New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 948417 | 52 (0.840) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 7.6% | coding (894/1179 nt) | hmp | flavohemoprotein |
? | NC_002947 | = 948454 | 47 (0.790) | coding (931/1179 nt) | hmp | flavohemoprotein |
GCTGGTGCTGATCAGCGGAGGGGTGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGATGCCTACTTCCTCGGGCCC > NC_002947/948306‑948600 | gCTGGTGCTGATCAGCGGAGGGGTGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTggcg‑g > 4:226380/1‑149 (MQ=255) ggggtgaGCGGAGGGGGGGGGATTTCCCCGACCCGGGCGATGCTGCAGGCCGCCCTGGCAACCCGGGGCGC‑GGGGGATTTGATGCCCGGTGCGCGGTACGGCGCGGGGCATGCCTTCCGGGGCTGGGTCGATGGCCTGGCG‑GCGCGccc > 6:73398/7‑148 (MQ=255) aTCAGCGGAGGGGTGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATc > 7:193511/1‑148 (MQ=255) aGCGGAGGGGTGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGAAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCcaca > 5:306596/1‑149 (MQ=255) gCGGAGGGGTGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGACGGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCca > 1:117421/1‑147 (MQ=255) gCGGAGGGGTGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAg < 2:170410/149‑1 (MQ=255) cGGAGGGGTGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGc > 4:28150/1‑149 (MQ=255) aGGGGTGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCA‑GCGCGCCATCCACAGCTc > 2:351399/1‑148 (MQ=255) tGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGAAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAgcgc < 6:306596/149‑1 (MQ=255) gggCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGATTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCt < 1:73633/149‑1 (MQ=255) gCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTc > 8:3989/1‑149 (MQ=255) cATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTc > 4:260504/1‑148 (MQ=255) aTTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTa > 2:282532/1‑149 (MQ=255) aTTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTa < 3:260504/149‑1 (MQ=255) ttACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCGCGCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTa < 1:29650/149‑1 (MQ=255) aCCCCGACCCGGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCTA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTAc < 8:243590/147‑1 (MQ=255) cGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTAt > 2:161543/1‑149 (MQ=255) caggcagCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGt < 3:28150/147‑1 (MQ=255) ggcagCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGgcg < 6:190185/149‑1 (MQ=255) gcagcaCTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGgcgc > 2:199341/1‑149 (MQ=255) tGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGcc > 2:151300/1‑149 (MQ=255) cAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGa < 2:133575/149‑1 (MQ=255) aaaCCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGAc > 7:238428/1‑149 (MQ=255) cccGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGcc > 4:229908/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGt < 5:73398/149‑1 (MQ=255) cGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGt < 8:193511/149‑1 (MQ=255) ggCGCGA‑TGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTg < 3:27278/149‑1 (MQ=255) gcgcGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTgg < 1:338912/149‑1 (MQ=255) cgA‑GGTGCATTTCATGCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGTATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGtt < 1:161543/149‑1 (MQ=255) tGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCt > 4:234398/1‑148 (MQ=255) aTTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGt < 3:236313/149‑1 (MQ=255) tttCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGTCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGt > 5:269592/1‑148 (MQ=255) tttCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTgg < 6:279561/117‑1 (MQ=255) tttCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTgg > 5:279561/1‑117 (MQ=255) gcgTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCg > 3:248710/1‑149 (MQ=255) gcgTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCAATGGCCTGGCG‑Gcgcgccgttacgcgcacagtggatgaaatgcacctcgcgccgggtttgcagtgctgcctgcagcatcgccagggtcggggtaatgcccacccctccgct < 1:139234‑M2/149‑100 (MQ=255) cgTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGa < 6:282901/149‑1 (MQ=255) gTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAg < 3:229908/149‑1 (MQ=255) aaCGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTg > 6:217025/1‑149 (MQ=255) aCGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGCCGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTgg > 4:217146/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑Gcgcgccgttacgcgcacagtggatgaaatgcacctcgcgccgggtttgcagtgctgcctg > 5:140433‑M2/1‑44 (MQ=255) cGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑Gcgcgccgttacgcgcacagtggatgaaatgcacctcgcgccgggtttgcagtgctgcctg < 6:140433‑M2/104‑61 (MQ=255) cATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGa < 1:282532/149‑1 (MQ=255) tGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGc < 2:117421/149‑1 (MQ=255) ttCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGa > 6:89109/1‑149 (MQ=255) ccGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGa < 7:308997/147‑1 (MQ=255) ccGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACg > 2:15058/1‑149 (MQ=255) cGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTAAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGt < 3:234398/149‑1 (MQ=255) gACTGGATCGATGGCCTGGCA‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGa < 1:351399/149‑1 (MQ=255) gATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGATggc > 4:112760/1‑146 (MQ=255) gATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGATGcc < 3:226380/148‑1 (MQ=255) gATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGATGcc > 2:89851/1‑148 (MQ=255) aatGGCCTGGCG‑Gcgcgccgttacgcgcacagtggatgaaatgcacctcgcgccgggtttgcagtgctgcctgcagcatcgccagggtcggggtaatgcccacccctccgctgatcagcaccagcggcttgtcgctggctgccagggtg > 2:139234‑M2/2‑13 (MQ=255) aTGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGATGCCTACTTc > 1:192157/1‑149 (MQ=255) ccTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGATGCCTACTTCCTCg < 7:3989/149‑1 (MQ=255) gcg‑gcgCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGATGCCTACTTCCTCggg < 1:15058/147‑1 (MQ=255) g‑gcgCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGATGCCTACTTCCTCGGGccc > 3:12659/1‑148 (MQ=255) | GCTGGTGCTGATCAGCGGAGGGGTGGGCATTACCCCGACCCTGGCGATGCTGCAGGCAGCACTGCAAACCCGGCGCGA‑GGTGCATTTCATCCACTGTGCGCGTAACGGCGCGGTGCATGCCTTCCGGGACTGGATCGATGGCCTGGCG‑GCGCGCCATCCACAGCTCAAGCGCTTCTACTGCTATGCCGAGCCGGAAGGTGGCGCTGCGGCCGACGCCGTGGGTTTGCTCAGTGAAGACCTGCTCGCCGAGTGGCTGCCGCAGGAGCGTGACGTGGATGCCTACTTCCTCGGGCCC > NC_002947/948306‑948600 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |