New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3628934 | 48 (0.770) | 3 (0.050) | 3/258 | NT | 6.2% | coding (724/1125 nt) | PP_3199 | monooxygenase |
? | NC_002947 | = 3628963 | 44 (0.730) | coding (753/1125 nt) | PP_3199 | monooxygenase |
CTCTGGCAACGCGGGGCTGGTTCCGCTGGCCGATGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGG > NC_002947/3628819‑3629110 | ctctGGCAACGCGGGGCTGGTTCCGCTGGCCGATGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCggcg > 4:103736‑M2/1‑145 (MQ=255) ctctGGCAACGCGGGGCTGGTTCCGCTGGCCGATGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCggc < 7:46370‑M2/148‑4 (MQ=255) gCAACGCGGGGCTGGTTCGGCGGGCCGATGACCTGAGGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGaa < 1:39779/146‑1 (MQ=255) cgGGGCTGGTTCCGCTGGCAGATGACCTTATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATTGAACCGGCCGCTTTGTCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCTGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAg < 8:301068/149‑1 (MQ=255) gTTCCGCTGGCCGATGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCggc < 5:353503‑M2/129‑4 (MQ=255) gTTCCGCTGGCCGATGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCggc > 6:353503‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTCCGCTGGCCGATGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCggc < 3:95434‑M2/129‑4 (MQ=255) gTTCCGCTGGCCGATGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCggc > 4:95434‑M2/1‑126 (MQ=255) ttCCGCTGGCCGATGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGAtcgtc > 7:275371/1‑149 (MQ=255) aTGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCggg < 8:27635/149‑1 (MQ=255) aTGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGtt < 1:288385/147‑1 (MQ=255) tACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACaa < 2:343254/149‑1 (MQ=255) ccTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGt < 7:137924/141‑1 (MQ=255) ccTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGt > 8:137924/1‑141 (MQ=255) tctTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACGGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCg > 1:74355/1‑149 (MQ=255) accaccTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTg > 2:76168/1‑148 (MQ=255) accaccTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTg > 7:55248/1‑148 (MQ=255) caccTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTg > 6:98083/1‑146 (MQ=255) caccTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGaa < 5:98083/148‑1 (MQ=255) caccTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAg > 6:310538/1‑149 (MQ=255) ccACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGgtgt > 6:319400/1‑149 (MQ=255) gAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGt < 6:49513/149‑1 (MQ=255) aGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTc > 4:37647/1‑149 (MQ=255) cAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAAc < 1:293970/149‑1 (MQ=255) cAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGGTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAAc > 2:266827/1‑149 (MQ=255) cTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTgg > 1:22165/1‑148 (MQ=255) aaCCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGt > 7:173669/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTc > 4:194906/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTc < 5:81992/149‑1 (MQ=255) ccGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTcgacg > 7:200768/1‑130 (MQ=255) ccGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTcgacg < 8:200768/130‑1 (MQ=255) tttGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGtgctgc > 8:45140/1‑149 (MQ=255) tGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGtgctgc < 3:295717/147‑1 (MQ=255) gCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTg > 4:298371/1‑125 (MQ=255) gCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTg < 3:298371/125‑1 (MQ=255) tGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCggcggaggccatcagccaaagcggcaggttccatccaggtgttgcccggctcgtgggaggtggtgaagaggtacatcaggtcatcggccagcggaaccagccccgc < 4:215041‑M2/149‑107 (MQ=255) tGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCTCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGtg > 8:202915/1‑139 (MQ=255) tGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCTCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGtg < 7:202915/139‑1 (MQ=255) tGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCg > 5:196422/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCgg < 8:173669/148‑1 (MQ=255) aTGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCgg < 5:142547/148‑1 (MQ=255) tGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCggg < 7:97123/148‑1 (MQ=255) gCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCggcggaggccatcagccaaagcggccggttccatccaggggttgcccggctcgtgggaggtggtgaagaggtacatcaggtcatcggccagcggaaccagccccgcgtt < 4:109747‑M2/147‑110 (MQ=255) gCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCggcggaggccatcagccaaagcggccggttccatccaggggttgcccggctcgtgggaggtggtgaagaggtacatcaggtcatcggccagcggaaccagccccgcgtt > 3:109747‑M2/1‑38 (MQ=255) cTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGtgctgc < 8:232715/136‑1 (MQ=255) cTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGtgctgc > 7:232715/1‑136 (MQ=255) gCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATgccgcc > 1:171121/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATgccgcc > 7:333439/1‑148 (MQ=255) cAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCATCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCa > 3:27985/1‑149 (MQ=255) ccGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGccacca > 6:283590/1‑147 (MQ=255) ccGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGccacca < 5:283590/147‑1 (MQ=255) cGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGc > 3:89411/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGcc < 3:37647/149‑1 (MQ=255) ggCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGcc > 1:248234/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTggggcaggg > 8:69937/1‑149 (MQ=255) tCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCCACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTggggcagggg < 1:123925/149‑1 (MQ=255) | CTCTGGCAACGCGGGGCTGGTTCCGCTGGCCGATGACCTGATGTACCTCTTCACCACCTCCCACGAGCCGGGCAACCCCTGGATGGAACCGGCCGCTTTGGCTGATGGCCTCCGCCAGCGGCTTGCCGGCTTCGGCGGGCTGATCGGCGAATTGCGCGAGCAGATCGTCGACAACGCCGGGGTCGTTTACAAGCCGCTTGAAGCGGTGTTTGTCGACGAACCCTGGTACTGCGGTCGAGTGCTGCTGATCGGGGATGCCGCCCATGCCACCACGCCACACCTGGGGCAGGGG > NC_002947/3628819‑3629110 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |