| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1684586 = | 77 (1.240) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 5.1% | coding (286/333 nt) | hicB | HicB family nuclease |
| ? | NC_002947 | 1684636 = | 77 (1.310) | coding (236/333 nt) | hicB | HicB family nuclease | |||||
CCGCGCCAATCCGATACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCACCGTGAAAGCCGATCACGTCAC > NC_002947/1684489‑1684783 | ccGCGCCAATCCGATACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAgg > 2:50167/1‑149 (MQ=255) cgcgCCAATCCGATACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGt < 7:205530/149‑1 (MQ=255) cgaagaagctgtcgatgactacatcgagacttgcgaaaaactcggaagggaacctcagaaagcttactctggaaagctgagcctgcgtcttgaaccTGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAgg > 5:247853‑M1/97‑148 (MQ=255) cgcCAATCCGATACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTc < 8:365167/149‑1 (MQ=255) ccAATCCGATACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCaa < 2:110424/149‑1 (MQ=255) ccGATACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACg > 7:93048/1‑148 (MQ=255) cGATACCTGAGGCGGACTTGGGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCGGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCGTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCa < 8:351300/149‑1 (MQ=255) cGATACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCa < 8:173646/149‑1 (MQ=255) gATACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAg > 5:228128/1‑149 (MQ=255) aTACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGGTCGGCTTTAG‑‑AAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAgg > 8:81630/1‑149 (MQ=255) aTGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCt > 3:221895/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCa < 4:287115/149‑1 (MQ=255) aGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGc < 3:282384/148‑1 (MQ=255) gTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCt > 3:115060/1‑148 (MQ=255) tCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGATGGCGTGATGATCAGGTTCAAGACGCAGGCTTAGCtt > 8:209412/1‑148 (MQ=255) ggACTTGAGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTcc > 8:16446/1‑149 (MQ=255) gACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTccc < 5:295140/149‑1 (MQ=255) gACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTccc < 3:260813/149‑1 (MQ=255) 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aGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTccc > 2:7263/1‑135 (MQ=255) aGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCt < 4:115060/148‑1 (MQ=255) gCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGa < 3:8765/149‑1 (MQ=255) gccgCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGt > 7:83314/4‑149 (MQ=255) ccgCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGtt > 8:69133/3‑149 (MQ=255) cTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGtt > 4:68056/1‑149 (MQ=255) gCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTcc > 2:78786/1‑149 (MQ=255) cATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTccc < 8:93048/149‑1 (MQ=255) cAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTc < 7:16446/148‑1 (MQ=255) cAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTc < 4:221895/148‑1 (MQ=255) gCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGa < 6:228128/149‑1 (MQ=255) tGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGt > 5:313657/1‑149 (MQ=255) aaTGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGttt > 6:367109/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTc < 1:50167/148‑1 (MQ=255) ggCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCg > 4:241580/1‑148 (MQ=255) 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< 4:35869/115‑1 (MQ=255) gCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGt > 3:35869/1‑115 (MQ=255) gCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAg < 7:69133/149‑1 (MQ=255) ttCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCAc < 3:241580/149‑1 (MQ=255) tCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACt > 2:198410/1‑149 (MQ=255) cTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACtgatt < 7:81630/149‑1 (MQ=255) tttAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACtgatt > 4:239994/1‑148 (MQ=255) ttAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGc > 3:348710/1‑116 (MQ=255) ttAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGc < 4:348710/116‑1 (MQ=255) ctaaagccgaactggcggaaaagagcaGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACtgattga < 8:357968‑M2/122‑1 (MQ=255) g‑‑cagcCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGGTTCTTCGAATGCGGGCCGGAGCGCGCGGCTTGATTc > 6:269582/1‑149 (MQ=255) g‑‑cagcCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTgattgatt < 2:94164/148‑1 (MQ=255) cagcCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCa > 2:5589/1‑149 (MQ=255) gcCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCAcc < 1:198410/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCAc > 3:184116/1‑144 (MQ=255) cGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCAc < 4:184116/144‑1 (MQ=255) gCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCACCGTGAAAGcc < 8:214663/149‑1 (MQ=255) gAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCACCGTGAAAGCCGAt > 1:167061/1‑148 (MQ=255) aagagcaGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCACCGTGAAAGCCGAtc < 2:325510‑M2/141‑1 (MQ=255) aagagcaGGTTCAAGACGCAGCCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCACCGTGAAAGCCGAtc < 4:92000‑M2/141‑1 (MQ=255) agcaGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCACCGTGAAAGCCGAtcacgt > 6:209698‑M2/5‑149 (MQ=255) aGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTGCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCACCGTGAAAGCCGAtcacgtcac < 7:335890‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCGCGCCAATCCGATACATGAGTCGGACTTGCGGGATTAAGCTACTGCATTCAGCTGAATGCGGCCTGGCTGAGGATGTCACTTACCCATTGGTTAATGCTCTTTTCCGCCAGTTCGGCTTTAG‑‑CAGCCACGCTGGCGTGAAGAGCAGGTTCAAGACGCAGGCTCAGCTTTCCCGAGTAAGCTTTCTGAGGTTCCCTTCCGAGTTTTTCGCAAGTCTCGATGTAGTCATCGACAGCTTCTTCGAATGCTCGACGGAGCTCACTGATTGATTCACCGTGAAAGCCGATCACGTCAC > NC_002947/1684489‑1684783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |