New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 247985 = | 57 (0.920) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.9% | coding (253/588 nt) | PP_0197 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 248055 = | 43 (0.750) | coding (323/588 nt) | PP_0197 | hypothetical protein |
GGTGGCCTGCGCTGGCTGATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCCTGCTGGAAGTGCCCG > NC_002947/247907‑248201 | ggTGGCCTGCGCTGGCTGATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGTCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCaa > 4:110721/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCTGCGCTGGCTGATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCaa < 3:123937/149‑1 (MQ=255) gCCTGCGCTGGCTGATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCtg < 3:186032/149‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGCTGATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCtgtt < 7:180227/149‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGCTGATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCtgtt > 1:119040/1‑149 (MQ=255) gctggctgATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTgc < 5:5623/149‑1 (MQ=255) ggcggATCATGGGCAGCGCGCTGCTGGTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGGTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCGGTCCAACCTGTTGTGCGCa < 2:277333/149‑1 (MQ=255) ctgATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTTCGCAgt > 4:55314/1‑149 (MQ=255) tgATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTgcg > 1:363771/1‑144 (MQ=255) tgATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTgcg < 2:363771/144‑1 (MQ=255) tCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGtt > 1:148963/1‑148 (MQ=255) tCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTg < 4:57594/149‑1 (MQ=255) aTGGGCAGCGCGCTGCTGATCCTGCTAGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAAACGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTACGTAGCGGTAGCTGCGCTCGCCTTCTTCGCAATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGATCAGTGTTGAt > 1:9164/1‑149 (MQ=255) tGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATc < 5:188153/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCtt > 2:260983/1‑148 (MQ=255) gCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTc < 4:171445/149‑1 (MQ=255) cAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCa < 3:153856/149‑1 (MQ=255) gctgctGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCg > 1:19575/1‑149 (MQ=255) gctgctGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCg > 2:242719/1‑149 (MQ=255) ttCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCACCCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGtt > 6:293668/1‑149 (MQ=255) gAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCgg < 1:243271/149‑1 (MQ=255) aGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGc > 5:84221/1‑149 (MQ=255) cgcATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGa < 2:19575/149‑1 (MQ=255) cgcATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGa < 2:148963/149‑1 (MQ=255) tGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGTCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGAtgtg < 3:110721/149‑1 (MQ=255) tGGGTGGTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGGGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGAtgtg < 3:66549/149‑1 (MQ=255) gggTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTgg > 8:175578/1‑149 (MQ=255) gggTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTgg > 3:20550/1‑149 (MQ=255) gtgtTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTc < 8:130884/149‑1 (MQ=255) ttCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCATGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGc > 8:257955/1‑149 (MQ=255) aaCCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTc > 1:195322/1‑148 (MQ=255) ttgtGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCt > 6:112771/1‑149 (MQ=255) TGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGa > 5:112771‑M1/1‑149 (MQ=255) gacagcacgctccacacggcgaagaaggccaccgccgctaccgctacgaagccggaaattgctgtccaACCTCTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATAGCAGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCtcgcc > 2:181239‑M2/69‑146 (MQ=255) GACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGAc < 2:274249‑M1/148‑1 (MQ=255) GACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACa > 6:84221‑M1/1‑149 (MQ=255) ACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACaa > 2:119040‑M1/1‑149 (MQ=255) cacgctccacatggcgaagaaggccaccgccgctaccgctacgaagccggaaagtgctgtccaACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTc > 8:45394‑M2/64‑105 (MQ=255) cacgctccacatggcgaagaaggccaccgccgctaccgctacgaagccggaaagtgctgtccaACCTGTTGTGCGCAGTGTTGAACTTCACGGTCGGGCCGTTTc < 7:45394‑M2/42‑1 (MQ=255) CACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCt < 1:382175‑M1/149‑1 (MQ=255) CACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCt < 7:332565‑M1/149‑1 (MQ=255) tttCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCt > 8:198906/1‑136 (MQ=255) tttCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCt < 7:198906/136‑1 (MQ=255) tCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCg < 7:175578/148‑1 (MQ=255) gtagcggtagcgGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACAACCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCg > 6:210327/1‑149 (MQ=255) gcggtagcggCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCggg < 7:5744/148‑1 (MQ=255) cggtagcggCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGt > 8:148075/1‑148 (MQ=255) tagcggCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATc > 6:321840/1‑149 (MQ=255) gcggcgGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCACGACAAGCCTGGCGGGAAAGGCCGGGTGATCg < 1:242719/148‑1 (MQ=255) cggcggTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCt < 2:382175/149‑1 (MQ=255) cggTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTGGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATc < 1:274249/149‑1 (MQ=255) tGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAAc < 5:210327/149‑1 (MQ=255) gCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCATGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTCTCACCct > 4:5772/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACctgct > 5:340945/1‑149 (MQ=255) cttcGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACctgct < 6:340945/147‑1 (MQ=255) gCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCctgctg > 5:289939/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCCTGCTgg < 8:332565/149‑1 (MQ=255) tgtccaACCTGTTGTGCGCAGTGTAGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTCCTGTTCACCACCCTGCTGGAAGTg > 8:247284‑M2/7‑149 (MQ=255) tccaACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCCTGCTGGAAGTg < 5:293668‑M2/143‑1 (MQ=255) caACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCctgctg > 7:126006‑M2/3‑139 (MQ=255) caACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCctgctg < 8:126006‑M2/137‑1 (MQ=255) caACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCCTGCTGGAAGTGccc > 3:101110‑M2/3‑148 (MQ=255) caACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCCTGCTGGAAGTGccc > 5:54553‑M2/3‑148 (MQ=255) aACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCAGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGCCACCCTCGACAAGACTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTAGCAACCTGCGGTGACCCACCCTGCTGGACGTTCCCg > 4:229255‑M2/2‑148 (MQ=255) aACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCAAGGTCGGGCCGTTTCGAATCTGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCCTGCTGGAAGTGCCCg > 2:383573‑M2/2‑148 (MQ=255) | GGTGGCCTGCGCTGGCTGATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGCGCATGGGTGTTTCGGCAACCGTGTTGTGGACAGCACTTTCCGGCTTCGTAGCGGTAGCGGCGGTGGCCTTCTTCGCCATGTGGAGCGTGCTGTCCAACCTGTTGTGCGCAGTGTTGATCTTCACGGTCGGGCCGTTTCGCATCGGCGATGTGGTCGAGCTGGTCGACACCCTCGACAAGCCTGGCGTGAAAGGCCGGGTGATCGCTATCAACCTGCTGTTCACCACCCTGCTGGAAGTGCCCG > NC_002947/247907‑248201 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |