| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 6113467 | 58 (0.980) | coding (597/1446 nt) | clsA | cardiolipin synthase | |||||
AAGCACGCGATGTGGTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGC > NC_002947/6113298‑6113590 | aaGCACGCGATGTGGTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTcc < 8:273864/149‑1 (MQ=255) aGCACGCGATGTGGTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGGCGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCa > 1:218843/1‑149 (MQ=255) cACGCGATGTGGTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGc < 5:173137/149‑1 (MQ=255) aCGCGATGTGGTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGc > 4:291458/1‑148 (MQ=255) aCGCGATGTGGTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGc > 1:67724/1‑148 (MQ=255) gATGTGGTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGGGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAg > 4:87499/1‑149 (MQ=255) tgtgGTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCacgcagcacct > 8:76955‑M1/1‑138 (MQ=255) tgGTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAg < 1:187985/149‑1 (MQ=255) gTACTGGTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGt > 4:341429/1‑149 (MQ=255) gTGCAGTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCg > 6:91021/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCacgcagcacctggctgtagctggacg < 3:345744‑M1/149‑27 (MQ=255) gTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTgacg > 1:346416‑M2/1‑145 (MQ=255) gTTCTTCATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTgacg < 8:69120‑M2/149‑5 (MQ=255) ttcttcATCATTCATGACGACACCCTCGGCAAGGCACTGCAGCAACTCTTGCTACGCAAAGCCGCCGAAGGCGTGCAGGTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTgacgg < 3:274164‑M2/149‑6 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |