| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1934858 = | 62 (1.000) | 5 (0.080) | 5/256 | NT | 7.3% | coding (123/936 nt) | htrB | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase |
| ? | NC_002947 | 1934915 = | 68 (1.140) | coding (180/936 nt) | htrB | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase | |||||
GGCCTTTGTCTTTCCGGATGCTTCAATGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGCCTCTACCGGCATCGCCTTCTTC > NC_002947/1934711‑1935005 | ggCCTTTGTCTTTCCGGATGCTTCAATGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCcg < 6:111914/149‑1 (MQ=255)atatgggccaggcgcgccagcctggccttgggacaccaccagctcatggccatttcgaagaaggcgatgccggtagaggcgaagttggccttgagcaaacgctgccgttcgtcgaccgacagctccgggaagcacagctccaggttgcg < 3:151259‑M1/2‑1 (MQ=255) gTCTTTCCGGATGCTTCAATGGAACGCCCGCGGTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTg‑g < 8:84288/148‑1 (MQ=255) ccaggcgcgccagcctggccttgggccaccaccagctcatggccatttcgaagaaggcgatgccggtagaggcgaagttggccttgagcaaacgctgccgttcgtcgaccgacagctccgggaagcacagctccaggttgCGCGCTg‑g‑‑g < 4:306598‑M1/9‑1 (MQ=255) tCTTTCCGGATGCTTCAATGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCt > 6:245456/1‑145 (MQ=255) tCTTTCCGGATGCTTCAATGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCt < 5:245456/145‑1 (MQ=255) tttCCGGATGCTTCAATGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGGTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑gcgc > 4:243109/1‑149 (MQ=255) ccGGATGCTTCAATGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGGGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCg < 3:114567/148‑1 (MQ=255) cGGATGCTTCAATGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGt > 3:158833/1‑148 (MQ=255) ttCAATGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATc > 4:71846/1‑149 (MQ=255) aaTGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTTTCGCt > 3:96956/1‑149 (MQ=255) ccttgggccaccaccagctcatggccatttcgaagaaggcgatgccggtagaggcgaagttggccttgagcaaacgctgccgttcgtcgaccgacagctccgggaagcacagctccaggttgCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCtt < 3:117761‑M1/27‑1 (MQ=255) gAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCCTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGc < 6:191643/149‑1 (MQ=255) aCGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCGGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCg < 2:222994/149‑1 (MQ=255) cGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCgg < 6:134255/149‑1 (MQ=255) gCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGt < 7:306738/149‑1 (MQ=255) ccGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCATTTGGATGGGCCGGGGCCTGATGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTCCCGGTTGGTGCTGAAGATCGGTGCCGCGATG‑G‑‑GCGCGGTCTGGTTTCCTTTTGCGGGTGa > 3:10131/1‑149 (MQ=255) ttCGTCCGTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTGCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCg < 3:359859/148‑1 (MQ=255) cGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGgc < 7:296271/148‑1 (MQ=255) tCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCa > 1:339642/1‑149 (MQ=255) cTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATcg > 5:189168/1‑149 (MQ=255) atttcgaagaaggcgatgccggtagaggcgaagttggccttgagcaaacgctgccgttcgtcgaccgacagctccgggaagcacagctccaggttgCGCGCGGCGATGCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATcg > 4:100360‑M1/97‑149 (MQ=255) cTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCcgcgcg > 3:59608/1‑149 (MQ=255) ttCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTTAACGTCGGCGCATCGCcgcgcg > 1:356050/1‑148 (MQ=255) ttCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCcgcgcg > 5:6410/1‑148 (MQ=255) tCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCgcgcgc > 2:83941/1‑148 (MQ=255) gaaggcgatgccggtagaggcgaagttggccttgagcaaacgctgccgttcgtcgaccgacagctccgggaagcacagctccaggttgCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAAc > 4:151259‑M1/89‑149 (MQ=255) aaggcgatgccggtagaggcgaagttggccttgagcaaacgctgccgttcgtcgaccgacagctccgggaagcacagctccaggttgCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAAcc > 3:306598‑M1/88‑149 (MQ=255) cccAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCt > 5:157852/1‑149 (MQ=255) cccAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCt > 4:118616/1‑149 (MQ=255) gcgatgccggtagaggcgaagttggccttgagcaaacgctgccgttcgtcgaccgacagctccgggaagcacagctccaggttgCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTgg > 4:117761‑M1/85‑149 (MQ=255) gTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGc > 2:232410/1‑149 (MQ=255) gggCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCtgt < 6:189168/146‑1 (MQ=255) ccTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTcc > 4:47564/1‑149 (MQ=255) tgtgGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCg > 1:88555/1‑149 (MQ=255) tgGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCg > 3:113357/1‑147 (MQ=255) tgGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGa < 4:158833/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAg < 4:113357/148‑1 (MQ=255) ctgggcctgggcCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCt > 2:35591/1‑149 (MQ=255) ctgggcctgggcCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCt > 4:53926/1‑149 (MQ=255) ctgggcctgCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTgtcggt < 3:53926/149‑1 (MQ=255) ctgggcctgCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTgtcggt < 1:35591/149‑1 (MQ=255) gggcctgCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGTTCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTgtcggtc > 1:178425/1‑148 (MQ=255) ggcctgCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTcga < 6:6410/149‑1 (MQ=255) ctgTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCt < 3:130430/134‑1 (MQ=255) ctgTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCt > 4:130430/1‑134 (MQ=255) ctgTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACg < 2:339642/149‑1 (MQ=255) ctgTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACg > 6:214381/1‑149 (MQ=255) ggttggtGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAg < 3:354820/149‑1 (MQ=255) gttggtGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCACCCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGc > 8:190608/1‑149 (MQ=255) gttggtGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGCCGTTCGTCGACCGACAg < 1:83941/148‑1 (MQ=255) tggtCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTg < 6:154360/149‑1 (MQ=255) gtCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGc > 3:321055/1‑148 (MQ=255) tCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCt > 6:328549/1‑148 (MQ=255) ccGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAAc > 3:112862/1‑122 (MQ=255) ccGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAAc < 4:112862/122‑1 (MQ=255) cGGGTGCTGCTGAAGTTCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGc < 2:178425/149‑1 (MQ=255) cGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGc > 2:29752/1‑149 (MQ=255) cGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGc < 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ctgAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGCCTCTACCgg > 3:88148/1‑149 (MQ=255) gAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCTGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCGGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGCCTCTACCGGCa > 2:19750/1‑149 (MQ=255) gAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGCCTCTACCGGCa > 3:158461/1‑149 (MQ=255) aaGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGCCTCTACCGGc < 4:321055/147‑1 (MQ=255) cGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATcgcc < 4:380614/58‑1 (MQ=255) cGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATcgcc > 3:380614/1‑58 (MQ=255) 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CGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGCCTCTACCGGCATCGCCttcttc < 7:212934‑M1/148‑1 (MQ=255) | GGCCTTTGTCTTTCCGGATGCTTCAATGGAACGCCCGCGTTTTCGTCCCTATTTCCTTCACCCCAAGTTCTGGGGCCTGTGGCTGGGCCTGGGCCTGCTGTGGTTGGTGGTCCAGTTGCCGTACCGGGTGCTGCTGAAGATCGGTGCCGCGCTG‑G‑‑GCGCCGTCATGTATCGCTTTGCCGGTGAACGTCGGCGCATCGCCGCGCGCAACCTGGAGCTGTGCTTCCCGGAGCTGTCGGTCGACGAACGGCAGCGTTTGCTCAAGGCCAACTTCGCCTCTACCGGCATCGCCTTCTTC > NC_002947/1934711‑1935005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |