New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4553242 | 57 (0.920) | 3 (0.050) | 3/260 | NT | 5.4% | coding (1684/1797 nt) | PP_4041 | glycoside hydrolase |
? | NC_002947 | = 4553296 | 50 (0.830) | coding (1630/1797 nt) | PP_4041 | glycoside hydrolase |
TCTACTCCGGTCAAGGCAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTC > NC_002947/4553094‑4553389 | tCTACTCCGGTCAAGGCAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTG > 4:128486‑M1/1‑149 (MQ=255) tCCGGTCAAGGCAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTggccgg > 1:27542/1‑149 (MQ=255) tCCGGTCAAGGCAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTggccgg > 6:151615/1‑149 (MQ=255) ccGGTCAAGGCAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTggccggc > 4:9722/1‑149 (MQ=255) cGGTCAAGGCAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTggccggcc > 5:66331/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCggg < 4:201393/149‑1 (MQ=255) gCAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGt > 2:37731/1‑148 (MQ=255) cAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTAc < 2:336052/149‑1 (MQ=255) cccTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCg > 3:158591/1‑149 (MQ=255) cTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGc < 2:27542/149‑1 (MQ=255) tCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCcagc > 6:227384/1‑149 (MQ=255) cATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGGG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTAGGcccg > 1:32819/1‑145 (MQ=255) ttCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCcag < 8:121820/145‑1 (MQ=255) ttCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCcag > 7:121820/1‑145 (MQ=255) cGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGc < 5:39124/148‑1 (MQ=255) gCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGcc < 5:151615/148‑1 (MQ=255) gCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGcc < 6:245115/148‑1 (MQ=255) gCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCg > 3:119353/1‑149 (MQ=255) aCCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAgg < 3:372046/149‑1 (MQ=255) cccACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCTGCTGGCCGaa < 8:169818/147‑2 (MQ=255) ccACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTc > 5:166924/1‑149 (MQ=255) ccACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTc < 6:140093/149‑1 (MQ=255) ccACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTc < 3:354662/149‑1 (MQ=255) ccACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATAATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTc > 4:374458/1‑149 (MQ=255) acaACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGt > 4:63559/1‑149 (MQ=255) aaCGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTg > 4:313725/1‑149 (MQ=255) cgcgCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGca < 3:9722/149‑1 (MQ=255) tgcCCGG‑CGCGCGACCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGca > 6:281301/2‑147 (MQ=255) tgcCCGG‑CGCGCGACCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGca > 5:318831/2‑147 (MQ=255) cgcCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGcaca < 1:37731/149‑1 (MQ=255) gcCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGaccggcctgtgcaacgacctcggcctgctggccgaacagtacgacccg > 2:150427‑M1/1‑101 (MQ=255) cGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGcc < 3:128486/149‑1 (MQ=255) gcgcg‑cCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGaccggcctgtgcaacgacctcggcctgctggccgaacagtacgacccggccggcca < 1:150427‑M1/149‑57 (MQ=255) gcgcg‑cCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGt > 3:22940/1‑147 (MQ=255) g‑cCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGTCCCAATTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGaccggcctgtgcaacgacctcggcctgctggccgaacagtacgacccggccggccagc < 1:131105‑M1/149‑59 (MQ=255) ccGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGgtgt > 5:262693/1‑149 (MQ=255) gggCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTg < 3:313725/149‑1 (MQ=255) ggCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTcag < 7:263315‑M2/142‑4 (MQ=255) gCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGt < 2:343355/149‑1 (MQ=255) cTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACa < 4:119353/149‑1 (MQ=255) tgCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAg < 4:158591/147‑1 (MQ=255) cAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCtt < 6:45634/149‑1 (MQ=255) cAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCtt < 3:63559/149‑1 (MQ=255) gATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCGGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTg > 4:379488/1‑149 (MQ=255) gATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTg < 4:22940/149‑1 (MQ=255) aTTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTTTCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTgg < 7:285295/149‑1 (MQ=255) ttCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTgg < 5:281301/148‑1 (MQ=255) gtgtTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGccc < 6:318831/149‑1 (MQ=255) ataatgC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTa < 3:374458/145‑1 (MQ=255) tgatgC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAac < 2:324872/149‑1 (MQ=255) gC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCAGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGACGGTCAGGTCTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGACTGGCGCCCCAGTAAcaca > 8:333205/1‑148 (MQ=255) gCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTca < 7:187695/148‑1 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGccc < 6:162101/127‑1 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGccc > 5:162101/1‑127 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTcagc > 2:210364/1‑148 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTc < 6:316595/145‑1 (MQ=255) tGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTc > 5:316595/1‑145 (MQ=255) aaGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAaca > 6:15350/1‑133 (MQ=255) aaGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTcagcca < 6:262693/148‑1 (MQ=255) cTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGccagccag > 8:317180/1‑148 (MQ=255) ggggAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCTGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAgaac < 3:379488/148‑1 (MQ=255) gAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGATCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTAGGTACAGCGCTTCCGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACCTCAGCCAGCCAgaacgaac > 6:248148/1‑149 (MQ=255) gAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAgg > 6:168710/1‑148 (MQ=255) gcgcTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCAAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGc > 5:163074/1‑149 (MQ=255) cgcTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGc < 6:166924/148‑1 (MQ=255) gcTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTcagcgcatgctcggcaacttcccccaggccttcagccagataattgggacatcaacaccgcgctgaatctgcaccgcgcacagtgcccggc < 1:131105‑M2/149‑92 (MQ=255) gcTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGccc > 2:269803/1‑149 (MQ=255) gcTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGccc > 5:42721/1‑149 (MQ=255) cTGaccggcctgtgcaacgacctcggcctgctggccgaacagtacgacccggccggccagcgcatgctcggcaacttcccccaggccttcagccagataggcatcatcaacaccgcgctgaatctgcaccgcgcacagtgcc < 7:263315‑M1/142‑140 (MQ=255) tGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTcagcgcatgctcggcaacttcccccaggccttcagccagataggcatcatcaacaccgcgctgaatctgcaccgcgcacagtgcccggcgcgc < 1:150427‑M2/149‑94 (MQ=255) | TCTACTCCGGTCAAGGCAGTCGCCCTACTCATTCGCTACCCACAACGCGCCCGGTCGCGCG‑CCGGGCACTGTGCGCGGTGCAGATTCAGCGCGGTGTTGATGATGC‑‑CTATCTGGCTGAAGGCCTGGGGGAAGTTGCCGAGCATGCGCTGGCCGGCCGGGTCGTACTGTTCGGCCAGCAGGCCGAGGTCGTTGCACAGGCCGGTCAGGTGTTGGTACAGCGCTTCGGCTTTGGCCTGGCGCCCCAGTAACACATAAACGTCAGCCAGCCAGAACGAACACACCAGGAAGGTGCCCTC > NC_002947/4553094‑4553389 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |