New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1856923 | 57 (0.920) | 6 (0.100) | 6/250 | NT | 10.4% | coding (102/2259 nt) | PP_1661 | dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1856949 | 50 (0.860) | coding (128/2259 nt) | PP_1661 | dehydrogenase |
GCCAAGGAAGGGCAGCAGCCATGAGCAATGTACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGCAGTTCGCGCCACGGGCGACCATCCAGGACCTGAT > NC_002947/1856802‑1857096 | gCCAAGGAAGGGCAGCAGCCATGAGCAATGTACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGc < 8:153121‑M2/149‑2 (MQ=255) aaggaaggGCAGCAGCCATGAGCAATGTACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGcccg < 7:175747‑M2/149‑5 (MQ=255) ggaaggGCAGCATCCATGAGCAATGTACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGcccggc > 3:355491‑M2/1‑143 (MQ=255) ggaaggGCAGCAGCCATGAGCAATGTACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGcccggc < 6:9628‑M2/149‑7 (MQ=255) agcagcCATGAGCAATGTACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCAc < 5:142575/149‑1 (MQ=255) cATGAGCAATGTACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATc < 8:258437/149‑1 (MQ=255) aGCAATGTACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGTCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCTAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAg < 6:181080/149‑1 (MQ=255) tACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTAc > 1:248016/1‑149 (MQ=255) aaaCCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTg > 5:547/1‑149 (MQ=255) cccAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAg < 5:9628/149‑1 (MQ=255) ccAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAgc > 3:80822/1‑149 (MQ=255) ccAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGATCGAAACGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAgc > 7:187500/1‑149 (MQ=255) aCATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTc > 4:181290/1‑149 (MQ=255) tCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTac < 2:248016/149‑1 (MQ=255) tCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTa > 7:282708/1‑148 (MQ=255) gAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTacac > 2:118843/1‑149 (MQ=255) gAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTacac < 4:134390/149‑1 (MQ=255) gAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCAAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTaca < 5:109948/148‑1 (MQ=255) gccgATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGt < 7:153121/149‑1 (MQ=255) ccgATGTGTTCGTGGTGGGCGCCGGGATGGCAGGCAGTGTCATTGACTACGAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGATTCGGTCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACGTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTg < 8:358557/149‑1 (MQ=255) aTGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTc < 7:181761/149‑1 (MQ=255) tgATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAg > 5:50391/1‑149 (MQ=255) tgATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAg < 5:330439/149‑1 (MQ=255) gATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAgg > 1:20588/1‑149 (MQ=255) gtggGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGa < 1:45323/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCt > 5:271064/1‑121 (MQ=255) ggCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCt < 6:271064/121‑1 (MQ=255) gcCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGcc > 5:148203/1‑149 (MQ=255) cGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCg > 8:42788/1‑148 (MQ=255) cATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTAcc < 4:80822/149‑1 (MQ=255) cATGGCCGGAAGTGTCATGGACTTCCAGTTGGTCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTTCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTAcc < 8:187500/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTAccc < 6:547/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCg < 8:135582/92‑1 (MQ=255) ggCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCg > 7:135582/1‑92 (MQ=255) tgtCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTa < 3:204994/102‑1 (MQ=255) tCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAgagc < 2:163395/149‑1 (MQ=255) tCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAgagc < 8:282708/149‑1 (MQ=255) tCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAgagc < 1:118843/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGTAgagc > 1:58116/1‑147 (MQ=255) aCCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCCGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGAcc > 8:127231/1‑149 (MQ=255) gttggCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCAGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGc < 8:175747/146‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACg > 2:14087/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGc < 5:36394/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGc < 3:245734/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGcccggccaggcccaactggtaggccatgacactgccggccatgccggcgcccaccacgatcacatcggcggtttcgatgttctgg > 7:185116‑M2/1‑35 (MQ=255) cTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGcccggccaggcccaactggtaggccatgacactgccggccatgccggcgcccaccacgatcacatcggcggtttcgatgttctgg < 8:185116‑M2/120‑86 (MQ=255) cTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGCa < 2:24725/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGCa > 7:196200/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGcccggccaggcccaactggtaggccatgacactgccggccatgccggcgcccaccacgatcacatcggcggtttcgatgttctgggtttgtacattgctcatggctgctgccctt < 8:100150‑M2/149‑116 (MQ=255) ggCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGcccggccaggcccaactggtaggccatgacactgccggccatgccggcgcccaccacga < 8:271290‑M2/92‑60 (MQ=255) ggCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGcccggccaggcccaactggtaggccatgacactgccggccatgccggcgcccaccacga > 7:271290‑M2/1‑33 (MQ=255) cGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGCa > 5:288732/1‑144 (MQ=255) cGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGCa < 6:288732/144‑1 (MQ=255) gTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGc < 7:318893/101‑1 (MQ=255) gTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGc > 8:318893/1‑101 (MQ=255) cTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAgagcga > 1:337576/1‑113 (MQ=255) cTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAgagcga < 2:337576/113‑1 (MQ=255) cTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGCAGTTCGCGCCACGGGCGa < 7:42788/148‑1 (MQ=255) tCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGCAGTTCGCGCCACGGGCGACCATCCAg > 2:356639/1‑149 (MQ=255) gAATCGGGcccggccaggcccaactggtaggccatgacactgccggccatgccggcgcccaccacgatcacatcggcggtttcgatgttctgggtttgtacattgctcatggctgctgcccttccttggcgtcgacaccggtgaattgc > 7:100150‑M2/1‑8 (MQ=255) gCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGCAGTTCGCGCCACGGGCGACCATCCAGGACCTGAt > 1:86791/1‑148 (MQ=255) | GCCAAGGAAGGGCAGCAGCCATGAGCAATGTACAAACCCAGAACATCGAAACCGCCGATGTGATCGTGGTGGGCGCCGGCATGGCCGGCAGTGTCATGGCCTACCAGTTGGGCCTGGCCGGGTTGAAAGTGCTGGTGCTCGAATCGGGCCCGGCCATTCCACCGAATCGCAGCGAGTACCTGGAGCGCTTCTACACCGCGGTGCTCAAGGCGCCCGAGTCGCCGTACCCACCTGAGCAGAGCGAGCAGACCCCGGCCACGCAGTTCGCGCCACGGGCGACCATCCAGGACCTGAT > NC_002947/1856802‑1857096 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |