New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1506411 | 63 (1.020) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.6% | coding (312/780 nt) | petC | ubiquinol‑‑cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit |
? | NC_002947 | = 1506453 | 75 (1.260) | coding (354/780 nt) | petC | ubiquinol‑‑cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit |
GTGCCAAGTTCCAGCGCTACGAGCGGGTGGCTGACGACCTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGG > NC_002947/1506263‑1506559 | gTGCCAAGTTCCAGCGCTACGAGCGGGTGGCTGACGACGTTGGTATCACTCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGT < 4:291165‑M1/149‑1 (MQ=255) ccAAGTTCCAGCGCTACGAGCGGGTGGCTGACGACCTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGtgct > 4:313087/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGCTACGAGGGTGTGGATGACGACCTTGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATGGGTATGAAGCCCAGCTACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGcgcc < 7:161104/148‑1 (MQ=255) aGCGCTACGAGCGGGTGGCTGACGACCTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTaccgcgcacgcg > 3:204198‑M1/1‑137 (MQ=255) cgcTTCGAGCGGGTGGCTGACGAGCTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCAGAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCTGTATGAAGCCCAGCGACGCCATGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGa < 1:380640/149‑1 (MQ=255) gggTGGCTGACGACCTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTg < 6:57576/149‑1 (MQ=255) ggCTGACGACCTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTc > 4:295777/1‑148 (MQ=255) ggCTGACGACCTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTc < 3:295777/148‑1 (MQ=255) acgacCTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGccc < 3:313087/147‑1 (MQ=255) cTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGATGAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGCCCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGCCACGGGTCGCCCGCGTgc > 1:30032/1‑149 (MQ=255) ggTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGcgcg < 4:57179/148‑1 (MQ=255) tATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTa < 1:189689‑M2/149‑2 (MQ=255) tCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTaccgcgcacgcgggcgaccagtgtcaggtcgggcggcgcagcac < 4:204198‑M1/148‑45 (MQ=255) gCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGAtt < 2:53342/149‑1 (MQ=255) gCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGAtt < 6:112742/149‑1 (MQ=255) gAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCt > 8:218445/1‑149 (MQ=255) aaCTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGCGCCAAGATCGGTGACCACATCCATATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCt < 8:171040/148‑1 (MQ=255) aTGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATTGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTac < 6:195522/147‑1 (MQ=255) gCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACacc > 5:362084/1‑148 (MQ=255) cTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACaccta < 2:48668/149‑1 (MQ=255) tCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTaccgcgcacgcgggcgaccagtgtcaggtcgggcggcgcagcaccg < 2:78056‑M1/132‑47 (MQ=255) tCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTaccgcgcacgcgggcgaccagtgtcaggtcgggcggcgcagcaccg > 1:78056‑M1/1‑86 (MQ=255) tCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACacctac > 2:69941/1‑149 (MQ=255) tCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTCGTCCCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTATACacctac > 1:380860/1‑149 (MQ=255) gaAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTgc < 6:14659/149‑1 (MQ=255) tGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCt < 5:296823/130‑1 (MQ=255) tGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCt > 6:296823/1‑130 (MQ=255) tGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGt > 4:207074/1‑149 (MQ=255) gtgtTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGCCCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGttt > 6:275651/1‑149 (MQ=255) gtgtTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGttt < 3:207074/149‑1 (MQ=255) gtgtTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGttt < 6:362084/149‑1 (MQ=255) tgtTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTc > 3:320785/1‑149 (MQ=255) ttCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCTGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCGGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTa < 7:237311/149‑1 (MQ=255) ttCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCt < 8:294904/148‑1 (MQ=255) tCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTAt > 1:246290/1‑149 (MQ=255) tCACAGGTGCCAAGATCGGTCACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACATCGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGCTACCGATTGGCTTTACACCTACCTCCGCAGTTTCTAt > 6:163885/1‑149 (MQ=255) cacaGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTAt < 3:341134/148‑1 (MQ=255) cacaGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTAt > 4:341134/1‑148 (MQ=255) acaGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGa < 2:256406/149‑1 (MQ=255) gTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGAc > 5:211851/1‑149 (MQ=255) gCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACGTGCGCAGTTTc < 4:377401/138‑1 (MQ=255) gCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTc > 3:377401/1‑138 (MQ=255) cAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCAt > 7:126726/1‑149 (MQ=255) aaGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGTCTTTACACCTACATGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATc > 5:374116/1‑149 (MQ=255) ggTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGccc > 5:298430/1‑149 (MQ=255) gTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTCGTCGCCCGCGTGCGCCGTACCGAATGGCTTTACACCTACCTGCGCAGATTCTATGAGGACCCATCCCGccc > 7:45490/1‑148 (MQ=255) ccACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGt > 2:174900/1‑91 (MQ=255) ccACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATg < 1:69941/149‑1 (MQ=255) cacaTGGAGATCGGTTTGTAGCCCAGCGACGGCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGAGACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCGCTTATgg < 8:45490/149‑1 (MQ=255) acaTGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATggg > 2:291496/1‑149 (MQ=255) acaTGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGCGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATggg < 8:15907/149‑1 (MQ=255) caTGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATgggg > 5:63676/1‑149 (MQ=255) gCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTg > 6:20798/1‑148 (MQ=255) cAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTAGACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGaa < 5:163885/149‑1 (MQ=255) aGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATggg < 5:316555/143‑1 (MQ=255) aGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATggg > 6:316555/1‑143 (MQ=255) tATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCCTCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAgg > 6:372287/1‑149 (MQ=255) tGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTa < 4:320785/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTcc < 5:194191/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTcc > 7:6302/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCGACGCCAAGACCAGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTcc > 4:274879/1‑149 (MQ=255) ccAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACAACTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTccc > 8:114878/1‑148 (MQ=255) gACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGt > 6:130351/1‑149 (MQ=255) aCGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGtt < 6:63676/149‑1 (MQ=255) cGCCAAGCCCTGGAGCGGTGCTGAGCCGCCCGACCTGCCACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACACCAAGGTATTCCCGAACGTTg < 4:238106/149‑1 (MQ=255) cGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTg < 2:189689/149‑1 (MQ=255) gCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTgg < 5:20798/149‑1 (MQ=255) aGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCAt > 3:79130/1‑148 (MQ=255) aGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCAt < 4:79130/148‑1 (MQ=255) aGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATg < 6:211851/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTaccgaaccaggtcttggcgtcgctgggcttcataccgatctgcatgtggtcaccgatcttggcacctgtgaacaccagcttctcga > 1:78056‑M2/1‑46 (MQ=255) cGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTaccgaaccaggtcttggcgtcgctgggcttcataccgatctgcatgtggtcaccgatcttggcacctgtgaacaccagcttctcga < 2:78056‑M2/132‑87 (MQ=255) gTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTaccgaaccaggtcttggcgtcgctgggcttcataccgatctgcatgtggtcaccgatcttggcacctgtgaacaccagcttctcgagcatcagttcatgcggga < 4:204198‑M2/148‑105 (MQ=255) tgctgcGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCtgg > 7:348030/1‑149 (MQ=255) taccgcgcacgcgggcgaccagtgtcaggtcgggcggcgcagcaccgaaccaggtcttggcgtcgctgggcttcataccgatctgcatgtggtcaccgatcttggcacctgtgaacaccagcttctcgagcatcagttcatgcgggata < 1:189689‑M1/149‑149 (MQ=255) | GTGCCAAGTTCCAGCGCTACGAGCGGGTGGCTGACGACCTGGGTATCCCGCATGAACTGATGCTCGA‑GAAGCTGGTGTTCACAGGTGCCAAGATCGGTGACCACATGCAGATCGGTATGAAGCCCAGCGACGCCAAGACCTGGTTCGGTGCTGCGCCGCCCGACCTGACACTGGTCGCCCGCGTGCGCGGTACCGATTGGCTTTACACCTACCTGCGCAGTTTCTATGAGGACCCATCCCGCCCTTATGGGGTGAACAACAAGGTATTCCCGAACGTTGGCATGCCTAACGTGCTGG > NC_002947/1506263‑1506559 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |