New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3878284 | 57 (0.920) | 5 (0.080) | 4/256 | NT | 8.1% | coding (119/3180 nt) | mexF | multidrug RND transporter MexF |
? | NC_002947 | = 3878313 | 59 (0.990) | coding (148/3180 nt) | mexF | multidrug RND transporter MexF |
AGGCGCCACGCGGTTAAGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAG > NC_002947/3878137‑3878432 | aGGCGCCACGCGGTTAAGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAgtg < 7:157351/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCACGCGGTTAAGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAgtg < 7:99090/149‑1 (MQ=255) ccACGCGGTTAAGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTgcc < 8:180379/149‑1 (MQ=255) cACGCGGTTAAGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTgccg > 8:268289/1‑149 (MQ=255) aCGCGGTTAAGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTgccgc < 2:35712/149‑1 (MQ=255) cgcgGTTAAGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCTATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTgccgcc > 1:102244/1‑149 (MQ=255) ccacataGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCa < 1:139682/143‑1 (MQ=255) gTTAAGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCAcc < 1:107583/149‑1 (MQ=255) aGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCgtgg < 7:207906/149‑1 (MQ=255) gggACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCgtgg‑‑‑t > 5:345089/1‑149 (MQ=255) gACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCgtgg‑‑‑tg < 7:45265/148‑1 (MQ=255) ccTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTgc > 2:205083/1‑149 (MQ=255) ccTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTgc < 6:345089/149‑1 (MQ=255) aCTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAacttc < 8:13971‑M2/149‑6 (MQ=255) aCTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCAAG‑CTGATCGCGGATTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAactt < 1:111020‑M2/149‑5 (MQ=255) ttCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTtggcgcgcaccaccacggtgggcggcaccacttcgg > 1:166846‑M1/1‑113 (MQ=255) ttCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTccc > 3:102400/1‑149 (MQ=255) ctcGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTtggcgcgcaccaccacggtgggcggcaccacttcggg < 2:166846‑M1/148‑38 (MQ=255) cGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGgc > 7:216191/1‑149 (MQ=255) gAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑GTGTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGgc > 1:296393/1‑149 (MQ=255) gAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGgcg > 6:196536/1‑149 (MQ=255) gAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGCGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAACTtggcgcgcaccaccacggtgggcggcaccacttcggg < 7:53787‑M1/145‑38 (MQ=255) cttcATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAAcc > 1:143300/1‑149 (MQ=255) aTTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAAcccc > 7:331495/1‑147 (MQ=255) aTTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCaa < 1:205083/149‑1 (MQ=255) ttACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAg < 3:10277/149‑1 (MQ=255) aCCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGt > 2:122002/1‑149 (MQ=255) ccGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCa > 2:36355/1‑149 (MQ=255) cGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCAt < 5:252402/149‑1 (MQ=255) gATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGc > 4:41078/1‑148 (MQ=255) cgccgcGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGc < 6:213883/142‑1 (MQ=255) cgccgcGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGc < 7:13971/142‑1 (MQ=255) cgccgcGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGaaa < 8:270418/146‑1 (MQ=255) gccgcGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCaa > 7:158073/1‑131 (MQ=255) gccgcGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCaa < 8:158073/131‑1 (MQ=255) gccgcGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGATTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCg < 2:111020/148‑1 (MQ=255) cgcgGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGACCACCGTGGGGAGGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCg > 1:126266/1‑149 (MQ=255) gTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAg < 8:216191/147‑1 (MQ=255) ct‑g‑ctgATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAgg < 4:153780/148‑1 (MQ=255) t‑g‑ctgATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTtggcgcgcaccaccacggtgggcggcaccacttc < 6:204913‑M1/92‑35 (MQ=255) t‑g‑ctgATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTtggcgcgcaccaccacggtgggcggcaccacttc > 5:204913‑M1/1‑58 (MQ=255) t‑g‑ctgATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGc > 6:19867/1‑148 (MQ=255) ctgCTCGCGGGGTCCATCGCGCGGGTCCAGCGGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGGGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGcc < 8:331495/147‑1 (MQ=255) tCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTAcc > 5:123808/1‑149 (MQ=255) cgGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGgt < 7:268289/149‑1 (MQ=255) gTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGtgtg < 5:300431/149‑1 (MQ=255) gTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGtgtg < 4:102400/149‑1 (MQ=255) ttCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAATGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGtgtg > 7:251050/1‑148 (MQ=255) ttCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGtgtg > 7:317441/1‑148 (MQ=255) cGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATg > 8:80781/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCGTCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGc < 3:120663/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACa < 2:102244/146‑1 (MQ=255) ttCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCGCTCCCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATg < 1:122002/147‑1 (MQ=255) ccAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCg > 4:249193/1‑92 (MQ=255) ccAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCg < 3:249193/92‑1 (MQ=255) ccAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTAc < 2:143300/148‑1 (MQ=255) ccGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcctc > 7:306633/1‑149 (MQ=255) cGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcctcc < 5:19867/149‑1 (MQ=255) gATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtc < 4:268484/144‑1 (MQ=255) gATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtc > 3:268484/1‑144 (MQ=255) tCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcctcc < 4:8022/146‑1 (MQ=255) tCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcctcc > 3:8022/1‑146 (MQ=255) cAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGt > 7:64293/1‑149 (MQ=255) cGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcct > 8:345608/1‑140 (MQ=255) cGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGtcct < 7:345608/140‑1 (MQ=255) cccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAagttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacgcgcgatcagcagcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggtaatgaagaatttc < 7:53787‑M2/145‑109 (MQ=255) cccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAacttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagcagcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggtaatgaagaatttcgag < 2:166846‑M2/148‑112 (MQ=255) ccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAacttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagcagcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggtaatgaagaatttcgagaa > 1:166846‑M2/1‑36 (MQ=255) ccGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGAc > 5:160931/1‑149 (MQ=255) gAAGTtggcgcgcaccaccacggtgggcggcaccacttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagcagcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggtaatgaagaatttcgagaagt < 8:13971‑M1/149‑145 (MQ=255) gAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAacttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagca > 5:204913‑M2/1‑34 (MQ=255) gAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAacttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaacccgcgatcagca < 6:204913‑M2/92‑59 (MQ=255) aaGTtggcgcgcaccaccacggtgggcggcaccacttcggggtattcgctgatcggcagctggaacagcgagatggaatccgcgatcagcttgcaccagcgacagcaccgcggcgaagatcggccgggtaatgaagaatttcgagaagt < 1:111020‑M1/149‑146 (MQ=255) gtggtgCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCaa < 2:126266/149‑1 (MQ=255) tggtgCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAg < 2:296393/149‑1 (MQ=255) tggtgCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAg < 3:41078/149‑1 (MQ=255) tggtgCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAg < 4:221598/149‑1 (MQ=255) | AGGCGCCACGCGGTTAAGGGACCCTACCGATGAACTTCTCGAAATTCTTCATTACCCGGCCGATCTTCGCCGCGGTGCTGTCGCTGGTGCT‑G‑CTGATCGCGGGTTCCATCTCGCTGTTCCAGCTGCCGATCAGCGAATACCCCGAAGTGGTGCCGCCCACCGTGG‑‑‑TGGTGCGCGCCAACTTCCCCGGCG‑‑‑CCAACCCCAAGGTCATCGGCGAAACCGTTGCCGCGCCGCTGGAGCAGGCCATTACCGGTGTGGAGAACATGCTGTACATGTCCTCCCAGTCCACTGCGGACGGCAAG > NC_002947/3878137‑3878432 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |