New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4090228 = | 49 (0.790) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.6% | coding (279/1365 nt) | gudP | glucarate transporter |
? | NC_002947 | 4090287 = | 54 (0.920) | coding (338/1365 nt) | gudP | glucarate transporter |
ACGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAGGAACGCGGCA > NC_002947/4090083‑4090373 | aCGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAg < 2:137720/149‑1 (MQ=255) tcggggcgaacagtgcagtggcgaaatactgcgccgagttgaagatggccgacgccgtgccgcgttcctgggtcgggaaccatgcggcgacgatgcgcgcgttacccgggaatgacggggcttcggcgaaaccgaccaggaagcGCAgg > 5:324883‑M1/145‑149 (MQ=255) ggggcgaacagtgcagtggcgaaatactgcgccgagttgaagatggccgacgccgtgccgcgttcctgggtcgggaaccatgcggcgacgatgcgcgcgttacccgggaatgacggggcttcggcgaaaccgaccaggaagcGCAggg > 3:78507‑M1/143‑148 (MQ=255) ccTCGGTAATATCTTTTCCGCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCg > 5:279448/1‑149 (MQ=255) cTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCgg > 1:217139/1‑149 (MQ=255) cTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCgg > 7:182221/1‑149 (MQ=255) cTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCgg < 6:108408/149‑1 (MQ=255) ggTTATATCTTTTCCGCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTgg > 6:45947/1‑149 (MQ=255) ttCCGCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCg < 1:190589/145‑1 (MQ=255) gCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGtttt > 8:52260/1‑126 (MQ=255) gCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGtttt < 7:52260/126‑1 (MQ=255) cTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCGTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTggg < 6:300985/149‑1 (MQ=255) cGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGc < 5:259998/147‑1 (MQ=255) gATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTg < 6:279448/149‑1 (MQ=255) cTTACGTCGCAGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGCTCGCTTCGGTTCCAAGCACGCGTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCAcc < 6:117563/149‑1 (MQ=255) gTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTAACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCtt > 3:302880/1‑149 (MQ=255) gctggcCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCAc > 5:262637/1‑149 (MQ=255) ccAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTgc > 2:168350/1‑149 (MQ=255) ccAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTgc < 2:217139/149‑1 (MQ=255) cAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTgcg > 8:200843/1‑149 (MQ=255) gtgccgcgttcctgggtcgggaaccatgcggcgacgatgcgcgcgttacccgggaatgacggggcttcggcgaaaccgaccaggaagcGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTgcgc > 5:243604‑M1/89‑149 (MQ=255) tggtggCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTgg > 6:59591/1‑149 (MQ=255) gtggCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTc < 3:56432/149‑1 (MQ=255) gtggCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTc < 5:45947/149‑1 (MQ=255) tggctACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGttt > 4:311950/1‑149 (MQ=255) tcgggaaccatgcggcgacgatgcgcgcgttacccgggaatgacggggcttcggcgaaaccgaccaggaagcGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCtt < 2:227883‑M1/63‑1 (MQ=255) tcgggaaccatgcggcgacgatgcgcgcgttacccgggaatgacggggcttcggcgaaaccgaccaggaagcGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCtt > 1:227883‑M1/73‑135 (MQ=255) gctACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGc > 4:216552/1‑91 (MQ=255) gctACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGc < 3:216552/91‑1 (MQ=255) gctACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGc > 8:350067/1‑91 (MQ=255) gctACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGc < 7:350067/91‑1 (MQ=255) ctACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGc < 4:378015/149‑1 (MQ=255) gATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGc > 4:210882/1‑149 (MQ=255) ggttgggTTCAAAGAACGTCTACGCCTTGAGCATCTTCACCTGCTCGCTGTTCACCATTCTGCATGGTTTTGTCTGTGGACTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGATTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGcccc < 4:302880/143‑1 (MQ=255) cTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGt > 8:41984/1‑149 (MQ=255) cAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCgg < 8:1872/149‑1 (MQ=255) aaGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCggg > 6:23524/1‑149 (MQ=255) aGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCggg > 7:256575/1‑148 (MQ=255) gAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTa < 7:41984/149‑1 (MQ=255) aCGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAAc < 3:311950/149‑1 (MQ=255) gTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGACCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAAcgc > 1:312751/1‑149 (MQ=255) tCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAAcgcg > 8:49846/1‑149 (MQ=255) tACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAAcgcgcg > 6:238248/1‑149 (MQ=255) ccTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTCTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCAtc > 7:5709/1‑149 (MQ=255) cACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATg < 7:200843/147‑1 (MQ=255) cACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATg < 1:168350/147‑1 (MQ=255) cTGGTCGCGGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTcc < 3:317632/149‑1 (MQ=255) tGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACACAg > 3:45495/1‑149 (MQ=255) ttCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAgg > 7:202531/1‑148 (MQ=255) cACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAGGAAc > 7:733/1‑149 (MQ=255) cACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCCGTCGCCTGCCGGATGCCTGGGCCGTGGTCAGCCTCTTCACCCTGCGATTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGACATACCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCAAGGTTCCCGACCCAGGAAc > 4:290469/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAGGAAcg > 8:3215/1‑149 (MQ=255) cccTGATGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTTCCTGGGACGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCTCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAGGAAcgc < 4:45495/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAGGAAcgcg > 1:179217/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAGGAAcgcg < 7:311974/149‑1 (MQ=255) tgctgcAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGAccc > 3:347010/1‑138 (MQ=255) tgctgcAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGAccc < 4:347010/138‑1 (MQ=255) ctgcAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAGGAACGCGGCa < 5:59591/148‑1 (MQ=255) ctgcAGGGTTTTGTCGGTGGCCTCCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCAGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAGGAACGCGGc < 4:176169/147‑1 (MQ=255) | ACGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTCGGATGGGCTTACGTGGCTGGCCAGATTCCTGGTGGCTGGCTACTCGATCGCTTCGGTTCCAAGAACGTCTACGCCTTCAGCATCTTCACCTGGTCGCTGTTCACCCTGCTGCAGGGTTTTGTCGGTGGCCTGCCGGTTGCCTGGGCCGTGGTCACCCTCTTCACCCTGCGCTTCCTGGTCGGTTTCGCCGAAGCCCCGTCATTCCCGGGTAACGCGCGCATCGTCGCCGCATGGTTCCCGACCCAGGAACGCGGCA > NC_002947/4090083‑4090373 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |