New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1580932 = | 62 (1.000) | 4 (0.070) | 4/258 | NT | 6.4% | coding (465/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
? | NC_002947 | 1580977 = | 56 (0.930) | coding (420/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
TCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTAC > NC_002947/1580784‑1581078 | tCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTg < 3:319145/149‑1 (MQ=255) tCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTg < 8:225098/149‑1 (MQ=255) cgccaccttcgaacagggcaccaaccccgacaccgcgcaggtacaggtacagaacaagctgaacctggccaccccgctgctgccgcaggaagtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcg < 8:285120‑M1/1‑1 (MQ=255) ttGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGc > 1:258828/1‑149 (MQ=255) ttGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGc > 8:200975/1‑149 (MQ=255) ccaccttcgaacagggcaccaaccccgacaccgcgcaggtacaggtacagaacaagctgaacctggccaccccgctgctgccgcaggaagtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGc > 6:250119‑M1/147‑149 (MQ=255) ccaccttcgaacagggcaccaaccccgacaccgcgcaggtacaggtacagaacaagctgaacctggccaccccgccgctgccgcaggaagtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGc > 7:24939‑M1/147‑149 (MQ=255) tGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGc > 7:67985/1‑148 (MQ=255) caccttcgaacagggcaccaaccccgacaccgcgcaggtacaggtacagaacaagctgaacctggccaccccgctgctgccgcaggaagtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGcc < 7:182143‑M1/4‑1 (MQ=255) gACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGc < 2:174480/147‑1 (MQ=255) aCGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGACGGATAGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTAAACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGACAg > 7:146104/1‑149 (MQ=255) gTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGgt > 8:128039/1‑149 (MQ=255) tCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGgtc < 6:293958/149‑1 (MQ=255) gACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGgtcgt > 8:127773/1‑149 (MQ=255) cGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCt < 2:225294/149‑1 (MQ=255) cGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCt > 1:227917/1‑149 (MQ=255) gggTCAGCTGGAACTTATTCTGCTTTGCCGGATCGAGCCAGATACTGATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCTGGTCGTCCTTg < 4:362072/149‑1 (MQ=255) gcAGCTCCAACTAATTCACCCCGGCCGCCACGAGCCACAGACGCAGGGCGTACTGCGCCCCGAACACCTGGCAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTc < 4:325143/148‑1 (MQ=255) cTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCAtgc > 1:209521/1‑149 (MQ=255) gAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCAtgctgc > 7:63220/1‑149 (MQ=255) aCTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCg > 4:242447/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCg < 8:67985/148‑1 (MQ=255) aGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATATGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGAATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCg > 2:30440/1‑147 (MQ=255) aGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGga < 2:121267/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGAGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGACATTGGTCATGCTGCCGTCTTCg > 7:331590/1‑146 (MQ=255) aggtgCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTAGTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTGCGAGACGATAATGTTGGCGAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGgag < 2:269476/144‑1 (MQ=255) ggCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGAc < 5:139107/147‑1 (MQ=255) ggCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGAc < 8:309732/147‑1 (MQ=255) ccGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGgatcacagg > 6:70720/1‑142 (MQ=255) ccGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAgg > 6:133364/1‑149 (MQ=255) ccGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAgg > 4:24115/1‑149 (MQ=255) cGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGc < 5:133364/149‑1 (MQ=255) cGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGc < 1:303732/149‑1 (MQ=255) gATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCAtg < 3:263252/125‑1 (MQ=255) gATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCAtg > 4:263252/1‑125 (MQ=255) gATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACcagca < 3:230730/149‑1 (MQ=255) tGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGttc < 3:24115/149‑1 (MQ=255) gCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGACGATCACCAGACGGAAGttct > 6:185691/1‑148 (MQ=255) gCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGttctt < 7:200975/149‑1 (MQ=255) cggaCTGCGCACAGAACACCTGGAAGTGACCTACACCCGCTGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCTGGAAGttctt < 8:331590/145‑1 (MQ=255) cGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACATACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGttctt > 3:191403/1‑148 (MQ=255) gTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCa < 2:258828/149‑1 (MQ=255) cACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTg > 2:256269/1‑149 (MQ=255) gcaggaggtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGc > 3:381187‑M1/65‑108 (MQ=255) gcaggacgtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGc < 4:381187‑M1/44‑1 (MQ=255) cTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGa < 7:127773/149‑1 (MQ=255) ggAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATa > 6:88754/1‑149 (MQ=255) aaGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATAcc < 1:30440/149‑1 (MQ=255) gcccACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCGGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCt < 2:307729/146‑1 (MQ=255) gcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGa > 6:336613‑M1/56‑102 (MQ=255) gcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGa < 5:336613‑M1/47‑1 (MQ=255) cTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgc > 3:331140/1‑149 (MQ=255) cTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgc > 3:327531/1‑149 (MQ=255) acacCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgctg > 1:5913/1‑149 (MQ=255) acacCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgctg > 8:128366/1‑149 (MQ=255) cacCCGCGGTAAGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgct < 5:185691/147‑1 (MQ=255) ccGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGgtc > 8:44527/1‑55 (MQ=255) ccGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGgtc < 7:44527/55‑1 (MQ=255) ccGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACt > 5:187018/1‑149 (MQ=255) tACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGc < 6:187018/149‑1 (MQ=255) tACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGc < 2:209521/149‑1 (MQ=255) cgcgAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGTCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCgg < 7:128039/149‑1 (MQ=255) gcgAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCtgctgc > 4:38524/1‑149 (MQ=255) gagaTCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGgcag > 2:14981/1‑149 (MQ=255) gggTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCg < 2:227917/148‑1 (MQ=255) ccTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCTGccgcaggaagtgc < 3:38524/149‑8 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGAcgcg < 4:206753/107‑1 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGAcgcg > 3:206753/1‑107 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTgg > 7:29296/1‑148 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGc > 2:290738/1‑149 (MQ=255) aTGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAg < 2:92224/149‑1 (MQ=255) gaCGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCATGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCt > 6:360790/1‑149 (MQ=255) cGATATAGTCGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTg > 7:285120/1‑149 (MQ=255) gATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGt > 8:182143/1‑149 (MQ=255) atatAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGtt > 2:230095/1‑149 (MQ=255) atatAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGtt < 7:128366/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgt < 1:256269/148‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtac < 4:191403/149‑1 (MQ=255) | TCTTGACGTCGACCGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTAC > NC_002947/1580784‑1581078 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |