New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2295798 | 46 (0.740) | 5 (0.100) | 5/218 | NT | 12.0% | intergenic (+44/+89) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | = 2295835 | 36 (0.710) | intergenic (+81/+52) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
ACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTG > NC_002947/2295687‑2295979 | acacCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGc > 2:294250/1‑149 (MQ=255) acCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCAGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCtt < 5:200020‑M2/149‑3 (MQ=255) ccGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCt < 3:316720‑M2/147‑2 (MQ=255) cGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCCTCCACCGCGGTGCCCGCtacg < 4:248368‑M2/149‑5 (MQ=255) cGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcg < 6:378694‑M2/149‑5 (MQ=255) aGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcg > 6:149935‑M2/1‑143 (MQ=255) gCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgg > 4:109094‑M2/1‑142 (MQ=255) ccTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgc < 1:20686‑M2/149‑14 (MQ=255) ccTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatg > 8:182538‑M2/1‑136 (MQ=255) cTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGGGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcc > 5:333391‑M2/1‑135 (MQ=255) tGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCCTCCACCGCGGTGCCCGCatcgcgggccagccc < 4:345755‑M2/149‑16 (MQ=255) tGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgccc < 3:76435‑M2/149‑16 (MQ=255) gcgcCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccg < 8:11788‑M2/149‑17 (MQ=255) ctgagcgCGAATTTCCTTGCGGCCCTGCGTGGCATGCACCACGACTGATGTGGGTTGTGGGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCGGGCGAACACCGGCAGAGCCTGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctgg > 2:161241‑M2/3‑129 (MQ=255) cAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcc > 4:76435‑M2/1‑129 (MQ=255) agagCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctccc < 2:80183‑M2/149‑22 (MQ=255) agagCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcc < 2:74833‑M2/148‑21 (MQ=255) agagCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcggg > 3:118258‑M2/1‑128 (MQ=255) gagCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctccca > 8:12607‑M2/1‑127 (MQ=255) gcgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccac > 6:372196‑M2/1‑125 (MQ=255) cgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCacac < 2:317735/149‑1 (MQ=255) ccAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATACCCGCTCCCACACg > 8:287448/1‑148 (MQ=255) tCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGGGAGGGCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCGCCCACACGGACCCa < 7:63438/148‑1 (MQ=255) cGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAg < 7:11788/149‑1 (MQ=255) ctgcggggCAAGCACCACCACTGATCTGGCTGGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGa < 7:77682/143‑1 (MQ=255) tgTGGCAACCACCCCCCCTGACCGGGCTTGGGTGTGGCCCTGGGGGTCGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGAATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAt < 4:26305/146‑1 (MQ=21) cAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATACCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAAt < 7:287448/149‑1 (MQ=255) aGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCa < 3:326984/149‑1 (MQ=255) gCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGTGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCCGGACCCATGTGCACCCCGAGGTTTAATCAg > 8:288808/1‑149 (MQ=255) ccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGGCCTTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggc > 3:326399‑M2/1‑88 (MQ=255) acTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCAt < 2:20686/149‑1 (MQ=255) tGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGAAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCCCTCCCACACCGACCCAAGTGCAGCCCGATGTATAATCAGCGGACCATGa > 1:46914/1‑149 (MQ=37) aTCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGAtt > 2:300129/1‑149 (MQ=255) tGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCGCCCCCACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGcc > 5:138148/1‑149 (MQ=255) gtgtgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGa‑a < 1:294250/148‑1 (MQ=255) tgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCGCCCACACGGCCCCATGTGCCGCCCGATGTTTAATCCGCGGCCCAGGATTGCCGTGA‑ACAGc > 4:319893/1‑149 (MQ=25) gAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCt > 6:123832/1‑149 (MQ=255) gTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTcc > 7:200363/1‑148 (MQ=255) gtgGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAagc > 4:230983/1‑147 (MQ=255) ggAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTAGCGGGCATGCCCGCTCCCCCACGGCCCCATGAGCAGCCCGATGTTTTATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAaggcagcc > 3:170791/1‑149 (MQ=37) aGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGCCCATGATTGCCGTGA‑ACAGCGCCGAcgccagcccc > 8:330176/1‑147 (MQ=255) aTGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTcca > 7:200827/1‑149 (MQ=255) aTGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCCCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctacccacagcccgataagtggtggggcttgccacgcagggccgcatggaaattgggggtctggcgcaggtc < 4:122586‑M2/149‑102 (MQ=255) cccGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGCCCCTCTTCGGGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagc < 3:345755/148‑1 (MQ=38) cccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtg < 2:122992‑M2/95‑51 (MQ=255) cccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtg > 1:122992‑M2/1‑45 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattg > 3:227736‑M2/1‑44 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagc > 7:238130/1‑147 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCCGGCATGACCGCTCCCACACGGACCCATGTGGAGCCCGATGTTTTATAAGCGGACCATGAATGCCTTGA‑ACAGCTCCCAAGCCAGCCACCCCAccagcca > 6:225165/1‑149 (MQ=37) gCAGAGCCGGTGCAATCCACCGCGGTGCCCGATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAcg < 5:26135/149‑1 (MQ=255) cAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAcgc < 4:316720/149‑1 (MQ=255) agagCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGACACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAcgc < 1:80183/149‑1 (MQ=255) agagCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGACACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAcgc < 1:74833/149‑1 (MQ=255) tagtcGGTGCAATCCACCGCGGTGCCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAcgcg < 7:170819/144‑1 (MQ=255) gCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGAt < 7:288808/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCttcgcgggcatgcccgctcccacaaggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattggcgctctggcgcaggtactgctcggtgtagctgtgggtg > 3:122586‑M2/1‑26 (MQ=255) ggTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAg < 3:248368/149‑1 (MQ=255) tGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAgcc < 5:378694/149‑1 (MQ=255) ccATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGGTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAgccgc < 6:138148/149‑1 (MQ=255) cACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCgg < 7:330176/149‑1 (MQ=255) cACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCgg < 5:225165/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCg > 7:220072/1‑148 (MQ=255) cgGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAAc < 3:319893/149‑1 (MQ=255) catGCCCGCGAAGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTACGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAGCCGCTAAACCCGCCACGGCGAAc > 6:346592/3‑148 (MQ=255) cccGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTg < 6:200020/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGa‑a > 7:29041/1‑78 (MQ=255) cGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGa‑a < 8:29041/78‑1 (MQ=255) | ACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGA‑ACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTG > NC_002947/2295687‑2295979 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |