New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3031549 | 49 (0.790) | 6 (0.100) | 4/256 | NT | 11.6% | coding (856/2763 nt) | mgtA | ATP‑dependent magnesium transporter |
? | NC_002947 | = 3031578 | 44 (0.740) | coding (885/2763 nt) | mgtA | ATP‑dependent magnesium transporter |
ATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTGGGCTGATGCCTTCCTCTTCGCGCTTGCCGTGG > NC_002947/3031430‑3031723 | aTGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCgcgc < 3:70536/149‑1 (MQ=255) gcgcACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCag > 4:37866‑M2/1‑146 (MQ=255) cGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCgcggcg > 1:68815/1‑149 (MQ=255) ccGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑Ag > 3:9493/1‑149 (MQ=255) cGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGc > 4:262487/1‑149 (MQ=255) gAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCg > 6:220022/1‑149 (MQ=255) gAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCACGCACGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCg > 8:220939/1‑149 (MQ=255) aTCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCAGTGCCGGTTCGCGCAGACCGACCGCTATTGCCCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTcag > 8:257776/1‑149 (MQ=255) tGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTcagcag > 5:321732/1‑149 (MQ=255) gCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCagcagc > 6:36293/1‑149 (MQ=255) cTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTcagca < 2:345991/146‑1 (MQ=255) cTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCagcagc < 5:36293/148‑1 (MQ=255) ccAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGc < 3:372811/149‑1 (MQ=255) cAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGTGGGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGc > 1:58159/1‑149 (MQ=255) cAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCt > 8:246415/1‑149 (MQ=255) aTGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTc < 2:68815/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTg > 2:203918/1‑149 (MQ=255) tCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGAGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTg > 6:228038/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGGCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTgg < 7:257776/149‑1 (MQ=255) gTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCACTTCATGCTGGt > 5:242753/1‑148 (MQ=255) tGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGa > 7:28883/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATg < 7:246415/149‑1 (MQ=255) gCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATg < 2:145221/149‑1 (MQ=255) gcgccGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCggtg < 5:220022/149‑1 (MQ=255) gcgccGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCggtg < 8:28883/149‑1 (MQ=255) gccGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATg < 2:147875/138‑1 (MQ=255) gccGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATg > 1:147875/1‑138 (MQ=255) gtCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGAt > 4:189081/1‑149 (MQ=255) tCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGAt > 7:7307/1‑148 (MQ=255) cGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGgtg > 8:252239/1‑149 (MQ=255) gCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGtgtg < 1:203918/149‑1 (MQ=255) gCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGAACAACGGtgtg < 4:9493/149‑1 (MQ=255) gCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCACTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGtgtg < 6:242753/149‑1 (MQ=255) cGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGgtg < 1:318923/142‑1 (MQ=255) cGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGgtg > 2:318923/1‑142 (MQ=255) aCCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGAACGTGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATTGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAgg < 7:220939/149‑1 (MQ=255) ccTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGc < 2:58159/149‑1 (MQ=255) cTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcct < 7:184847‑M2/148‑109 (MQ=255) cTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcct < 1:93484‑M2/148‑109 (MQ=255) cTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAACGCGAGCGTCAGCAGCCTGCGAGAACCCATAAATGATGGTTATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTTTGGTGa > 1:121585/1‑147 (MQ=255) tATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcctga < 2:306194‑M2/149‑111 (MQ=255) tATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcctga < 7:88040‑M2/149‑111 (MQ=255) tATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGa > 3:319542/1‑149 (MQ=255) ggCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggaccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcctgatgtgc < 1:295357‑M2/149‑117 (MQ=255) gCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTGGGCTGAt < 3:189081/148‑1 (MQ=255) gCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTGGGCTGATg > 5:9417/1‑149 (MQ=255) tGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTAATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTGGGCTGATGcc > 7:50238/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTGGGCTGATGCCTTc < 6:134194/149‑1 (MQ=255) gCCATTGCCGGTTCGCGCagccaaaataggtgcgtcggccggtggcgaccaccacggcgcgggcgcggccactgaccacattggtccccatgaagcagatgttcggcaactcgagcaggttgtcctgatgtgcgccatgctcggcggcg > 8:88040‑M2/1‑18 (MQ=255) cATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTGGGCTGATGCCTTCCTCTTcg > 1:325088/1‑149 (MQ=255) ccGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGGGACTGGGCTGATGCCTTCCTCTTCGCGCtt < 1:31372/149‑1 (MQ=255) gTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTGGGCTGATGCCTTCCTCTTCGCGCTTGcc > 5:24044/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTGGGCTGATGCCTTCCTCTTCGCGCTTGCCGTgg < 7:252239/149‑1 (MQ=255) | ATGGCGCACATCAGGACAACCTGCTCGAGTTGCCGAACATCTGCTTCATGGGGACCAATGTGGTCAGTGGCCGCGCCCGCGCCGTGGT‑GGTCGCCACCGGCCGACGCACCTATTTTGGCTCGCTGGCCAAGGCCATTGCCGGTTCGCGCAGCCAGACCGCTTTTGACCGCGGCGTGAAC‑‑‑AGCGTCAGCAGCCTGC‑TGATCCGCTTCATGCTGGTGATGGTGCCGGTGGTGTTCATGATCAACGGTGTGGTGAAAGGCGACTGGGCTGATGCCTTCCTCTTCGCGCTTGCCGTGG > NC_002947/3031430‑3031723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |