New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3036448 = | 56 (0.900) | 5 (0.080) | 5/258 | NT | 8.8% | intergenic (‑38/+197) | PP_2648/PP_2649 | universal stress protein family protein/LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 3036480 = | 49 (0.820) | intergenic (‑70/+165) | PP_2648/PP_2649 | universal stress protein family protein/LysR family transcriptional regulator |
GTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGCTGATTACCCAGGGCTGGCGGGCTGCCTCATTACCGTCTTGA > NC_002947/3036300‑3036595 | gTTGCGAGCATGTGGTGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCa < 8:186654/149‑1 (MQ=255) tccgggctgaaaggctgagggtcaagacggtaatgaggcagcccgccagccctgggtaatcagccttgcagctacaccggcagtgctgttggcaggcatgacctgccgctacacctgcacgccattgacccaaatcaAGCCATCGTcgc < 5:69037‑M1/12‑1 (MQ=255) gggAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTcgcgc > 1:284046/1‑148 (MQ=255) gAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGaa > 7:283218/1‑149 (MQ=255) aaaGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCCTcgcgccggg > 6:241567/1‑145 (MQ=255) gTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCgg > 4:3506/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGgc > 2:65188/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGgc > 2:143546/1‑149 (MQ=255) gCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAg < 1:143546/148‑1 (MQ=255) aaCCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGc > 1:124938/1‑149 (MQ=255) aaCCAGTATGTGATTCAGCGGGTGCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGc < 3:73514/149‑1 (MQ=255) aCCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCt < 2:124938/149‑1 (MQ=255) tcaagacggtaatgaggcagcccgccagccctgggtaatcagccttgcagctacaccggcagtgctgttggcaggcatgacctgccgctacacctgcacgccattgacccaaatcaAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCtt < 3:185214‑M1/33‑1 (MQ=255) ccAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCtt > 5:29252/1‑149 (MQ=255) tATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGAtt > 2:98255/1‑149 (MQ=255) acggtaatgaggcagcccgccagccctgggtaatcagccttgcagctacaccggcagtgctgttggcaggcatgacctgccgctacacctgcacgccattgacccaactcaAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGAttt > 7:246208‑M1/112‑149 (MQ=255) tgtgTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGAttt < 8:15585/148‑1 (MQ=255) tgtgTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTg < 8:75257/149‑1 (MQ=255) tgtgTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTg < 8:283218/149‑1 (MQ=255) ggtaatgaggcagcccgccagccctgggtaatcagccttgcagctacaccggcagtgctgttggcaggcatgacctgccgctacacctgcacgccattgacccaaatcaAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTgg > 4:185214‑M1/110‑149 (MQ=255) tgtTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTgg < 5:282141/148‑1 (MQ=255) tgtTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTgg < 1:98255/148‑1 (MQ=255) cAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAAt > 2:356435/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAAt > 7:86385/1‑149 (MQ=255) cagcccgccagccctgggtaatcagccttgcagctacaccggcagtgctgttggcaggcatgacctgccgctacacctgcacgccattgacccaaatcaAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCg > 6:69037‑M1/100‑149 (MQ=255) cATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGA‑GGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAg < 7:85281/148‑1 (MQ=255) aTGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAg < 6:29252/148‑1 (MQ=255) ggggCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGgtg > 5:247352/1‑147 (MQ=255) gCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCg > 4:249921/1‑149 (MQ=255) cTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCgg > 2:127168/1‑149 (MQ=255) ccTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGa < 2:186000/110‑1 (MQ=255) ccTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGa > 1:186000/1‑110 (MQ=255) ttGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGc < 6:53250/146‑1 (MQ=255) ttGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGc > 5:53250/1‑146 (MQ=255) ggTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGt < 7:30411/148‑1 (MQ=255) tCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCAt < 3:3506/149‑1 (MQ=255) tCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCAt > 8:342350/1‑149 (MQ=255) aaGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCAtgc > 2:75128/1‑149 (MQ=255) aaGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCAtgc < 1:65188/149‑1 (MQ=255) aGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAggcatgacc < 6:247115/149‑8 (MQ=255) cgcgcACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCAtgcctgc < 2:284046/149‑1 (MQ=255) gcACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCaa > 6:176137/1‑149 (MQ=255) aGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAg > 4:60228/1‑148 (MQ=255) aGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAg > 3:318484/1‑148 (MQ=255) gCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCa < 4:318484/149‑1 (MQ=255) aGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCgg < 3:249921/149‑1 (MQ=255) gCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGgt > 6:210674/1‑149 (MQ=255) aaCCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑c < 8:86385/148‑1 (MQ=255) ccTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTg > 8:147723/1‑148 (MQ=255) ccTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTg > 3:132256/1‑148 (MQ=255) cgcACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAgg < 1:356435/148‑1 (MQ=255) cgcACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGc < 6:247352/149‑1 (MQ=255) tgCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGc > 4:191262/1‑142 (MQ=255) tgCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGc < 3:191262/142‑1 (MQ=255) cACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGgtgt < 7:230708/129‑1 (MQ=255) cACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGgtgt > 8:230708/1‑129 (MQ=255) cGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGCTGATTACCCAGGGCTg > 8:358233/1‑149 (MQ=255) ttGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGCTGATTACCCAGGGCTGGCGGGc > 6:140117/1‑149 (MQ=255) gAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGCTGATTACCCAGggctggctggct < 8:321799/148‑1 (MQ=255) aGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGCTGATTACCCAGGGCTGGCGGGCTGc < 5:210674/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGCTGATTACCCAGGGCTGGCGGGCTGCCTCAt > 3:231618/1‑149 (MQ=255) gCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGGGTAGACTGCAAGGCTGATTACCCAGGGCTGGCGGGCTGCCTCATTAcc < 1:75128/148‑1 (MQ=255) cAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGCTGATTACCCAGGGCTGGCGGGCTGCCTCATTACCGTCTTGa < 7:342350/149‑1 (MQ=255) cAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGCTGATTACCCAGGGCTGGCGGGCTGCCTCATTACCGTCTTGa < 4:132256/149‑1 (MQ=255) | GTTGCGAGCATGTGGGGAAAGGTCGGTGGCAACCAGTATGTGTTTCAGCGGGTTCATGTGGGGCTCCTTGGTCAAGGCGCGCACAGCGATCAAGCGGTAAACCTTGCGCACTGTGCACCTGGCGGTACTTGAGTCATTCCTTGCGTGCAGCCATCGTCGCGCGAACCCGGCGCGAGGGCTTGATTTGGGTCAATGGCGTGCAGGTGTAGCGGCAGGTCATGCCTGCCAACAGCACTGCCGGTGTAG‑CTGCAAGGCTGATTACCCAGGGCTGGCGGGCTGCCTCATTACCGTCTTGA > NC_002947/3036300‑3036595 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |