| New junction evidence | |||||||||||
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tggcTGCTGGCCCGTGGTTTGCGCGGGGTGCTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCCCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCCGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCgg > 4:126578/1‑149 (MQ=255) gctgctGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AAGTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGTCTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCgg < 1:156/147‑1 (MQ=255) gctgctGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGc < 6:46660/149‑1 (MQ=255) ctgGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGc < 5:255581/149‑1 (MQ=255) tgGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCg > 4:315435/1‑149 (MQ=255) tgGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCg > 2:295734/1‑149 (MQ=255) cgcgTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGtct < 1:81627/149‑1 (MQ=255) gcgTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGtctc < 1:333088/149‑1 (MQ=255) gTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAAtg > 6:44531/1‑149 (MQ=255) tttGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAAtgc > 7:156135/1‑149 (MQ=255) cgcgGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAAtgcttgc < 2:106430/149‑1 (MQ=255) gcgGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAAtgcttgct < 4:195328/149‑1 (MQ=255) gTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCg < 1:252607‑M2/148‑1 (MQ=255) tggtgCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGt > 3:350853/1‑149 (MQ=255) | ACACCGACGAAGGCGGAATCTGCGCCCGCTCGGCCACGCTGTAGATAGAAAGTGCTGCCACCCCTTGTTCGGCCAACAGCTCACGCGCAGCCGCCAGGATCGCCTCGATCCTGGCCTGGCTGCTGGCGCGTGGTTTGCGCGGGGTGGTGGTGCGGTTCATC‑AACTGCTGATTGCCAGGATGCTGGCCTGGTAGGCGCCGACGAACAGGTCGAAGTCACCGACTTCGTTTTGCTCCAGCTCGGACTGCCTGGCGAGCGACTCGCGGGCCAGCGTCTCGAATGCTTGCTGCTTTTCGT > NC_002947/296267‑296562 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |