New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 394324 = | 44 (0.710) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 7.0% | intergenic (+7/‑295) | purU‑I/fdhA | formyltetrahydrofolate deformylase/formaldehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | 394364 = | 37 (0.620) | intergenic (+47/‑255) | purU‑I/fdhA | formyltetrahydrofolate deformylase/formaldehyde dehydrogenase |
CAAAGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGC > NC_002947/394218‑394508 | cAAAGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTTGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacag > 6:297081/1‑148 (MQ=255) cAAAGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGGCGCTCCTGCAGGTacagg > 5:182646/1‑148 (MQ=255) cAAAGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacag > 6:139203/1‑148 (MQ=255) cAAAGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacag > 4:300760/1‑148 (MQ=255) gggtggcgctggggagtatgggcaaacagagaggcggcctgtgcgggcctcttcgcggctaaagccgctcttacgggggaccgcaccaacccgagggctgtgctGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacagca > 6:357402‑M1/105‑148 (MQ=255) aaTGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGt > 3:39022/1‑149 (MQ=255) cTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGt > 3:142193/1‑149 (MQ=255) tGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGta > 1:139395/1‑148 (MQ=255) gcaaacagagaggcggcctgtgcgggcctcttcgcggctaaagccgctcttacgggggaccgcaccaacccgagggctgtgctGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacagcaca < 4:59703‑M1/46‑1 (MQ=255) gcaaacagagaggcggcctgtgcgggcctcttcgcggctaaagccgctcttacgggggaccgcaccaacccgagggctgtgctGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacagcaca > 3:59703‑M1/84‑129 (MQ=255) gcgcGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTaa < 1:84565/149‑1 (MQ=255) gcgggcggTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTaa > 4:117620/1‑147 (MQ=255) gccggcggcGGGGTATCACAGCGCGCGACGGGCGCTCCTGCACGCCAACCCGACTGGCGCTCTGTAATACCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAACCCCGCGCCTACCGGTACAGCACAGCCCTCGCGTTCGTGCGGTCCCCCGTCaga < 6:335844/146‑1 (MQ=255) ggggTATCACATCGAGCGACGGTTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCtt > 6:208380/1‑147 (MQ=255) ggTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGc < 1:376170/149‑1 (MQ=255) tCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCcgc > 8:82723/1‑148 (MQ=255) acaTCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTATCCGCGaa > 4:96085/1‑149 (MQ=255) aTCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTccc < 8:250924/122‑1 (MQ=255) aTCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTccc > 7:250924/1‑122 (MQ=255) tCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAagag < 7:157561/149‑1 (MQ=255) cGACGGGTGTTCCTCAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAAAAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGAACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAATAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCg < 1:9061/149‑1 (MQ=255) gACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCCCAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGcc > 2:317152/1‑146 (MQ=255) gACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGcc < 1:317152/146‑1 (MQ=255) aCGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGca < 3:300760/149‑1 (MQ=255) gggTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGca > 4:152242/1‑147 (MQ=255) ccTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGgccgcc > 1:92641/1‑149 (MQ=255) tGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacagcacag > 8:297317/1‑82 (MQ=255) tGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacagcacag < 7:297317/82‑1 (MQ=255) tGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGGAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCctc > 1:10599/1‑149 (MQ=255) aCGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCctctc < 5:208380/148‑1 (MQ=255) cAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGttt > 8:50846/1‑149 (MQ=255) cAACCGGACTGTCGTTCTATAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCACCTAAAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAATAACGGCTTATTCCGCCAAGATGCCAGCACACGCCGCCTCTCTGttt > 7:31886/1‑149 (MQ=255) cTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCATCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGc > 6:881/1‑149 (MQ=255) aatacCCGGTACCGGCCGCTTCGCGGTTAAAGCCGATCCTACAGGTACACCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGTGCGGCTTAAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGac < 7:82723/148‑1 (MQ=255) ataccgggTACCGGCGTCTTCGGGGATAATGCCGATCCTACTGTTACATCACTGCCGTGGGGTTGTTGGGGTCCCCGGTATGAGCGGGTTTTGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGacac < 8:31886/143‑1 (MQ=255) tgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtacAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGc > 3:59703‑M2/47‑129 (MQ=255) tgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtacAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGc < 4:59703‑M2/83‑1 (MQ=255) tgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtacAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGCCAccc > 6:357402‑M2/45‑148 (MQ=255) ggTACCGGCCTCTTCGCGGATAACGCGGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCGGAAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGc < 2:139395/149‑1 (MQ=255) GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACCGCCCTGGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGcc > 4:142193‑M1/1‑149 (MQ=255) ACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGt < 3:63795‑M1/149‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGCTAACGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGACCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTaaaa < 4:39022/149‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTaaaa < 3:117620/149‑1 (MQ=255) ctctTTGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAg < 5:297081/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCa > 5:20051/1‑149 (MQ=255) cgcgGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCa < 3:152242/147‑1 (MQ=255) cTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATctctct > 8:154961/1‑149 (MQ=255) cTAAAGCCGCTCCTACAGGTACACCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATctctct < 1:205662/149‑1 (MQ=255) aaGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGt < 2:92641/148‑1 (MQ=255) cTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCcagt > 4:94155/1‑149 (MQ=255) aCAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCcagtca < 4:63795/149‑1 (MQ=255) cAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGT‑CCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCcagtcagt > 1:20327/1‑149 (MQ=255) cggtacAGCACCGCCCTCGGGTTGGGGCGGCCCCCCTTACCCGCGGCTTTTGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCcagtcagt < 2:10599‑M2/143‑1 (MQ=255) aGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCcagtcagt < 5:881/149‑1 (MQ=255) gtacAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTg > 2:20603‑M2/5‑148 (MQ=255) gtacAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTg > 8:45314‑M2/5‑148 (MQ=255) gtacAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGc < 5:139203‑M2/145‑1 (MQ=255) | CAAAGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGC > NC_002947/394218‑394508 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |