New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3434940 | 44 (0.710) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 6.2% | coding (175/327 nt) | gpW | baseplate protein |
? | NC_002947 | = 3434978 | 50 (0.860) | coding (213/327 nt) | gpW | baseplate protein |
CGAAGCTATCTCGGGCCTTGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCATGGAGGTAACCG > NC_002947/3434792‑3435087 | cGAAGCTATCTCGGGCCTTGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGG < 2:194766‑M1/149‑1 (MQ=255) gAAGCTATCTCGGGCCTTGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGt < 4:44249/149‑1 (MQ=255) aaGCTATCTCGGGCCTTGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTa > 1:381536/1‑149 (MQ=255) gCTATCTCGGGCCTTGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTa > 8:329328/1‑147 (MQ=255) cTATCTCGGGCCTTGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAg > 3:48038/1‑149 (MQ=255) gggCCTTGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAgg > 7:188387/1‑149 (MQ=255) gggCCTTGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAg < 2:66446/148‑1 (MQ=255) ttGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGcc > 6:144374/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCt > 8:164912/1‑149 (MQ=255) cgcCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTggg < 1:268224/149‑1 (MQ=255) gcCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGc > 5:89363/1‑149 (MQ=255) acAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGcc < 8:171523/148‑1 (MQ=255) aTCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCt > 6:372204/1‑149 (MQ=255) tCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAg > 2:233464/1‑149 (MQ=255) gAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGcc > 3:278658‑M2/1‑147 (MQ=255) ttGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTgg > 8:20121/1‑127 (MQ=255) ttGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTgg < 7:20121/127‑1 (MQ=255) gACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGctcccagcggcccaaggcacgggccacctcggcctgtaccgcgcttttcc < 8:167196‑M1/148‑51 (MQ=255) gACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGc < 2:381536/146‑1 (MQ=255) aCCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCt < 3:102228/149‑1 (MQ=255) cACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTgg > 8:278777/1‑149 (MQ=255) cACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTg > 2:265444/1‑148 (MQ=255) gCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGc > 7:183358/1‑149 (MQ=255) cTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGggt < 3:90660/149‑1 (MQ=255) ggCAGTCGCCGCATGCGGCCGGACTACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGGCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAACAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGggtg < 7:75573/147‑1 (MQ=255) gCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGggtggtg < 7:275225/149‑1 (MQ=255) cgccgtATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGctcccagcggcccaaggcacgggccacctcggcctgtaccgcgctt < 1:46835‑M1/125‑47 (MQ=255) cgccgtATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGctcccagcggcccaaggcacgggccacctcggcctgtaccgcgctt > 2:46835‑M1/1‑79 (MQ=255) ccgcATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCt < 7:329328/149‑1 (MQ=255) aTACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGc < 8:183358/149‑1 (MQ=255) tACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCa < 8:188387/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACggg > 4:251537/1‑144 (MQ=255) ggCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACggg > 3:376265/1‑144 (MQ=255) cagcaAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACggg > 4:219260/1‑142 (MQ=255) aaGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCAt < 1:361558/149‑1 (MQ=255) gCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGt < 5:260687/126‑1 (MQ=255) gCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGt > 6:260687/1‑126 (MQ=255) gCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGa < 5:144374/149‑1 (MQ=255) gTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGAcc > 6:32998/1‑149 (MQ=255) aCGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGc > 7:28920/1‑149 (MQ=255) tCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGggtggtg > 2:44053/1‑101 (MQ=255) tCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGggtggtg < 1:44053/101‑1 (MQ=255) aCATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTAc > 8:166999/1‑149 (MQ=255) ccGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTggg > 3:318059/1‑149 (MQ=255) ccGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTgg < 6:89363/148‑1 (MQ=255) aaCGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAgcgc > 7:319286/1‑149 (MQ=255) ggTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTc < 4:48038/149‑1 (MQ=255) tGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCAt > 1:163231/1‑149 (MQ=255) ggAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGccgcgcttttccacccctcgttgaccggcatgtcgacgtaacgccgcagcttgctgccgtattccggccgcatgcggcgactgccgagtggcgtggtc < 8:167196‑M2/148‑99 (MQ=255) aaaaGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCATg > 3:117881/1‑147 (MQ=255) aaaGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCATGGAg < 3:219260/149‑1 (MQ=255) aaaGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCATGGAg < 5:372204/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGccgcgcttttccacccctcgttgaccggcatgtcgacgtaacgccgcagcttgctgccgtattccggccgcatacggcg > 2:46835‑M2/1‑46 (MQ=255) aaGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGccgcgcttttccacccctcgttgaccggcatgtcgacgtaacgccgcagcttgctgccgtattccggccgcatacggcg < 1:46835‑M2/125‑80 (MQ=255) aaGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCATGGAgg > 8:36134/1‑149 (MQ=255) aGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCATGGAgg > 3:92606/1‑148 (MQ=255) cgGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCATGGAGGTAAcc < 8:319286/149‑1 (MQ=255) ggctcccagcggcccaaggcacgggccacctcggcctgtaccgcgcttttccacccctcgttgaccggcatgtcgacgtaacgccgcagcttgctgccgtattccggccgcatgcggcgactgccgagtggcgtggtcaagatgtcttc > 3:278658‑M1/1‑2 (MQ=255) ggTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCATGGAGGTAACCg < 8:28920/149‑1 (MQ=255) | CGAAGCTATCTCGGGCCTTGACCACTTGCGCCAATCCATCGAAGACATCTTGACCACGCCACTCGGCAGTCGCCGCATGCGGCCGGAATACGGCAGCAAGCTGCGGCGTTACGTCGACATGCCGGTCAACGAGGGGTGGAAAAGCGCGGTACAGGCCGAGGTGGCCCGTGCCTTGGGCCGCTGGGAGCCGCGCTTGCGGCTGGAGCGGGTGGTGGTCACCTCGGTGCTTGACGGGCAGATCGGCATGACGTTGACCGGCGAGTACCTGGGCAGCGCTGCCGTCATGGAGGTAACCG > NC_002947/3434792‑3435087 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |