New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4933751 = | 61 (0.980) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 6.9% | coding (698/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
? | NC_002947 | 4933806 = | 51 (0.870) | coding (643/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
GCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCTGGCGCGGCTCTTCGATCTCGGCGG > NC_002947/4933603‑4933898 | cgcctgcagcgcatcggcctgtccgggccgatcgcccgcgagctgctggacctgaccgccgagatcgaagagccgcgccaggcctggcgcatgctgctggctcacttggcacggatgatcgaagtgcctgaaatcgagccgatcgaaga > 1:227304‑M1/149‑149 (MQ=255) cgcctgcagcgcatcggcctgtccgggccgatcgcccgcgagctgctggacctgaccgccgagatcgaagagccgcgccaggcctggcgcatgctgctggctcacttggcacggatgatcgaagtgcctgaaatcgagccgatcgaaga > 1:233024‑M1/149‑149 (MQ=255) ccGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAgg > 3:338056/1‑149 (MQ=255) cGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAggg < 2:39495/149‑1 (MQ=255) cagcgcatcggcctgtcggggccgatcgcccgcgagctgctggacctgaccgccgagatcgaagagccgcgccaggcctggcgcatgctgctggctcacttggcacggatgatcgaagtgcctgaaatcgagccgatcgaagAGggtg > 6:247491‑M1/143‑148 (MQ=255) cagcgcatcggcctgtccgggccgatcgcccgcgagctgctggacctgaccgccgagatcgaagagccgcgccaggcctggcgcatgctgctggctcacttggcacggatgatcgaagtgcctgaaatcgagccgatcgaagAGggtgg > 5:189693‑M1/143‑149 (MQ=255) cagcgcatcggcctgtccgggccgatcgcccgcgagctgctggacctgaccgccgagatcgaagagccgcgccaggcctggcgcatgctgctggctcacttggcacggatgatcgaagtgcctgaaatcgagccgatcgaagAGggtg > 1:43763‑M1/143‑148 (MQ=255) tCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGggtggt < 4:182225/149‑1 (MQ=255) aCGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTTACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGggtggtggt > 6:109290/1‑149 (MQ=255) aCGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGggtggtggt < 1:358737/149‑1 (MQ=255) aCGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGggtggtggt > 3:115253/1‑149 (MQ=255) gTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCAAGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCt > 7:83346/1‑149 (MQ=255) tAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGTGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCtt < 3:147772/149‑1 (MQ=255) tCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGggtggtg < 8:215718/140‑1 (MQ=255) tCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCACggtggtg > 7:215718/1‑140 (MQ=255) cGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGc > 3:320450/1‑149 (MQ=255) gCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGccc > 1:292050/1‑149 (MQ=255) cGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCccgcc > 3:219939/1‑149 (MQ=255) gTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTGCTGAGCGCCGAGACGGAAGCTGTCCCTGCTCACGAGCGGCAGGTTCTGCGCGGCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCCGCGTGGCCAGGGTGGTGGGCTTGCCCATGCccgccg > 4:97865/1‑149 (MQ=255) ttGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCgg < 8:14905/149‑1 (MQ=255) gAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCAt < 4:1597/138‑1 (MQ=255) gAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCAt > 3:1597/1‑138 (MQ=255) aGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGc < 4:320450/148‑1 (MQ=255) aGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGc < 6:297201/148‑1 (MQ=255) aGGATGCGGCCCAGGGGCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTTACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGc < 5:109290/148‑1 (MQ=255) aTGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGAc > 3:380982/1‑149 (MQ=255) gCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCa > 6:139546/1‑149 (MQ=255) gCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCAATGCTAACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCa > 6:48297/1‑149 (MQ=255) cGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCAt < 6:377852/149‑1 (MQ=255) ggCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATg > 8:1246/1‑149 (MQ=255) tCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATcacc < 8:261121/149‑1 (MQ=255) tCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATcacc < 4:338056/149‑1 (MQ=255) ttGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATcacccc > 8:338277/1‑149 (MQ=255) ttGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGATCACAAGAGCCAGGTTCTGCGCGACGTACTTGAGCACGTAGAGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGCTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATcaccc > 3:360753/1‑148 (MQ=255) gAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGACAGCTTGGCCAGCGTGGTGGACTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATcaccccac > 7:145542/1‑149 (MQ=255) accgcggcgatcgaagagccgcgccaggcctggcgcatgcggctggctcacttggcacggatgatcgaagtgcctgaaatcgagccgatcgaagAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATcaccccacc > 4:341379‑M1/95‑147 (MQ=255) ccgagatcgaagagccgcgccaggcctggcgcatgctgctggctcacttggcacggatgatcgaagtgcctgaaatcgagccgatcgaagAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTc > 4:203856‑M1/91‑149 (MQ=255) cgagatcgaagagccgcgccaggcctggcgcatgctgctggctcacttggcacggatgatcgaagtgcctgaaatcgagccgatcgaagAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTc < 4:274092‑M1/59‑1 (MQ=255) agatcgaagagccgcgccaggcctggcgcatgctgctggctcacttggcacggatgatcgaagtgcctgaaatcgagccgatcgaagAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGAt > 3:274092‑M1/88‑149 (MQ=255) cgcCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGc < 5:127705/149‑1 (MQ=255) cGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCggg < 8:255082/110‑1 (MQ=255) cGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCggg > 7:255082/1‑110 (MQ=255) ggAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCCCCCTCTTCGATCGGCTCGAttt > 7:365134/1‑147 (MQ=255) ggAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCa < 8:145542/149‑1 (MQ=255) aGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAgg > 3:15872/1‑148 (MQ=255) tCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTc > 3:50155/1‑149 (MQ=255) tCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTc > 2:37277/1‑149 (MQ=255) tCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTc > 3:86220/1‑149 (MQ=255) tCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTc > 3:91510/1‑149 (MQ=255) cATGCTCACCAGCGCCATGTTCTGCGCGACGTACTTGAGCACGTCGCGCGCGGCCAGCGTGGCAAGGGTGGTGGGCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGa < 4:273162/149‑1 (MQ=255) tGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGTCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGatc < 5:48297/149‑1 (MQ=255) tGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGatc < 5:139546/149‑1 (MQ=255) tCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGatcatc > 3:226308/1‑149 (MQ=255) aCCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATcc < 4:380982/148‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGt < 7:1246/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCGGCGCGCCCTACAGCCGCACGTACCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGGGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGACCACCCCACCCTCTCCCATCGGCGCGTTTTCAGGCACTTCGACCATCCGTGCCAAgg < 6:265904/149‑2 (MQ=255) gTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGGGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAg < 7:11363/149‑1 (MQ=255) ttCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACtt < 6:70178/127‑1 (MQ=255) ttCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACtt > 5:70178/1‑127 (MQ=255) tCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGcc < 4:15872/149‑1 (MQ=255) cGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATg > 2:158178/1‑149 (MQ=255) gAGCACGTAGCGCGCTGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGACCATTCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAg < 4:91510/148‑1 (MQ=255) gAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGAGCTTGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAg < 4:86220/148‑1 (MQ=255) gAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAgg > 7:303265/1‑149 (MQ=255) cACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGACCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCt < 4:115253/149‑1 (MQ=255) cGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCACCAGCATGCGCCAGGCCTgg < 4:115310/149‑1 (MQ=255) gcgcgcGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCTGgcgc < 1:158178/148‑1 (MQ=255) gcgcgGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAACTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCTGGCGCGGc > 2:372586/1‑149 (MQ=255) gcgcgGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGACCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGTACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCTGGCGCGGc > 2:42848/1‑149 (MQ=255) gacAGCTTGGCCTGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCTGGCGCGGCTCTTc < 3:337711/147‑1 (MQ=255) ccAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCTGGCGCGGCTCTTc > 5:359051/1‑148 (MQ=255) gCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCTGGCGCGGCTCTTCGAtc > 7:358172/1‑149 (MQ=255) cAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGCCCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCTGGCGCGGCTCTTCGATCTcggcgg > 7:280022/1‑149 (MQ=255) | GCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGCGCGGCCAGCTTGGCCAGGGTGGTGGTCTTGCCCATGCCCGCCGGGCCGACCATGGCGATCACCCCACCCTCTTCGATCGGCTCGATTTCAGGCACTTCGATCATCCGTGCCAAGTGAGCCAGCAGCATGCGCCAGGCCTGGCGCGGCTCTTCGATCTCGGCGG > NC_002947/4933603‑4933898 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |