| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3311167 = | 57 (0.920) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 5.3% | coding (881/1392 nt) | gabP‑III | gamma‑aminobutyrate permease |
| ? | NC_002947 | 3311203 = | 52 (0.870) | coding (917/1392 nt) | gabP‑III | gamma‑aminobutyrate permease | |||||
GGTACCGTGGACCGACCCACGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGCCAACTACCTGGTGCCGG > NC_002947/3311057‑3311349 | ggTACCGTGGACCGACCCACGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGcc < 7:116213/148‑1 (MQ=255) gccccagtcgacaacaagactgccaccacgggtgtaccactgcggctggttatctgggcacaggccggggcatcaccccggcggctaagcgaatagaccatgcgcgaggCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑Tc > 5:350769‑M1/110‑149 (MQ=255) cGTGGACCGACCCACGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑Tcgcg > 6:375290/1‑148 (MQ=255) accgaccCACGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGCGCCAAATGCCAAGCCCCTCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGt < 1:316478/149‑1 (MQ=255) ccgaccCACGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTc < 3:89514/149‑1 (MQ=255) cgaccCACGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTc > 1:347467/1‑148 (MQ=255) cccACGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTAtt > 3:316386/1‑149 (MQ=255) ccACGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCCCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTc < 2:314018/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGc > 7:231615/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCtt < 4:197389/149‑1 (MQ=255) cTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTGGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAg < 5:331823/149‑1 (MQ=255) gCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAg‑‑ccg > 3:226660/1‑149 (MQ=255) acgggtgtaccactgcggctggttatctgggcacaggccggggcatcaccccggcggctaagcgaatagaccatgcgcgaggCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑Tcgc > 4:266488‑M1/83‑124 (MQ=255) acgggtgtaccactgcggctggttatctgggcacaggccggggcatcaccccggcggctaagcgaatagaccatgcgcgaggCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑Tcgc < 3:266488‑M1/42‑1 (MQ=255) tctTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGc > 2:58815/1‑149 (MQ=255) tCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGcc > 1:329/1‑149 (MQ=255) aCGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCtg > 2:366545/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCtgt < 3:2304/149‑1 (MQ=255) tGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGcc > 8:127117/1‑149 (MQ=255) cTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGccc < 6:55537/148‑1 (MQ=255) cTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCa < 4:226660/149‑1 (MQ=255) tGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGcc > 1:57504/1‑146 (MQ=255) ggACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGcc > 7:129036/1‑145 (MQ=255) gACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAg < 6:232518/147‑1 (MQ=255) acCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAAc < 4:316386/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGTGGCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAAc > 1:75005/1‑148 (MQ=255) ccTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAAc > 1:144142/1‑147 (MQ=255) cTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAg < 8:231615/149‑1 (MQ=255) gCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCggg > 2:265448/1‑114 (MQ=255) gCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCggg < 1:265448/114‑1 (MQ=255) gCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCg > 7:148821/1‑148 (MQ=255) ccAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTgg < 4:54183/149‑1 (MQ=255) ccAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTgg < 2:329/149‑1 (MQ=255) aaaTGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTa > 8:236260/1‑149 (MQ=255) aaTGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGt < 7:194538/108‑1 (MQ=255) aaTGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGt > 8:194538/1‑108 (MQ=255) ccAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGt > 2:119481/1‑140 (MQ=255) ccAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGt < 1:119481/140‑1 (MQ=255) aGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCCATAGGGCATGTTATATTAGCTTAG‑‑AACCCCGGGTGATACCCCGGCCTCTGGCCACATATACAGCGGCAGAGCTAAAcccca > 1:315919/1‑147 (MQ=255) gCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAGCCCCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCgtg < 1:112039/149‑1 (MQ=255) ccATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCgtggtg < 8:129036/149‑1 (MQ=255) catcatCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGCCCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCCGGGTGCTGCCCTGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGtggtgg > 1:296363/1‑149 (MQ=255) catcatCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTacac < 1:104731/140‑1 (MQ=255) catcatCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTacac > 2:104731/1‑140 (MQ=255) atcatcGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGtggtgg > 1:231744/1‑148 (MQ=255) aCTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCttg > 2:361795/1‑149 (MQ=255) cTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATACCCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCttgt > 6:153188/1‑149 (MQ=255) gt‑gCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGAc > 7:62349/1‑149 (MQ=255) cTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTg < 2:144142/148‑1 (MQ=255) gcgaggcggtgtacagcgacgagttgaggcagctggtcaccgCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCgt > 4:266488‑M2/43‑124 (MQ=255) gcgaggcggtgtacagcgacgagttgaggcagctggtcaccgCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCgt < 3:266488‑M2/82‑1 (MQ=255) gaggcggtgtacagcgacgagttgaggcagctggtcaccgCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGc > 5:350769‑M2/41‑149 (MQ=255) GGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCAt < 5:248796‑M1/149‑1 (MQ=255) TGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTc < 3:299154‑M1/149‑1 (MQ=255) cTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCAGGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCgg < 8:148821/149‑1 (MQ=255) ccTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGa < 8:62349/149‑1 (MQ=255) aaCTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCg < 5:375290/148‑1 (MQ=255) aaCTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGc < 6:248796/149‑1 (MQ=255) gtcgCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGCCAAc > 4:301018/1‑148 (MQ=255) gtcgCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGCCAAc > 4:89600/1‑148 (MQ=255) gCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGCCAACTAc < 1:58815/148‑1 (MQ=255) cTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGCCAACTACCt > 1:156842/1‑149 (MQ=255) tACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGCCAACTACCTg < 4:299154/147‑1 (MQ=255) accgCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGCCAACTACCTGGTGcc < 7:127117‑M2/145‑1 (MQ=255) cgCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGCCAACTACCTGGTGCCgg < 1:361795‑M2/147‑1 (MQ=255) | GGTACCGTGGACCGACCCACGCCTGGCGACCGAAGGCTCTTATGTCACGGTGCTGGACACCCTCGGCGTGCCAAATGCCAAGGCCATCATCGACTTCGTGGT‑GCTGACGTCGGTGACCAGCTGCCTCAACTCGTCGCTGTACACCGCC‑TCGCGCATGGTCTATTCGCTTAG‑‑CCGCCGGGGTGATGCCCCGGCCTGTGCCCAGATAACCAGCCGCAGTGGTACACCCGTGGTGGCAGTCTTGTTGTCGACTGGGGCTGCATTCCTGGCGGTGATCGCCAACTACCTGGTGCCGG > NC_002947/3311057‑3311349 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |