New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1521351 | 54 (0.870) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.4% | coding (608/1353 nt) | murD | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
? | NC_002947 | = 1521377 | 56 (0.980) | coding (634/1353 nt) | murD | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
CCGATGACATCGAGCTGTACGTGCTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTG > NC_002947/1521207‑1521496 | ccGATGACATCGAGCTGTACGTGCTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCaaa > 6:71659/1‑149 (MQ=255) ccGATGACATCGAGCTGTACGTGCTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACAGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCACCGAAGACCACATCGACCGCTATAGCGGCCTACCGGCCTACCACCTGGCCaaa < 5:232749/149‑1 (MQ=255) aCATCGAGCTGTACGTGCTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCg > 8:131613/1‑148 (MQ=255) aCATCGAGCTGTACGTGCTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGGGGCGACCGTTCTGAACATCACCGAAGACCACATGTACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACAcc < 4:171131/147‑1 (MQ=255) tCGAGCTGTACGTGCTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGAtt > 4:101621/1‑149 (MQ=255) cTGTACGTGCTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCcg > 4:135668/1‑149 (MQ=255) gTACGTGCTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCcgcg > 6:227667/1‑149 (MQ=255) cTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGccc < 3:120196/148‑1 (MQ=255) gagaTTTCCAGCTTCCAGCTGGTAAGCACTGACCAGCTCATCGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTCGCCAAAAACCGGATTTTCCGCGGTGCCCTcc < 2:35452/148‑1 (MQ=255) gAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCgcca > 5:10737‑M2/1‑145 (MQ=255) gCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCgggcaccgcggaaaatccggtgtttggccagg < 3:341494‑M1/149‑33 (MQ=255) tttCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCgggcaccgcggaaaatccggtgtttggccaggtg > 1:199272‑M1/1‑115 (MQ=255) tttCCAGCTGGAAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCgccaggtg < 1:284127‑M2/149‑9 (MQ=255) agcttccagctGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAggtggtggt > 3:345915/1‑149 (MQ=255) gcttccagctGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAggtggtggt > 3:194893/1‑148 (MQ=255) cttccagctGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCgggcaccgcggaaaatccggtgtttggccaggtggtaggcc < 2:199272‑M1/149‑42 (MQ=255) cagctGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAAcc < 2:368658/148‑1 (MQ=255) agctGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGc > 6:141229/1‑149 (MQ=255) aaaCCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGAc < 5:141229/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAgc > 2:359971/1‑149 (MQ=255) aGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAgccgg < 3:101621/149‑1 (MQ=255) aGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAgccgg > 8:129439/1‑149 (MQ=255) gCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAgccggc < 4:345915/149‑1 (MQ=255) cTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAgccggcc > 1:145675/1‑149 (MQ=255) cAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGc > 2:100728/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGcc > 3:35556/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGcc < 2:315239/149‑1 (MQ=255) ccGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCg > 5:179892/1‑149 (MQ=255) cGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCgg < 3:69395/149‑1 (MQ=255) gAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGt < 4:1102/149‑1 (MQ=255) gCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAgg > 6:380384/1‑149 (MQ=255) gCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAg < 2:284127/148‑1 (MQ=255) gACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGcc > 6:172941/1‑149 (MQ=255) tGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGc > 5:113944/1‑149 (MQ=255) aaCATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGc < 1:359971/147‑1 (MQ=255) aaCATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTg < 3:135668/149‑1 (MQ=255) aCATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTg < 4:35556/148‑1 (MQ=255) aTCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGAc > 7:69524/1‑149 (MQ=255) cAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCt > 2:160953/1‑149 (MQ=255) aGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCtt > 8:180224/1‑149 (MQ=255) gCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTc > 5:136059/1‑149 (MQ=255) cGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCg < 6:113944/149‑1 (MQ=255) aaGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGc < 6:136059/149‑1 (MQ=255) aaGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGc < 8:69524/149‑1 (MQ=255) acaTGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAAc < 5:71659/149‑1 (MQ=255) acaTGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAAc < 4:98564/149‑1 (MQ=255) gACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAgg < 7:60308/116‑1 (MQ=255) gACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGGGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAgg > 8:60308/1‑116 (MQ=255) aCCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCt < 8:220599/126‑1 (MQ=255) aCCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCt > 7:220599/1‑126 (MQ=255) ccGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAAcccgccc > 5:347600/1‑148 (MQ=255) cTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACt > 7:303738/1‑149 (MQ=255) taGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACtt < 7:131613/147‑1 (MQ=255) gCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCaaa < 6:179892/149‑1 (MQ=255) gCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCaaa < 5:227667/149‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCg > 5:74982/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGACAACCGCCAGGACGCCCTCACCCGGCCCATGCCGTTGAAAGGCCGTCCATGATGCACATACGCCCACAACCCGCCCCACTTAAAAGCg > 2:309645/1‑149 (MQ=255) cTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGtt > 6:143544/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGttt < 5:172941/147‑1 (MQ=255) cGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTgg < 8:318048/148‑1 (MQ=255) ggCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCgccaggtggtaggccggaaggccgctatagcggtccatgtggtcttcgctgatgttcagaacggtcgccacttcggcgttgagctggtcagtggtttccagctggaag < 2:199272‑M2/149‑109 (MQ=255) gCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCt < 7:129439/149‑1 (MQ=255) caccTGGCgggcaccgcggaaaatccggtgtttggccaggtggtaggccggaaggccgctatagcggtccatgtggtcttcgctgatgttcagaacggtcgccacttcggcgttgagctggtcagtggtttccagcttccagctggaaa < 1:284127‑M1/149‑142 (MQ=255) caccTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCgccaggtggtaggccggaaggccgctatagcggtccatgtggtcttcgctgatgttcagaacggtcgccacttcggcgttgagctggtcagtggtttccagctggaagctggaaa > 1:199272‑M2/1‑34 (MQ=255) ccTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCgccaggtggtaggccggaaggccgctatagcggtccatgtggtcttcgctgatgttcagaacggtcgccacttcggcgttgagctggtcagtggtttccagctggaagctggaaagc < 3:341494‑M2/149‑118 (MQ=255) cTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGt > 5:200348/1‑149 (MQ=255) tGGCgggcaccgcggaaaatccggtgtttggccaggtggtaggccggaaggccgctatagcggtccatgtggtcttcgctgatgttcagaacggtcgccacttcggcgttgagctggtcagtggtttccagctggaagctggaaagctc > 5:10737‑M1/1‑4 (MQ=255) tGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTg > 5:309007/1‑149 (MQ=255) gCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTg < 1:152886/147‑1 (MQ=255) | CCGATGACATCGAGCTGTACGTGCTGGAGCTTTCCAGCTTCCAGCTGGAAACCACTGACCAGCTCAACGCCGAAGTGGCGACCGTTCTGAACATCAGCGAAGACCACATGGACCGCTATAGCGGCCTTCCGGCCTACCACCTGGCCAAACACCGGATTTTCCGCGGTGCCCGCCAGGTGGTGGTCAACCGCCAGGACGCCCTGAGCCGGCCGCTGCCGGTGGAAGGCCGTCCATGCTGGACCTTCGGCCTCAACCCGCCCGACTTCAAAGCGTTTGGCCTGCGTGAAGTG > NC_002947/1521207‑1521496 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |