| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3031549 | 49 (0.790) | 6 (0.100) | 4/256 | NT | 11.6% | coding (856/2763 nt) | mgtA | ATP‑dependent magnesium transporter |
| ? | NC_002947 | = 3031578 | 44 (0.740) | coding (885/2763 nt) | mgtA | ATP‑dependent magnesium transporter | |||||
ATGTCGCGCAGAAGTCCGCCGCCGAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTG > NC_002947/3031403‑3031691 | aTGTCGCGCAGAAGTCCGTCGCCGAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCg < 7:130363/149‑1 (MQ=255) gcgcAGAAGTCCGCCGCCGAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGc > 2:31372/1‑149 (MQ=255) cgcAGAAGTCCGCCGCCGAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGcc < 8:171892/149‑1 (MQ=255) tCCGCCGCCGAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCAt < 2:342305/149‑1 (MQ=255) ccgccgccgAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGc > 5:368404/1‑145 (MQ=255) ccgccgccgAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGc < 6:368404/145‑1 (MQ=255) cgccgccgAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTgcgcgaaccggcaatggc > 8:88040‑M1/1‑131 (MQ=255) cgccgccgAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCAtt < 2:267716/148‑1 (MQ=255) gccgccgAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGc < 8:234672/149‑1 (MQ=255) cgccgAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGc > 1:252705/1‑147 (MQ=255) cgccgAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGc < 2:252705/147‑1 (MQ=255) gAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTc > 1:345991/1‑149 (MQ=255) aGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCGCACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTc < 1:74300/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCgcgc < 3:70536/149‑1 (MQ=255) gcgcACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCag > 4:37866‑M2/1‑146 (MQ=255) gcACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGTCCG‑ACGCACCTATTTTGGCTgcgcgaaccggcaatggccttggccagcgagcc < 1:295357‑M1/149‑34 (MQ=255) tCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTgcgcgaaccggcaatggccttggccagcgagccaaaata < 7:88040‑M1/149‑40 (MQ=255) tCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTgcgcgaaccggcaatggccttggccagcgagccaaaata < 2:306194‑M1/149‑40 (MQ=255) aGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTgcgcgaaccggcaatggccttggccagcgagccaaaatag < 7:184847‑M1/148‑41 (MQ=255) aGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTgcgcgaaccggcaatggccttggccagcgagccaaaatag < 1:93484‑M1/148‑41 (MQ=255) cGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCgcggcg > 1:68815/1‑149 (MQ=255) ccGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑Ag > 3:9493/1‑149 (MQ=255) cGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCg > 1:133159/1‑89 (MQ=255) cGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCg < 2:133159/89‑1 (MQ=255) cGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGc > 4:262487/1‑149 (MQ=255) gAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCg > 6:220022/1‑149 (MQ=255) gAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCACGCACGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCg > 8:220939/1‑149 (MQ=255) aTCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCAGTGCCGGTTCGCGCAGACCGACCGCTATTGCCCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTcag > 8:257776/1‑149 (MQ=255) tGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTcagcag > 5:321732/1‑149 (MQ=255) gCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCagcagc > 6:36293/1‑149 (MQ=255) cTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTcagca < 2:345991/146‑1 (MQ=255) cTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCagcagc < 5:36293/148‑1 (MQ=255) ccAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGc < 3:372811/149‑1 (MQ=255) cAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGTGGGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGc > 1:58159/1‑149 (MQ=255) cAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCt > 8:246415/1‑149 (MQ=255) aTGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTc < 2:68815/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTg > 2:203918/1‑149 (MQ=255) tCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGAGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTg > 6:228038/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGGCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTgg < 7:257776/149‑1 (MQ=255) gTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCACTTCATGCTGGt > 5:242753/1‑148 (MQ=255) tGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGa > 7:28883/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATg < 2:145221/149‑1 (MQ=255) gCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATg < 7:246415/149‑1 (MQ=255) gcgccGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCggtg < 5:220022/149‑1 (MQ=255) gcgccGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCggtg < 8:28883/149‑1 (MQ=255) gccGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATg > 1:147875/1‑138 (MQ=255) gccGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATg < 2:147875/138‑1 (MQ=255) gtCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGAt > 4:189081/1‑149 (MQ=255) tCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGAt > 7:7307/1‑148 (MQ=255) cGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGgtg > 8:252239/1‑149 (MQ=255) g‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGtgtg < 1:203918/149‑1 (MQ=255) g‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGAACAACGGtgtg < 4:9493/149‑1 (MQ=255) g‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCACTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGtgtg < 6:242753/149‑1 (MQ=255) cGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGgtg < 1:318923/142‑1 (MQ=255) cGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGgtg > 2:318923/1‑142 (MQ=255) aCCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGAACGTGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATTGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAgg < 7:220939/149‑1 (MQ=255) ccTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGc < 2:58159/149‑1 (MQ=255) cTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcct < 1:93484‑M2/148‑109 (MQ=255) cTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcct < 7:184847‑M2/148‑109 (MQ=255) cTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAACGCGAGCGTCAGCAGCCTGCGAGAACCCATAAATGATGGTTATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTTTGGTGa > 1:121585/1‑147 (MQ=255) tATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcctga < 7:88040‑M2/149‑111 (MQ=255) tATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcctga < 2:306194‑M2/149‑111 (MQ=255) tATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGa > 3:319542/1‑149 (MQ=255) ggCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggaccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcctgatgtgc < 1:295357‑M2/149‑117 (MQ=255) cTgcgcgaaccggcaatggccttggccagcgagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcctgatgtgcgc > 4:37866‑M1/1‑2 (MQ=255) | ATGTCGCGCAGAAGTCCGCCGCCGAGCATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGG‑CCG‑ACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTG > NC_002947/3031403‑3031691 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |