New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1947103 = | 45 (0.730) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 9.2% | coding (637/1185 nt) | PP_1748 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1947144 = | 37 (0.640) | coding (596/1185 nt) | PP_1748 | hypothetical protein |
GCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATC > NC_002947/1946997‑1947289 | gcgtgagcattggtgatttcgtggccttcgacccattgcccgagttcaccgaacgcggccacatcagcgcccgtcacctggacgacaaggctggcgtagcggcattGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCaa > 4:218283‑M1/107‑149 (MQ=255) cGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAAt < 6:382259/149‑1 (MQ=255) gATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATg > 6:181632/1‑149 (MQ=255) aTGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGACTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGc > 6:47002/1‑149 (MQ=255) gtgatttcgtggccttcgacccattgcccgagttcaccgaaagcggccacatcagcgcccgtcacctggacgacaaggctggcgtagcggcattGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCa < 1:56223‑M1/42‑1 (MQ=255) gtgatttcgtggccttcgacccattgcccgagttcaccgaaagcggccacatcagcgcccgtcacctggacgacaaggctggcgtagcggcattGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCa > 2:56223‑M1/95‑136 (MQ=255) ccGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGc < 6:67315/148‑1 (MQ=255) aaCTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCtt < 1:312422/149‑1 (MQ=255) cccAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGa > 6:169261/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGAc > 8:17766/1‑149 (MQ=255) gggcagggcGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACggg > 8:92933/1‑149 (MQ=255) gcagggcGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTg < 5:241457/142‑1 (MQ=255) gcagggcGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTg > 6:241457/1‑142 (MQ=255) cagggcGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGgcgc > 2:339342/1‑149 (MQ=255) agggcGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCt < 3:49405/149‑1 (MQ=255) agggcGCCGGCTGCACCCGAGCAGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCt < 2:317603/149‑1 (MQ=255) cGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGgcgc < 6:372475/141‑1 (MQ=255) cGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGgcgc > 5:372475/1‑141 (MQ=255) tGCACCCGAGCCGGGCTCCGCGGTGATGGGGAACAGCGGGGGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCGGATGTGGCCGc < 2:372739/149‑1 (MQ=255) aCCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCttt < 5:181632/149‑1 (MQ=255) cccGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTc > 1:47339/1‑149 (MQ=255) gAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGt < 1:339342/149‑1 (MQ=255) ggTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACt > 3:91088/1‑149 (MQ=255) gTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTc > 5:16073/1‑149 (MQ=255) gTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCa > 6:240035/1‑97 (MQ=255) gTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCa < 5:240035/97‑1 (MQ=255) gTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGat > 1:139606/1‑148 (MQ=255) gAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGc < 8:305489/119‑1 (MQ=255) gAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGc > 7:305489/1‑119 (MQ=255) cGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGCGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCg < 2:719/118‑1 (MQ=255) cGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGAGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCg > 1:719/1‑118 (MQ=255) cAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCAc > 4:251034/1‑148 (MQ=255) aGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCAcc > 2:3970/1‑148 (MQ=255) gTCGATCAGCGGCTTGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGGTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCaa < 5:47002/149‑1 (MQ=255) tCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCt > 2:138054/1‑148 (MQ=255) cAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCACTGCTCa > 5:260132/1‑149 (MQ=255) ttgctggcggcactgaaggctgtggtggaaagcggccgccagcAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCGTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGc > 4:218283‑M2/44‑149 (MQ=255) tgctggcggcactgaaggctgtggtggaaagcggccgccagcAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCAc < 1:56223‑M2/94‑1 (MQ=255) tgctggcggcactgaaggctgtggtggaaagcggccgccagcAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCAc > 2:56223‑M2/43‑136 (MQ=255) ggCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGcc > 2:377778/1‑149 (MQ=255) tggcggcactgaaggctgtggtggaaagcggccgccagcAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAg > 3:314250‑M2/40‑149 (MQ=255) TGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATggg < 6:170818‑M1/114‑1 (MQ=255) TGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATggg > 5:170818‑M1/1‑114 (MQ=255) CGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGc > 7:17766‑M1/1‑149 (MQ=255) aGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGGCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGcc > 8:16456‑M1/2‑149 (MQ=255) tttCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAg > 3:330627/1‑149 (MQ=255) tCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCTGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGt > 7:241453/1‑148 (MQ=255) caccacAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGaa < 6:263059/105‑1 (MQ=255) accacACCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGCGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAgc > 2:143296/1‑149 (MQ=255) cacaGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCATGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAgcgc > 5:329293/1‑149 (MQ=255) cacaGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAgcgc > 5:253851/1‑149 (MQ=255) gTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAg < 1:138054/149‑1 (MQ=255) gccgccagcAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCGTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTa < 3:218283‑M2/140‑1 (MQ=255) ccgccagcAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTa < 7:92933‑M2/140‑1 (MQ=255) ccgccagcAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAg < 4:330627‑M2/141‑1 (MQ=255) gccagcAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCAGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAgg > 4:195605‑M2/7‑148 (MQ=255) cAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATc > 3:126422‑M2/2‑147 (MQ=255) cAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATc > 5:247645‑M2/2‑147 (MQ=255) | GCGATGTCGATGCCGACGAACTCGCTGACGTCCCAGGGCAGGGCGCCGGCTGCACCCGAGCCGGTCTCCTCGGTGATGGTGAACAGCGGGTGGCAGTCGATCAGCGGCTGGCGGCCGCTTTCCACCACAGCCTTCAGTGCCGCCAGCAATGCCGCTACGCCAGCCTTGTCGTCCAGGTGACGGGCGCTGATGTGGCCGCTTTCGGTGAACTCGGGCAATGGGTCGAAGGCCACGAAATCACCAATGCTCACGCCCAGTGCCTCACAGTCAGCGCGCGTGGCGCAGTAGGCATC > NC_002947/1946997‑1947289 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |