| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1580932 = | 62 (1.000) | 4 (0.070) | 4/258 | NT | 6.4% | coding (465/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
| ? | NC_002947 | 1580977 = | 56 (0.930) | coding (420/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB | |||||
GATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCG > NC_002947/1580839‑1581124 | gATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACcagca < 3:230730/149‑1 (MQ=255) tGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGttc < 3:24115/149‑1 (MQ=255) gCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGACGATCACCAGACGGAAGttct > 6:185691/1‑148 (MQ=255) gCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGttctt < 7:200975/149‑1 (MQ=255) cggaCTGCGCACAGAACACCTGGAAGTGACCTACACCCGCTGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCTGGAAGttctt < 8:331590/145‑1 (MQ=255) cGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACATACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGttctt > 3:191403/1‑148 (MQ=255) gTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCa < 2:258828/149‑1 (MQ=255) cACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTg > 2:256269/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGa < 7:127773/149‑1 (MQ=255) ggAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATa > 6:88754/1‑149 (MQ=255) aaGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATAcc < 1:30440/149‑1 (MQ=255) gcccACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCGGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCt < 2:307729/146‑1 (MQ=255) gcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGa > 6:336613‑M1/56‑102 (MQ=255) gcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGa < 5:336613‑M1/47‑1 (MQ=255) cTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgc > 3:327531/1‑149 (MQ=255) cTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgc > 3:331140/1‑149 (MQ=255) acacCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgctg > 8:128366/1‑149 (MQ=255) acacCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgctg > 1:5913/1‑149 (MQ=255) cacCCGCGGTAAGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgct < 5:185691/147‑1 (MQ=255) ccGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACt > 5:187018/1‑149 (MQ=255) tACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGc < 6:187018/149‑1 (MQ=255) tACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGc < 2:209521/149‑1 (MQ=255) cgcgAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGTCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCgg < 7:128039/149‑1 (MQ=255) gcgAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCtgctgc > 4:38524/1‑149 (MQ=255) gagaTCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGgcag > 2:14981/1‑149 (MQ=255) gggTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCg < 2:227917/148‑1 (MQ=255) ccTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCTGccgcaggaagtgc < 3:38524/149‑8 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGAcgcg > 3:206753/1‑107 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGAcgcg < 4:206753/107‑1 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTgg > 7:29296/1‑148 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGc > 2:290738/1‑149 (MQ=255) aTGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAg < 2:92224/149‑1 (MQ=255) gaCGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCATGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCt > 6:360790/1‑149 (MQ=255) cGATATAGTCGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTg > 7:285120/1‑149 (MQ=255) gATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGt > 8:182143/1‑149 (MQ=255) atatAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGtt < 7:128366/149‑1 (MQ=255) atatAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGtt > 2:230095/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgt < 1:256269/148‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtac < 4:191403/149‑1 (MQ=255) tcggcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgctgc > 6:336613‑M2/48‑102 (MQ=255) tcggcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgctgc < 5:336613‑M2/55‑1 (MQ=255) gcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACGTCCTGc < 4:381187‑M2/64‑1 (MQ=255) gcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACCTCCTGc > 3:381187‑M2/45‑108 (MQ=255) GCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtac > 7:128395‑M1/1‑146 (MQ=255) GCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTATTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCAATTCCTGAGGCATCAGCGG‑GATGGCCAGGTTCATCTAGTtctgtacca < 8:128395‑M1/148‑2 (MQ=255) CAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtacctgta > 4:331140‑M1/1‑149 (MQ=255) aGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCGCCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtacctgtac < 8:140558/149‑1 (MQ=255) cTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTgcgc < 3:26980/147‑1 (MQ=255) cTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTgcgc > 4:26980/1‑147 (MQ=255) ttGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGgt > 5:140076/1‑149 (MQ=255) tCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCg > 4:126598/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCgg < 3:242447/148‑1 (MQ=255) gctgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCg > 4:112416/1‑145 (MQ=255) gctgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCg < 3:112416/145‑1 (MQ=255) tgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTg > 3:353763/1‑149 (MQ=255) ccGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGCGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGtt < 1:290738/147‑1 (MQ=255) ccGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTg < 6:140076/147‑1 (MQ=255) cGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTg > 7:302340/1‑149 (MQ=255) tCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTc > 6:336384/1‑77 (MQ=255) ttCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCt > 5:59259/1‑149 (MQ=255) cGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtacctgtac > 2:378123/1‑121 (MQ=255) cGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtacctgtac < 1:378123/121‑1 (MQ=255) cGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCt < 5:112591/147‑1 (MQ=255) cGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCt < 8:302340/147‑1 (MQ=255) ggAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGtt < 3:126598/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCGTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGaa < 8:63220/149‑1 (MQ=255) cAGGCAGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATAACTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGAAGCGG‑GGTGGACAGGTTCAGCTTCTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGGTGGTGCACTGTTCGAAgg > 3:334404/1‑149 (MQ=255) ggccGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTg < 7:182143‑M2/145‑1 (MQ=255) gccGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCGGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTgg > 7:24939‑M2/4‑149 (MQ=255) gccGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTgg > 6:250119‑M2/4‑149 (MQ=255) cGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCg < 8:285120‑M2/148‑1 (MQ=255) | GATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGG‑GGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCG > NC_002947/1580839‑1581124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |