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGa > 7:327342/1‑149 (MQ=255) ggCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTAt > 5:318459/1‑149 (MQ=255) ggCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTAt > 7:185995/1‑149 (MQ=255) gCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATc < 7:225558/149‑1 (MQ=255) aGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgtaccacccgccgcattgcgctgaccgaagccggcaagcgttacc > 7:306317‑M2/1‑23 (MQ=255) gTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCt > 7:219525/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCTGt > 7:339027/1‑149 (MQ=255) gCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCTGTTTTgg > 1:73782/1‑148 (MQ=255) ccGAGT‑TGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgtaccacccgccgcattgcgctgaccgaagccggcaagcgttacctgatgcgtt > 6:85918‑M2/1‑13 (MQ=255) ccGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCTGTTTTgg < 6:260455/147‑1 (MQ=255) ccGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCTGTTTTgg > 5:260455/1‑147 (MQ=255) gAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCTGTTTTGGTaa > 5:306477/1‑148 (MQ=255) ggCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCTGTTTTGGTAACAAAGAt < 6:388298/149‑1 (MQ=255) gCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCTGTTTTGGTAACAAAGAtt > 8:144892/1‑149 (MQ=255) | CCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCAGTGAAGCTGCCGAGT‑TGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACCAAAGGCGGATTATCGCTGTTTTGGTAACAAAGATT > NC_002947/1444001‑1444293 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |